30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_1142 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010525  Tneu_1142  CRISPR-associated Cas4 family protein  100 
 
 		 190 aa  388  1e-107  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.142818  hitchhiker  0.00000342837 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1121  CRISPR-associated Cas4 family protein  54.21 
 
 		 190 aa  193  1e-48  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.00306765  normal  0.769752 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1277  CRISPR-associated exonuclease Cas4 family protein  54.21 
 
 		 189 aa  184  6e-46  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0341356 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15190  CRISPR-associated protein Cas4  26.7 
 
 		 198 aa  68.9  0.00000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1076  CRISPR-associated Cas4 family protein  24.87 
 
 		 197 aa  66.6  0.0000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3220  CRISPR-associated Cas4 family protein  21.93 
 
 		 204 aa  65.5  0.0000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.680334  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0637  CRISPR-associated Cas4 family protein  26.46 
 
 		 191 aa  63.2  0.000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.042721  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0774  CRISPR-associated exonuclease Cas4 family protein  26.06 
 
 		 206 aa  62.4  0.000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.356687  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0227  CRISPR-associated Cas4 family protein  25 
 
 		 209 aa  61.2  0.000000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.279714  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1287  CRISPR-associated Cas4 family protein  22.11 
 
 		 190 aa  58.5  0.00000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.826986  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3577  CRISPR-associated protein Cas4  23.12 
 
 		 190 aa  55.1  0.0000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0546  CRISPR-associated exonuclease Cas4 family protein  24.04 
 
 		 213 aa  53.1  0.000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1625  CRISPR-associated Cas1 family protein  26.46 
 
 		 544 aa  52.8  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.575155  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1859  CRISPR-associated Cas4 family protein  23.33 
 
 		 193 aa  51.6  0.000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.343722  normal  0.533704 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1765  CRISPR-associated protein Cas4  21.74 
 
 		 189 aa  51.2  0.000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0565  CRISPR-associated protein Cas4  23.86 
 
 		 202 aa  50.1  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.234335  normal  0.250424 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6022  CRISPR-associated protein Cas4  23.04 
 
 		 195 aa  50.1  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.318812  normal  0.45154 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2291  CRISPR-associated protein Cas4  29.6 
 
 		 175 aa  49.7  0.00003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1722  CRISPR-associated Cas4 family protein  25.14 
 
 		 218 aa  47.8  0.00009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.523221 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1150  CRISPR-associated Cas4 family protein  23.6 
 
 		 171 aa  47  0.0002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.686649  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0740  CRISPR-associated Cas4 family protein  23.16 
 
 		 217 aa  46.2  0.0003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.593112  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0652  CRISPR-associated Cas4 family protein  23.73 
 
 		 210 aa  45.1  0.0007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.915701  n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4560  CRISPR-associated protein Cas4  23.37 
 
 		 194 aa  44.7  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0576  CRISPR-associated Cas4 family protein  30.51 
 
 		 180 aa  43.5  0.002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.252977  normal  0.0673929 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1558  CRISPR-associated Cas4 family protein  23.63 
 
 		 190 aa  43.5  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.681932  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0728  CRISPR-associated Cas4 family protein  28.7 
 
 		 172 aa  43.9  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03653  essential tripartite DNA replication factor with single-stranded DNA-dependent ATPase (Eurofung)  27.88 
 
 		 1048 aa  43.1  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1872  CRISPR-associated Cas4 family protein  23.28 
 
 		 198 aa  42  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0737  hypothetical protein  20.88 
 
 		 244 aa  41.6  0.008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.821766  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3305  CRISPR-associated Cas4 family protein  21.35 
 
 		 198 aa  41.2  0.009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.143494  normal  0.352212 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>