70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1070 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_1070  hypothetical protein  100 
 
 		 204 aa  424  1e-118  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0265039 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2723  CRISPR-associated Cas4 family protein  74.5 
 
 		 208 aa  322  2e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0494  CRISPR-associated exonuclease Cas4 family protein  55.56 
 
 		 214 aa  225  3e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0822  CRISPR-associated protein Cas4  52.68 
 
 		 206 aa  214  7e-55  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1661  CRISPR-associated protein Cas4  45.63 
 
 		 214 aa  191  9e-48  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.975016  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1432  CRISPR-associated Cas4 family protein  46.45 
 
 		 214 aa  187  7e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.343364  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1006  hypothetical protein  43.27 
 
 		 215 aa  187  1e-46  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0356084  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0652  CRISPR-associated Cas4 family protein  48.29 
 
 		 210 aa  184  8e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.915701  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1632  CRISPR-associated protein Cas4  50.55 
 
 		 218 aa  179  2.9999999999999997e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.98908 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1478  CRISPR-associated protein Cas4  47.89 
 
 		 218 aa  177  8e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.470243 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3372  hypothetical protein  48.39 
 
 		 218 aa  177  1e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1299  hypothetical protein  43.2 
 
 		 214 aa  175  4e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.938866  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0235  CRISPR-associated Cas4 family protein  50.27 
 
 		 211 aa  174  6e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3906  CRISPR-associated Cas4 family protein  45.88 
 
 		 212 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.164887  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2652  CRISPR-associated protein Cas4  46.07 
 
 		 212 aa  171  5e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0303971  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1975  CRISPR-associated protein Cas4  43.81 
 
 		 255 aa  166  2.9999999999999998e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1155  CRISPR-associated Cas4 family protein  44.02 
 
 		 212 aa  162  3e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02697  crispr-associated protein Cas4  43.14 
 
 		 210 aa  161  7e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.463213  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31590  CRISPR-associated protein Cas4  46.7 
 
 		 199 aa  161  8.000000000000001e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1937  hypothetical protein  42.45 
 
 		 216 aa  157  1e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.370637  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0793  CRISPR-associated protein Cas4  44.9 
 
 		 209 aa  156  2e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.813459  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2974  CRISPR-associated Cas4 family protein  45.9 
 
 		 212 aa  155  5.0000000000000005e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.948346  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0605  CRISPR-associated exonuclease Cas4 family protein  40.5 
 
 		 216 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.452129 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3523  CRISPR-associated exonuclease Cas4 family protein  42.39 
 
 		 218 aa  151  5.9999999999999996e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0832  CRISPR-associated exonuclease Cas4 family protein  41.12 
 
 		 228 aa  144  6e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0851  CRISPR-associated exonuclease Cas4 family protein  36.67 
 
 		 224 aa  144  1e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1006  CRISPR-associated Cas4 family protein  34.12 
 
 		 219 aa  141  6e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2187  CRISPR-associated protein Cas4  35.71 
 
 		 223 aa  132  3e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3647  CRISPR-associated protein Cas4  35.71 
 
 		 225 aa  131  6.999999999999999e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4560  CRISPR-associated protein Cas4  36.08 
 
 		 194 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3345  CRISPR-associated Cas4 family protein  39.01 
 
 		 221 aa  128  5.0000000000000004e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0218123  normal  0.382188 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0479  RecB family exonuclease  38.19 
 
 		 234 aa  128  7.000000000000001e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.957708  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4331  CRISPR-associated Cas4 family protein  35.68 
 
 		 222 aa  122  3e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000854832  normal  0.165932 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1975  CRISPR-associated protein Cas4  35.02 
 
 		 220 aa  121  8e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.360978  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1717  CRISPR-associated protein Cas4  37.04 
 
 		 200 aa  119  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    unclonable  2.73181e-25 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1481  CRISPR-associated protein Cas4  30.19 
 
 		 222 aa  119  3.9999999999999996e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2233  CRISPR-associated Cas4 family protein  37.17 
 
 		 205 aa  117  9.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.874224  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4175  hypothetical protein  35.64 
 
 		 196 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000176829 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1625  CRISPR-associated Cas1 family protein  35.8 
 
 		 544 aa  116  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.575155  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0505  CRISPR-associated protein Cas4  34.25 
 
 		 196 aa  109  3e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0522  CRISPR-associated protein Cas4  34.25 
 
 		 196 aa  108  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00230563  hitchhiker  0.00000101589 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2461  CRISPR-associated protein Cas4  33.85 
 
 		 196 aa  105  6e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.587961 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2974  CRISPR-associated protein Cas1  34.66 
 
 		 545 aa  103  2e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4852  CRISPR-associated protein Cas1  31.94 
 
 		 594 aa  97.8  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.464981  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2433  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  35.96 
 
 		 570 aa  96.3  3e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0199418  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1859  CRISPR-associated Cas4 family protein  31.67 
 
 		 193 aa  91.7  8e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.343722  normal  0.533704 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3507  PE-PGRS family protein  34.39 
 
 		 190 aa  91.3  9e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.366327 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0057  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  34.92 
 
 		 559 aa  90.1  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2913  CRISPR-associated protein Cas1  31.69 
 
 		 553 aa  85.1  7e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0184071  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3119  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  30 
 
 		 550 aa  84.7  9e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00000141365  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1441  CRISPR-associated protein Cas1  30.48 
 
 		 598 aa  80.9  0.00000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0376991  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3577  CRISPR-associated protein Cas4  30.05 
 
 		 190 aa  70.1  0.00000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0179  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  29.29 
 
 		 580 aa  63.9  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1558  CRISPR-associated Cas4 family protein  28.26 
 
 		 190 aa  63.9  0.000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.681932  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2343  hypothetical protein  28.86 
 
 		 333 aa  63.9  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1872  CRISPR-associated Cas4 family protein  30.4 
 
 		 198 aa  62  0.000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1287  CRISPR-associated Cas4 family protein  26.06 
 
 		 190 aa  60.8  0.00000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.826986  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5519  CRISPR-associated protein Cas1  26.67 
 
 		 558 aa  60.1  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.28105 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3305  CRISPR-associated Cas4 family protein  30.4 
 
 		 198 aa  59.7  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.143494  normal  0.352212 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0565  CRISPR-associated protein Cas4  25.26 
 
 		 202 aa  49.3  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.234335  normal  0.250424 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5083  CRISPR-associated Cas4 family protein  26.27 
 
 		 197 aa  48.5  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2841  CRISPR-associated protein Cas1  33.72 
 
 		 525 aa  48.1  0.00008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00141566  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0536  protein of unknown function DUF83  30.08 
 
 		 170 aa  47.8  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0513907  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0918  CRISPR-associated protein Cas4  32.81 
 
 		 162 aa  47.4  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000176613 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3220  CRISPR-associated Cas4 family protein  25.25 
 
 		 204 aa  47.4  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.680334  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0774  CRISPR-associated exonuclease Cas4 family protein  23.23 
 
 		 206 aa  43.1  0.003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.356687  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1816  hypothetical protein  30.58 
 
 		 170 aa  42.7  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.115857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2603  hypothetical protein  29.5 
 
 		 170 aa  42  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.519513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2838  hypothetical protein  29.93 
 
 		 171 aa  42  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000529444  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2015  CRISPR-associated Cas4 family protein  27.14 
 
 		 170 aa  42  0.007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>