32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1277 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009073  Pcal_1277  CRISPR-associated exonuclease Cas4 family protein  100 
 
 
189 aa  383  1e-105  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0341356 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1121  CRISPR-associated Cas4 family protein  68.95 
 
 
190 aa  237  6.999999999999999e-62  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.00306765  normal  0.769752 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1142  CRISPR-associated Cas4 family protein  54.21 
 
 
190 aa  179  2.9999999999999997e-44  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.142818  hitchhiker  0.00000342837 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0774  CRISPR-associated exonuclease Cas4 family protein  26.56 
 
 
206 aa  72.8  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.356687  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15190  CRISPR-associated protein Cas4  26.56 
 
 
198 aa  72  0.000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1287  CRISPR-associated Cas4 family protein  26.09 
 
 
190 aa  65.5  0.0000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.826986  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0227  CRISPR-associated Cas4 family protein  22.92 
 
 
209 aa  57.4  0.0000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.279714  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1975  CRISPR-associated protein Cas4  31.58 
 
 
255 aa  56.2  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1625  CRISPR-associated Cas1 family protein  27.37 
 
 
544 aa  56.2  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.575155  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3220  CRISPR-associated Cas4 family protein  23.96 
 
 
204 aa  54.7  0.0000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.680334  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0163  hypothetical protein  25.52 
 
 
197 aa  53.9  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1076  CRISPR-associated Cas4 family protein  23.16 
 
 
197 aa  53.5  0.000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1661  CRISPR-associated protein Cas4  22.95 
 
 
214 aa  50.8  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.975016  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0565  CRISPR-associated protein Cas4  24.35 
 
 
202 aa  50.4  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.234335  normal  0.250424 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0637  CRISPR-associated Cas4 family protein  24.21 
 
 
191 aa  48.9  0.00004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.042721  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4331  CRISPR-associated Cas4 family protein  29.37 
 
 
222 aa  48.5  0.00006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000854832  normal  0.165932 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6022  CRISPR-associated protein Cas4  22.92 
 
 
195 aa  47.8  0.00009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.318812  normal  0.45154 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2974  CRISPR-associated protein Cas1  25.14 
 
 
545 aa  46.6  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1558  CRISPR-associated Cas4 family protein  23.44 
 
 
190 aa  45.4  0.0005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.681932  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31590  CRISPR-associated protein Cas4  28.07 
 
 
199 aa  45.1  0.0006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1432  CRISPR-associated Cas4 family protein  22.95 
 
 
214 aa  44.7  0.0008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.343364  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1006  hypothetical protein  24.19 
 
 
215 aa  44.7  0.0009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0356084  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3906  CRISPR-associated Cas4 family protein  24.73 
 
 
212 aa  44.3  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.164887  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3507  PE-PGRS family protein  28.45 
 
 
190 aa  44.3  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.366327 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0728  CRISPR-associated Cas4 family protein  27.27 
 
 
172 aa  43.1  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1478  CRISPR-associated protein Cas4  26.67 
 
 
218 aa  43.5  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.470243 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1872  CRISPR-associated Cas4 family protein  26.6 
 
 
198 aa  43.1  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1299  hypothetical protein  23.04 
 
 
214 aa  43.1  0.003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.938866  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3523  CRISPR-associated exonuclease Cas4 family protein  30.25 
 
 
218 aa  42.4  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1765  CRISPR-associated protein Cas4  22.46 
 
 
189 aa  42  0.005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2270  CRISPR-associated protein Cas4  21.64 
 
 
201 aa  41.6  0.007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.160192  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1481  CRISPR-associated protein Cas4  23.39 
 
 
222 aa  41.2  0.009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>