67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_1287 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010424  Daud_1287  CRISPR-associated Cas4 family protein  100 
 
 		 190 aa  390  1e-108  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.826986  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1765  CRISPR-associated protein Cas4  59.47 
 
 		 189 aa  223  1e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0565  CRISPR-associated protein Cas4  39.69 
 
 		 202 aa  149  4e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.234335  normal  0.250424 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1872  CRISPR-associated Cas4 family protein  39.38 
 
 		 198 aa  145  3e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5083  CRISPR-associated Cas4 family protein  40.96 
 
 		 197 aa  139  3.9999999999999997e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3305  CRISPR-associated Cas4 family protein  37.31 
 
 		 198 aa  131  5e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.143494  normal  0.352212 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6022  CRISPR-associated protein Cas4  31.61 
 
 		 195 aa  89  4e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.318812  normal  0.45154 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1859  CRISPR-associated Cas4 family protein  31.89 
 
 		 193 aa  81.3  0.000000000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.343722  normal  0.533704 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3220  CRISPR-associated Cas4 family protein  25.53 
 
 		 204 aa  77.8  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.680334  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1076  CRISPR-associated Cas4 family protein  28.65 
 
 		 197 aa  75.5  0.0000000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0163  hypothetical protein  26.06 
 
 		 197 aa  75.1  0.0000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1625  CRISPR-associated Cas1 family protein  29.51 
 
 		 544 aa  72.4  0.000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.575155  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0637  CRISPR-associated Cas4 family protein  25.91 
 
 		 191 aa  70.9  0.00000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.042721  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1558  CRISPR-associated Cas4 family protein  30.37 
 
 		 190 aa  69.7  0.00000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.681932  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15190  CRISPR-associated protein Cas4  26.94 
 
 		 198 aa  70.1  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3577  CRISPR-associated protein Cas4  29.19 
 
 		 190 aa  68.9  0.00000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2974  CRISPR-associated protein Cas1  30.81 
 
 		 545 aa  66.2  0.0000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0774  CRISPR-associated exonuclease Cas4 family protein  24.47 
 
 		 206 aa  65.1  0.0000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.356687  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0822  CRISPR-associated protein Cas4  26.74 
 
 		 206 aa  64.7  0.0000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1717  CRISPR-associated protein Cas4  24.73 
 
 		 200 aa  64.3  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    unclonable  2.73181e-25 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2652  CRISPR-associated protein Cas4  26.6 
 
 		 212 aa  64.3  0.0000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0303971  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1478  CRISPR-associated protein Cas4  28.87 
 
 		 218 aa  64.3  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.470243 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3906  CRISPR-associated Cas4 family protein  27.84 
 
 		 212 aa  63.5  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.164887  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3372  hypothetical protein  28.35 
 
 		 218 aa  61.6  0.000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1975  CRISPR-associated protein Cas4  26.74 
 
 		 255 aa  61.2  0.000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0652  CRISPR-associated Cas4 family protein  31.93 
 
 		 210 aa  60.8  0.00000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.915701  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1070  hypothetical protein  26.06 
 
 		 204 aa  60.8  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0265039 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0728  CRISPR-associated Cas4 family protein  30.89 
 
 		 172 aa  58.9  0.00000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31590  CRISPR-associated protein Cas4  25.13 
 
 		 199 aa  57.8  0.00000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0505  CRISPR-associated protein Cas4  24.19 
 
 		 196 aa  56.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0522  CRISPR-associated protein Cas4  24.19 
 
 		 196 aa  55.8  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00230563  hitchhiker  0.00000101589 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0227  CRISPR-associated Cas4 family protein  22.75 
 
 		 209 aa  56.2  0.0000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.279714  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3507  PE-PGRS family protein  26.88 
 
 		 190 aa  55.5  0.0000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.366327 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2233  CRISPR-associated Cas4 family protein  23.24 
 
 		 205 aa  53.9  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.874224  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0235  CRISPR-associated Cas4 family protein  28.12 
 
 		 211 aa  53.5  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1121  CRISPR-associated Cas4 family protein  28.96 
 
 		 190 aa  52.4  0.000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.00306765  normal  0.769752 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02697  crispr-associated protein Cas4  25.39 
 
 		 210 aa  51.6  0.000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.463213  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0494  CRISPR-associated exonuclease Cas4 family protein  31.36 
 
 		 214 aa  50.8  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2461  CRISPR-associated protein Cas4  24.06 
 
 		 196 aa  50.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.587961 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1155  CRISPR-associated Cas4 family protein  25.65 
 
 		 212 aa  50.1  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1632  CRISPR-associated protein Cas4  26.18 
 
 		 218 aa  50.1  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.98908 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0832  CRISPR-associated exonuclease Cas4 family protein  30.4 
 
 		 228 aa  50.1  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2974  CRISPR-associated Cas4 family protein  23.47 
 
 		 212 aa  50.1  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.948346  n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4560  CRISPR-associated protein Cas4  27.12 
 
 		 194 aa  50.1  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1142  CRISPR-associated Cas4 family protein  21.58 
 
 		 190 aa  48.5  0.00005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.142818  hitchhiker  0.00000342837 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2723  CRISPR-associated Cas4 family protein  24.86 
 
 		 208 aa  48.5  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1006  hypothetical protein  27.08 
 
 		 215 aa  48.1  0.00007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0356084  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1277  CRISPR-associated exonuclease Cas4 family protein  24.86 
 
 		 189 aa  47.4  0.0001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0341356 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1937  hypothetical protein  28.33 
 
 		 216 aa  45.8  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.370637  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2837  CRISPR-associated protein Cas4  26.13 
 
 		 186 aa  45.8  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.679978  normal  1 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2913  CRISPR-associated protein Cas1  24.08 
 
 		 553 aa  45.8  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0184071  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1502  hypothetical protein  29.07 
 
 		 102 aa  45.4  0.0005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.314393 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1432  CRISPR-associated Cas4 family protein  27.51 
 
 		 214 aa  45.4  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.343364  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0536  protein of unknown function DUF83  27.33 
 
 		 170 aa  45.4  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0513907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1000  hypothetical protein  31.58 
 
 		 172 aa  45.1  0.0006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0455  DNA replication factor Dna2  28.1 
 
 		 902 aa  45.1  0.0007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1299  hypothetical protein  24.87 
 
 		 214 aa  45.1  0.0007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.938866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2111  DNA replication factor Dna2  29.66 
 
 		 934 aa  44.3  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2343  hypothetical protein  21.74 
 
 		 333 aa  44.3  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1059  helicase  28 
 
 		 986 aa  44.7  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4175  hypothetical protein  24.58 
 
 		 196 aa  43.5  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000176829 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03653  essential tripartite DNA replication factor with single-stranded DNA-dependent ATPase (Eurofung)  22.22 
 
 		 1048 aa  43.1  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4331  CRISPR-associated Cas4 family protein  25 
 
 		 222 aa  43.1  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000854832  normal  0.165932 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0936  CRISPR-associated protein Cas4  34.74 
 
 		 169 aa  42.7  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0438  hypothetical protein  27.97 
 
 		 220 aa  42.4  0.004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.503828  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2838  hypothetical protein  26.24 
 
 		 171 aa  42.7  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000529444  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0179  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  21.74 
 
 		 580 aa  41.2  0.008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>