34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2603 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2603  hypothetical protein  100 
 
 		 170 aa  345  2e-94  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.519513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1816  hypothetical protein  82.74 
 
 		 170 aa  257  6e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.115857  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0536  protein of unknown function DUF83  58.33 
 
 		 170 aa  187  5e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0513907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2838  hypothetical protein  52.7 
 
 		 171 aa  158  3e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000529444  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0728  CRISPR-associated Cas4 family protein  38.32 
 
 		 172 aa  105  2e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0305  CRISPR-associated protein Cas4  32.75 
 
 		 323 aa  87.4  9e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1015  CRISPR-associated Cas4 family protein  28.47 
 
 		 186 aa  70.9  0.000000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2270  CRISPR-associated protein Cas4  30.51 
 
 		 201 aa  51.2  0.000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.160192  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0832  CRISPR-associated exonuclease Cas4 family protein  32.06 
 
 		 228 aa  50.8  0.000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4560  CRISPR-associated protein Cas4  24.37 
 
 		 194 aa  50.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3577  CRISPR-associated protein Cas4  29.69 
 
 		 190 aa  50.8  0.00001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1859  CRISPR-associated Cas4 family protein  27.69 
 
 		 193 aa  48.5  0.00004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.343722  normal  0.533704 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1006  hypothetical protein  25.56 
 
 		 215 aa  46.2  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0356084  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1975  CRISPR-associated protein Cas4  33.33 
 
 		 255 aa  46.2  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0522  CRISPR-associated protein Cas4  26.09 
 
 		 196 aa  45.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00230563  hitchhiker  0.00000101589 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0505  CRISPR-associated protein Cas4  26.09 
 
 		 196 aa  45.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4175  hypothetical protein  26.89 
 
 		 196 aa  45.8  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000176829 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0553  hypothetical protein  25.83 
 
 		 273 aa  45.8  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02697  crispr-associated protein Cas4  30.4 
 
 		 210 aa  45.1  0.0004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.463213  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3372  hypothetical protein  27.87 
 
 		 218 aa  45.1  0.0005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5519  CRISPR-associated protein Cas1  38.81 
 
 		 558 aa  44.3  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.28105 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2461  CRISPR-associated protein Cas4  28.21 
 
 		 196 aa  44.3  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.587961 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3523  CRISPR-associated exonuclease Cas4 family protein  25.98 
 
 		 218 aa  44.3  0.0009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0494  CRISPR-associated exonuclease Cas4 family protein  27.27 
 
 		 214 aa  44.3  0.0009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1717  CRISPR-associated protein Cas4  26.96 
 
 		 200 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    unclonable  2.73181e-25 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0652  CRISPR-associated Cas4 family protein  30.95 
 
 		 210 aa  43.9  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.915701  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1432  CRISPR-associated Cas4 family protein  27.84 
 
 		 214 aa  42  0.004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.343364  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1558  CRISPR-associated Cas4 family protein  40 
 
 		 190 aa  42  0.004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.681932  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1070  hypothetical protein  29.5 
 
 		 204 aa  42  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0265039 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1603  hypothetical protein  33.33 
 
 		 181 aa  41.6  0.005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3305  CRISPR-associated Cas4 family protein  28.79 
 
 		 198 aa  41.2  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.143494  normal  0.352212 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2723  CRISPR-associated Cas4 family protein  27.94 
 
 		 208 aa  41.2  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1930  hypothetical protein  23.13 
 
 		 272 aa  41.2  0.007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2916  DNA replication factor Dna2  35.82 
 
 		 902 aa  41.2  0.007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>