65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_31590 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_31590  CRISPR-associated protein Cas4  100 
 
 
199 aa  409  1e-113  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02697  crispr-associated protein Cas4  75.74 
 
 
210 aa  307  8e-83  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.463213  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1632  CRISPR-associated protein Cas4  57.21 
 
 
218 aa  229  2e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.98908 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1432  CRISPR-associated Cas4 family protein  53.69 
 
 
214 aa  216  2e-55  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.343364  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1299  hypothetical protein  52.71 
 
 
214 aa  215  4e-55  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.938866  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0832  CRISPR-associated exonuclease Cas4 family protein  56.76 
 
 
228 aa  207  6e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2974  CRISPR-associated Cas4 family protein  56.52 
 
 
212 aa  204  7e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.948346  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1937  hypothetical protein  56.61 
 
 
216 aa  204  8e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.370637  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0793  CRISPR-associated protein Cas4  56 
 
 
209 aa  204  1e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.813459  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1006  hypothetical protein  51.01 
 
 
215 aa  199  3e-50  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0356084  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1661  CRISPR-associated protein Cas4  50.75 
 
 
214 aa  196  1.0000000000000001e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.975016  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3523  CRISPR-associated exonuclease Cas4 family protein  51.49 
 
 
218 aa  196  3e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1975  CRISPR-associated protein Cas4  52.78 
 
 
255 aa  190  2e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0605  CRISPR-associated exonuclease Cas4 family protein  48.45 
 
 
216 aa  177  7e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.452129 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0851  CRISPR-associated exonuclease Cas4 family protein  46.08 
 
 
224 aa  176  2e-43  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4331  CRISPR-associated Cas4 family protein  44.81 
 
 
222 aa  173  9.999999999999999e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000854832  normal  0.165932 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2652  CRISPR-associated protein Cas4  46.39 
 
 
212 aa  173  1.9999999999999998e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0303971  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0652  CRISPR-associated Cas4 family protein  46.35 
 
 
210 aa  170  2e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.915701  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0822  CRISPR-associated protein Cas4  45.16 
 
 
206 aa  164  6.9999999999999995e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1070  hypothetical protein  46.7 
 
 
204 aa  161  7e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0265039 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1006  CRISPR-associated Cas4 family protein  41.55 
 
 
219 aa  160  9e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3906  CRISPR-associated Cas4 family protein  47.34 
 
 
212 aa  160  1e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.164887  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1481  CRISPR-associated protein Cas4  39.91 
 
 
222 aa  159  2e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0494  CRISPR-associated exonuclease Cas4 family protein  45.11 
 
 
214 aa  158  4e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2723  CRISPR-associated Cas4 family protein  44.51 
 
 
208 aa  157  9e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2187  CRISPR-associated protein Cas4  40.48 
 
 
223 aa  157  9e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1975  CRISPR-associated protein Cas4  43.4 
 
 
220 aa  155  4e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.360978  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0479  RecB family exonuclease  40.38 
 
 
234 aa  154  1e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.957708  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3647  CRISPR-associated protein Cas4  40.48 
 
 
225 aa  153  2e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1155  CRISPR-associated Cas4 family protein  46.31 
 
 
212 aa  153  2e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0235  CRISPR-associated Cas4 family protein  48.35 
 
 
211 aa  152  4e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3372  hypothetical protein  47.57 
 
 
218 aa  151  5e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1478  CRISPR-associated protein Cas4  46.23 
 
 
218 aa  151  5.9999999999999996e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.470243 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4560  CRISPR-associated protein Cas4  33.16 
 
 
194 aa  127  7.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4175  hypothetical protein  35.33 
 
 
196 aa  120  9.999999999999999e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000176829 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1625  CRISPR-associated Cas1 family protein  35.36 
 
 
544 aa  116  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.575155  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1717  CRISPR-associated protein Cas4  34.78 
 
 
200 aa  111  9e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    unclonable  2.73181e-25 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3507  PE-PGRS family protein  35.6 
 
 
190 aa  111  9e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.366327 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3345  CRISPR-associated Cas4 family protein  36.22 
 
 
221 aa  107  8.000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0218123  normal  0.382188 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2233  CRISPR-associated Cas4 family protein  35.75 
 
 
205 aa  105  6e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.874224  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2974  CRISPR-associated protein Cas1  34.25 
 
 
545 aa  104  7e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2433  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  33.5 
 
 
570 aa  103  2e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0199418  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0505  CRISPR-associated protein Cas4  33.7 
 
 
196 aa  100  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2913  CRISPR-associated protein Cas1  33.33 
 
 
553 aa  99  4e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0184071  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2461  CRISPR-associated protein Cas4  35.26 
 
 
196 aa  98.6  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.587961 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0522  CRISPR-associated protein Cas4  33.15 
 
 
196 aa  98.6  6e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00230563  hitchhiker  0.00000101589 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0057  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  35.86 
 
 
559 aa  96.3  3e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3119  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  29.79 
 
 
550 aa  91.3  8e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00000141365  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1441  CRISPR-associated protein Cas1  30.14 
 
 
598 aa  90.5  2e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0376991  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4852  CRISPR-associated protein Cas1  30 
 
 
594 aa  88.6  5e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.464981  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1859  CRISPR-associated Cas4 family protein  30.56 
 
 
193 aa  83.6  0.000000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.343722  normal  0.533704 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3577  CRISPR-associated protein Cas4  29.21 
 
 
190 aa  75.5  0.0000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5519  CRISPR-associated protein Cas1  31.35 
 
 
558 aa  70.9  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.28105 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1558  CRISPR-associated Cas4 family protein  27.03 
 
 
190 aa  67  0.0000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.681932  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0179  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  26.42 
 
 
580 aa  58.5  0.00000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3305  CRISPR-associated Cas4 family protein  25.93 
 
 
198 aa  57.4  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.143494  normal  0.352212 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1287  CRISPR-associated Cas4 family protein  25.13 
 
 
190 aa  57.8  0.0000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.826986  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2343  hypothetical protein  27.04 
 
 
333 aa  57.8  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1872  CRISPR-associated Cas4 family protein  26.06 
 
 
198 aa  56.2  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0728  CRISPR-associated Cas4 family protein  27.63 
 
 
172 aa  55.1  0.0000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1121  CRISPR-associated Cas4 family protein  27.27 
 
 
190 aa  52  0.000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.00306765  normal  0.769752 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0637  CRISPR-associated Cas4 family protein  23.16 
 
 
191 aa  48.5  0.00006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.042721  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0536  protein of unknown function DUF83  29.2 
 
 
170 aa  47.8  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0513907  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6022  CRISPR-associated protein Cas4  26.53 
 
 
195 aa  41.6  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.318812  normal  0.45154 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1816  hypothetical protein  29.92 
 
 
170 aa  41.2  0.01  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.115857  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>