36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_1121 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_1121  CRISPR-associated Cas4 family protein  100 
 
 		 190 aa  384  1e-106  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.00306765  normal  0.769752 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1277  CRISPR-associated exonuclease Cas4 family protein  68.95 
 
 		 189 aa  233  1.0000000000000001e-60  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0341356 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1142  CRISPR-associated Cas4 family protein  54.21 
 
 		 190 aa  185  3e-46  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.142818  hitchhiker  0.00000342837 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15190  CRISPR-associated protein Cas4  27.23 
 
 		 198 aa  76.3  0.0000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1287  CRISPR-associated Cas4 family protein  28.96 
 
 		 190 aa  68.9  0.00000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.826986  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0774  CRISPR-associated exonuclease Cas4 family protein  24.87 
 
 		 206 aa  65.5  0.0000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.356687  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31590  CRISPR-associated protein Cas4  27.68 
 
 		 199 aa  63.5  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6022  CRISPR-associated protein Cas4  27.98 
 
 		 195 aa  60.8  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.318812  normal  0.45154 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1076  CRISPR-associated Cas4 family protein  24.87 
 
 		 197 aa  58.9  0.00000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0227  CRISPR-associated Cas4 family protein  24.35 
 
 		 209 aa  58.2  0.00000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.279714  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5083  CRISPR-associated Cas4 family protein  31.9 
 
 		 197 aa  55.1  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1765  CRISPR-associated protein Cas4  26.32 
 
 		 189 aa  55.1  0.0000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0637  CRISPR-associated Cas4 family protein  23.2 
 
 		 191 aa  53.9  0.000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.042721  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3220  CRISPR-associated Cas4 family protein  22.46 
 
 		 204 aa  53.9  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.680334  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1872  CRISPR-associated Cas4 family protein  27.84 
 
 		 198 aa  53.9  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3305  CRISPR-associated Cas4 family protein  28.49 
 
 		 198 aa  51.6  0.000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.143494  normal  0.352212 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1625  CRISPR-associated Cas1 family protein  25.88 
 
 		 544 aa  51.2  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.575155  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1937  hypothetical protein  33.1 
 
 		 216 aa  50.8  0.00001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.370637  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1975  CRISPR-associated protein Cas4  31.58 
 
 		 255 aa  50.4  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4331  CRISPR-associated Cas4 family protein  31.5 
 
 		 222 aa  50.4  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000854832  normal  0.165932 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0565  CRISPR-associated protein Cas4  24.19 
 
 		 202 aa  50.1  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.234335  normal  0.250424 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0822  CRISPR-associated protein Cas4  32.93 
 
 		 206 aa  49.7  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0652  CRISPR-associated Cas4 family protein  30.43 
 
 		 210 aa  48.9  0.00005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.915701  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02697  crispr-associated protein Cas4  26.4 
 
 		 210 aa  47.4  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.463213  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3577  CRISPR-associated protein Cas4  25.68 
 
 		 190 aa  47  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1006  hypothetical protein  25.13 
 
 		 215 aa  45.8  0.0004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0356084  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2913  CRISPR-associated protein Cas1  22.53 
 
 		 553 aa  45.4  0.0005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0184071  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0576  CRISPR-associated Cas4 family protein  29.51 
 
 		 180 aa  43.9  0.001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.252977  normal  0.0673929 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1859  CRISPR-associated Cas4 family protein  24.31 
 
 		 193 aa  43.9  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.343722  normal  0.533704 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0737  hypothetical protein  27.72 
 
 		 244 aa  43.5  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.821766  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0546  CRISPR-associated exonuclease Cas4 family protein  25.42 
 
 		 213 aa  42.7  0.004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0728  CRISPR-associated Cas4 family protein  29.01 
 
 		 172 aa  41.6  0.006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1558  CRISPR-associated Cas4 family protein  22.87 
 
 		 190 aa  42  0.006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.681932  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2974  CRISPR-associated protein Cas1  25.6 
 
 		 545 aa  41.6  0.007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1155  CRISPR-associated Cas4 family protein  25.41 
 
 		 212 aa  41.6  0.007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4560  CRISPR-associated protein Cas4  25.81 
 
 		 194 aa  41.2  0.008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>