71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_0565 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_0565  CRISPR-associated protein Cas4  100 
 
 
202 aa  416  1e-116  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.234335  normal  0.250424 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1872  CRISPR-associated Cas4 family protein  62.56 
 
 
198 aa  255  2e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3305  CRISPR-associated Cas4 family protein  59.49 
 
 
198 aa  246  2e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.143494  normal  0.352212 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5083  CRISPR-associated Cas4 family protein  49.48 
 
 
197 aa  173  9.999999999999999e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1287  CRISPR-associated Cas4 family protein  39.69 
 
 
190 aa  149  4e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.826986  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1765  CRISPR-associated protein Cas4  39.18 
 
 
189 aa  136  2e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4560  CRISPR-associated protein Cas4  26.6 
 
 
194 aa  79.7  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1859  CRISPR-associated Cas4 family protein  25.52 
 
 
193 aa  71.6  0.000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.343722  normal  0.533704 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1558  CRISPR-associated Cas4 family protein  26.77 
 
 
190 aa  70.9  0.00000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.681932  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0637  CRISPR-associated Cas4 family protein  25.51 
 
 
191 aa  68.9  0.00000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.042721  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4175  hypothetical protein  24.74 
 
 
196 aa  65.5  0.0000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000176829 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1717  CRISPR-associated protein Cas4  25 
 
 
200 aa  65.1  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    unclonable  2.73181e-25 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0822  CRISPR-associated protein Cas4  27 
 
 
206 aa  62.8  0.000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0652  CRISPR-associated Cas4 family protein  26.56 
 
 
210 aa  62  0.000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.915701  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0163  hypothetical protein  23.44 
 
 
197 aa  61.6  0.000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6022  CRISPR-associated protein Cas4  25.38 
 
 
195 aa  59.7  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.318812  normal  0.45154 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1076  CRISPR-associated Cas4 family protein  24.51 
 
 
197 aa  59.3  0.00000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0235  CRISPR-associated Cas4 family protein  28.29 
 
 
211 aa  59.3  0.00000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2233  CRISPR-associated Cas4 family protein  26.18 
 
 
205 aa  59.3  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.874224  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1155  CRISPR-associated Cas4 family protein  29.23 
 
 
212 aa  58.5  0.00000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2652  CRISPR-associated protein Cas4  25.79 
 
 
212 aa  58.2  0.00000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0303971  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0728  CRISPR-associated Cas4 family protein  30.32 
 
 
172 aa  56.6  0.0000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2461  CRISPR-associated protein Cas4  26.49 
 
 
196 aa  56.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.587961 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1625  CRISPR-associated Cas1 family protein  23.94 
 
 
544 aa  54.7  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.575155  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0479  RecB family exonuclease  26.12 
 
 
234 aa  53.5  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.957708  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2723  CRISPR-associated Cas4 family protein  24.08 
 
 
208 aa  52.4  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1299  hypothetical protein  22.51 
 
 
214 aa  52.4  0.000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.938866  normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3577  CRISPR-associated protein Cas4  24.61 
 
 
190 aa  52  0.000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1937  hypothetical protein  26.4 
 
 
216 aa  51.2  0.000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.370637  normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2974  CRISPR-associated Cas4 family protein  26.47 
 
 
212 aa  50.8  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.948346  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3523  CRISPR-associated exonuclease Cas4 family protein  25.25 
 
 
218 aa  50.8  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0774  CRISPR-associated exonuclease Cas4 family protein  22.51 
 
 
206 aa  50.1  0.00002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.356687  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1478  CRISPR-associated protein Cas4  27.55 
 
 
218 aa  49.7  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.470243 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1070  hypothetical protein  25.26 
 
 
204 aa  49.3  0.00004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0265039 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1006  hypothetical protein  23.5 
 
 
215 aa  49.3  0.00004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0356084  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0505  CRISPR-associated protein Cas4  20.74 
 
 
196 aa  48.9  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2974  CRISPR-associated protein Cas1  27.13 
 
 
545 aa  48.5  0.00006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0522  CRISPR-associated protein Cas4  20.74 
 
 
196 aa  48.5  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00230563  hitchhiker  0.00000101589 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0605  CRISPR-associated exonuclease Cas4 family protein  23.62 
 
 
216 aa  48.5  0.00006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.452129 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15190  CRISPR-associated protein Cas4  19.47 
 
 
198 aa  48.1  0.00008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0227  CRISPR-associated Cas4 family protein  20.83 
 
 
209 aa  47.8  0.0001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.279714  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1000  hypothetical protein  31.96 
 
 
172 aa  47.8  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0494  CRISPR-associated exonuclease Cas4 family protein  25.73 
 
 
214 aa  47.8  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2433  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  23.83 
 
 
570 aa  46.6  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0199418  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3220  CRISPR-associated Cas4 family protein  19.68 
 
 
204 aa  47  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.680334  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3906  CRISPR-associated Cas4 family protein  22.97 
 
 
212 aa  47  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.164887  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0832  CRISPR-associated exonuclease Cas4 family protein  25.19 
 
 
228 aa  46.6  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3507  PE-PGRS family protein  22.11 
 
 
190 aa  46.6  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.366327 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3372  hypothetical protein  25.51 
 
 
218 aa  46.6  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5519  CRISPR-associated protein Cas1  26 
 
 
558 aa  45.4  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.28105 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1432  CRISPR-associated Cas4 family protein  21.88 
 
 
214 aa  45.4  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.343364  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3119  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  23.68 
 
 
550 aa  45.1  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00000141365  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4331  CRISPR-associated Cas4 family protein  25.93 
 
 
222 aa  45.1  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000854832  normal  0.165932 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0305  CRISPR-associated protein Cas4  26.98 
 
 
323 aa  44.7  0.0009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0851  CRISPR-associated exonuclease Cas4 family protein  21.89 
 
 
224 aa  44.7  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0952  hypothetical protein  23.24 
 
 
263 aa  44.7  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1975  CRISPR-associated protein Cas4  25.13 
 
 
220 aa  44.7  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.360978  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1661  CRISPR-associated protein Cas4  22.73 
 
 
214 aa  44.7  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.975016  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0438  hypothetical protein  27.27 
 
 
220 aa  43.5  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.503828  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1502  hypothetical protein  28.57 
 
 
102 aa  43.5  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.314393 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0136  hypothetical protein  29.1 
 
 
231 aa  43.5  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.547457  normal  0.0958558 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1975  CRISPR-associated protein Cas4  24.49 
 
 
255 aa  43.5  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1632  CRISPR-associated protein Cas4  25 
 
 
218 aa  42.4  0.005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.98908 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03571  RecB family nuclease  24.71 
 
 
483 aa  42.4  0.005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.551533  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3932  CRISPR-associated protein Cas4  28.75 
 
 
169 aa  42.4  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0057  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  27.27 
 
 
559 aa  42  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1006  CRISPR-associated Cas4 family protein  23.02 
 
 
219 aa  42  0.006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1643  DNA repair enzyme  25.88 
 
 
483 aa  42  0.006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.845174  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2291  CRISPR-associated protein Cas4  23.08 
 
 
175 aa  41.6  0.007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0593  exonuclease-like protein  26.61 
 
 
379 aa  41.6  0.008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0865179  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0737  hypothetical protein  26.39 
 
 
244 aa  41.6  0.009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.821766  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>