76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3305 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_3305  CRISPR-associated Cas4 family protein  100 
 
 		 198 aa  409  1e-113  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.143494  normal  0.352212 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1872  CRISPR-associated Cas4 family protein  89.9 
 
 		 198 aa  371  1e-102  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0565  CRISPR-associated protein Cas4  59.49 
 
 		 202 aa  246  2e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.234335  normal  0.250424 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5083  CRISPR-associated Cas4 family protein  49.22 
 
 		 197 aa  161  7e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1287  CRISPR-associated Cas4 family protein  37.31 
 
 		 190 aa  131  5e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.826986  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1765  CRISPR-associated protein Cas4  38.02 
 
 		 189 aa  120  9.999999999999999e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2652  CRISPR-associated protein Cas4  28.57 
 
 		 212 aa  74.7  0.0000000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0303971  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0163  hypothetical protein  27.5 
 
 		 197 aa  74.7  0.0000000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1558  CRISPR-associated Cas4 family protein  29.63 
 
 		 190 aa  73.9  0.000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.681932  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0822  CRISPR-associated protein Cas4  28.21 
 
 		 206 aa  74.3  0.000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2974  CRISPR-associated Cas4 family protein  36.8 
 
 		 212 aa  71.6  0.000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.948346  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1859  CRISPR-associated Cas4 family protein  23.44 
 
 		 193 aa  70.1  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.343722  normal  0.533704 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3577  CRISPR-associated protein Cas4  28.72 
 
 		 190 aa  69.3  0.00000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4560  CRISPR-associated protein Cas4  26.6 
 
 		 194 aa  68.9  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3523  CRISPR-associated exonuclease Cas4 family protein  32.31 
 
 		 218 aa  68.2  0.00000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0637  CRISPR-associated Cas4 family protein  28.5 
 
 		 191 aa  67  0.0000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.042721  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0605  CRISPR-associated exonuclease Cas4 family protein  27.66 
 
 		 216 aa  67  0.0000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.452129 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1625  CRISPR-associated Cas1 family protein  27.51 
 
 		 544 aa  65.1  0.0000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.575155  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0494  CRISPR-associated exonuclease Cas4 family protein  29.38 
 
 		 214 aa  64.3  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1717  CRISPR-associated protein Cas4  23.12 
 
 		 200 aa  62  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    unclonable  2.73181e-25 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0235  CRISPR-associated Cas4 family protein  29.17 
 
 		 211 aa  62  0.000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2974  CRISPR-associated protein Cas1  27.6 
 
 		 545 aa  61.6  0.000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4175  hypothetical protein  26.56 
 
 		 196 aa  61.2  0.000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000176829 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3220  CRISPR-associated Cas4 family protein  24.75 
 
 		 204 aa  61.2  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.680334  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1070  hypothetical protein  30.4 
 
 		 204 aa  59.7  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0265039 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1155  CRISPR-associated Cas4 family protein  29.95 
 
 		 212 aa  58.9  0.00000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2723  CRISPR-associated Cas4 family protein  29.6 
 
 		 208 aa  57.8  0.00000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0479  RecB family exonuclease  29.63 
 
 		 234 aa  57.8  0.0000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.957708  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31590  CRISPR-associated protein Cas4  25.93 
 
 		 199 aa  57.4  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0652  CRISPR-associated Cas4 family protein  30.65 
 
 		 210 aa  57.4  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.915701  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4331  CRISPR-associated Cas4 family protein  30.83 
 
 		 222 aa  56.6  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000854832  normal  0.165932 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1076  CRISPR-associated Cas4 family protein  22.61 
 
 		 197 aa  57  0.0000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1432  CRISPR-associated Cas4 family protein  27.55 
 
 		 214 aa  56.6  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.343364  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0728  CRISPR-associated Cas4 family protein  32.9 
 
 		 172 aa  57  0.0000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1478  CRISPR-associated protein Cas4  31.2 
 
 		 218 aa  55.1  0.0000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.470243 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0774  CRISPR-associated exonuclease Cas4 family protein  23.96 
 
 		 206 aa  54.7  0.0000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.356687  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6022  CRISPR-associated protein Cas4  25.79 
 
 		 195 aa  54.7  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.318812  normal  0.45154 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3507  PE-PGRS family protein  26.87 
 
 		 190 aa  53.9  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.366327 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1006  hypothetical protein  28.57 
 
 		 215 aa  54.3  0.000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0356084  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15190  CRISPR-associated protein Cas4  20.79 
 
 		 198 aa  53.5  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1975  CRISPR-associated protein Cas4  28.72 
 
 		 255 aa  53.1  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0851  CRISPR-associated exonuclease Cas4 family protein  28.89 
 
 		 224 aa  53.9  0.000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0522  CRISPR-associated protein Cas4  22.61 
 
 		 196 aa  52.8  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00230563  hitchhiker  0.00000101589 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0505  CRISPR-associated protein Cas4  22.61 
 
 		 196 aa  52.8  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1661  CRISPR-associated protein Cas4  27.18 
 
 		 214 aa  52.4  0.000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.975016  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2233  CRISPR-associated Cas4 family protein  23.59 
 
 		 205 aa  52.4  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.874224  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1006  CRISPR-associated Cas4 family protein  28.12 
 
 		 219 aa  52.4  0.000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3372  hypothetical protein  30.53 
 
 		 218 aa  52  0.000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1937  hypothetical protein  28.68 
 
 		 216 aa  52  0.000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.370637  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02697  crispr-associated protein Cas4  26.32 
 
 		 210 aa  51.2  0.000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.463213  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0793  CRISPR-associated protein Cas4  27.32 
 
 		 209 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.813459  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1015  CRISPR-associated Cas4 family protein  27.91 
 
 		 186 aa  48.9  0.00005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2461  CRISPR-associated protein Cas4  23 
 
 		 196 aa  48.5  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.587961 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5519  CRISPR-associated protein Cas1  26.13 
 
 		 558 aa  48.1  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.28105 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1299  hypothetical protein  24.47 
 
 		 214 aa  47.8  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.938866  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1632  CRISPR-associated protein Cas4  25.63 
 
 		 218 aa  46.6  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.98908 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2291  CRISPR-associated protein Cas4  23.4 
 
 		 175 aa  46.6  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3119  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  23.81 
 
 		 550 aa  46.2  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00000141365  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2660  CRISPR-associated protein Cas4  29.41 
 
 		 185 aa  45.4  0.0005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0832  CRISPR-associated exonuclease Cas4 family protein  26.36 
 
 		 228 aa  45.4  0.0006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0179  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  26.04 
 
 		 580 aa  45.1  0.0008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3906  CRISPR-associated Cas4 family protein  23.74 
 
 		 212 aa  43.9  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.164887  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1975  CRISPR-associated protein Cas4  28.12 
 
 		 220 aa  43.5  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.360978  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_558  hypothetical protein  24.39 
 
 		 379 aa  43.5  0.002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1443  superfamily I DNA/RNA helicase  23.57 
 
 		 920 aa  42.7  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  unclonable  0.000000114812  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5824  UvrD/REP helicase  28.45 
 
 		 1052 aa  42.7  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.101502 
 
 
-
 
NC_002936  DET0620  hypothetical protein  24.39 
 
 		 379 aa  43.1  0.003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.638225  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0593  exonuclease-like protein  25.2 
 
 		 379 aa  42.7  0.003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0865179  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0227  CRISPR-associated Cas4 family protein  20.19 
 
 		 209 aa  42.4  0.004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.279714  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1481  CRISPR-associated protein Cas4  24.03 
 
 		 222 aa  42.4  0.005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3647  CRISPR-associated protein Cas4  24.81 
 
 		 225 aa  42  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2187  CRISPR-associated protein Cas4  25.58 
 
 		 223 aa  42  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1502  hypothetical protein  25 
 
 		 102 aa  42  0.005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.314393 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03571  RecB family nuclease  21.18 
 
 		 483 aa  41.6  0.007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.551533  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1643  DNA repair enzyme  23.53 
 
 		 483 aa  41.2  0.009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.845174  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2603  hypothetical protein  28.79 
 
 		 170 aa  41.2  0.009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.519513  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>