62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_2187 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_2187  CRISPR-associated protein Cas4  100 
 
 		 223 aa  463  1e-129  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3647  CRISPR-associated protein Cas4  86.04 
 
 		 225 aa  408  1e-113  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1481  CRISPR-associated protein Cas4  64.38 
 
 		 222 aa  330  1e-89  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4331  CRISPR-associated Cas4 family protein  55.96 
 
 		 222 aa  257  9e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000854832  normal  0.165932 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1975  CRISPR-associated protein Cas4  52.05 
 
 		 220 aa  254  8e-67  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.360978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0479  RecB family exonuclease  52.04 
 
 		 234 aa  229  2e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.957708  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0851  CRISPR-associated exonuclease Cas4 family protein  48.78 
 
 		 224 aa  220  9.999999999999999e-57  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1006  CRISPR-associated Cas4 family protein  44.34 
 
 		 219 aa  201  5e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1006  hypothetical protein  42.99 
 
 		 215 aa  185  5e-46  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0356084  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1432  CRISPR-associated Cas4 family protein  43.12 
 
 		 214 aa  181  9.000000000000001e-45  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.343364  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1299  hypothetical protein  43.12 
 
 		 214 aa  181  1e-44  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.938866  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1661  CRISPR-associated protein Cas4  42.08 
 
 		 214 aa  175  5e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.975016  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1632  CRISPR-associated protein Cas4  41.95 
 
 		 218 aa  169  4e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.98908 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2974  CRISPR-associated Cas4 family protein  42.6 
 
 		 212 aa  167  8e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.948346  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02697  crispr-associated protein Cas4  40.28 
 
 		 210 aa  166  2.9999999999999998e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.463213  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0793  CRISPR-associated protein Cas4  42.25 
 
 		 209 aa  164  8e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.813459  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0605  CRISPR-associated exonuclease Cas4 family protein  38.89 
 
 		 216 aa  161  6e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.452129 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31590  CRISPR-associated protein Cas4  40.48 
 
 		 199 aa  157  1e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3523  CRISPR-associated exonuclease Cas4 family protein  43.5 
 
 		 218 aa  157  1e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1975  CRISPR-associated protein Cas4  41.92 
 
 		 255 aa  157  2e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0832  CRISPR-associated exonuclease Cas4 family protein  40 
 
 		 228 aa  148  6e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1937  hypothetical protein  39.9 
 
 		 216 aa  145  7.0000000000000006e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.370637  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2652  CRISPR-associated protein Cas4  34.27 
 
 		 212 aa  141  9e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0303971  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0494  CRISPR-associated exonuclease Cas4 family protein  36.5 
 
 		 214 aa  137  1e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0652  CRISPR-associated Cas4 family protein  36.49 
 
 		 210 aa  135  4e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.915701  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1070  hypothetical protein  35.71 
 
 		 204 aa  132  3.9999999999999996e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0265039 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2723  CRISPR-associated Cas4 family protein  33.67 
 
 		 208 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0235  CRISPR-associated Cas4 family protein  36.55 
 
 		 211 aa  119  3.9999999999999996e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0822  CRISPR-associated protein Cas4  32.83 
 
 		 206 aa  118  7e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3906  CRISPR-associated Cas4 family protein  34.95 
 
 		 212 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.164887  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3372  hypothetical protein  33.95 
 
 		 218 aa  110  2.0000000000000002e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4560  CRISPR-associated protein Cas4  31.31 
 
 		 194 aa  108  6e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1478  CRISPR-associated protein Cas4  33.81 
 
 		 218 aa  102  4e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.470243 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1155  CRISPR-associated Cas4 family protein  35.47 
 
 		 212 aa  102  6e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3345  CRISPR-associated Cas4 family protein  28.64 
 
 		 221 aa  101  1e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0218123  normal  0.382188 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2233  CRISPR-associated Cas4 family protein  30.85 
 
 		 205 aa  101  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.874224  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4175  hypothetical protein  30.77 
 
 		 196 aa  98.6  6e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000176829 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1717  CRISPR-associated protein Cas4  29.44 
 
 		 200 aa  97.8  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    unclonable  2.73181e-25 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0505  CRISPR-associated protein Cas4  32 
 
 		 196 aa  95.1  8e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0522  CRISPR-associated protein Cas4  32 
 
 		 196 aa  94.7  9e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00230563  hitchhiker  0.00000101589 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2461  CRISPR-associated protein Cas4  27.57 
 
 		 196 aa  85.1  8e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.587961 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3507  PE-PGRS family protein  29.56 
 
 		 190 aa  84.3  0.000000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.366327 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2974  CRISPR-associated protein Cas1  29.02 
 
 		 545 aa  81.6  0.000000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1625  CRISPR-associated Cas1 family protein  28.93 
 
 		 544 aa  80.5  0.00000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.575155  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2913  CRISPR-associated protein Cas1  27.92 
 
 		 553 aa  79.3  0.00000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0184071  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1558  CRISPR-associated Cas4 family protein  27.5 
 
 		 190 aa  75.5  0.0000000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.681932  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3119  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  28.1 
 
 		 550 aa  70.1  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00000141365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1859  CRISPR-associated Cas4 family protein  25.13 
 
 		 193 aa  69.7  0.00000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.343722  normal  0.533704 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0057  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  27.92 
 
 		 559 aa  67  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1441  CRISPR-associated protein Cas1  25.33 
 
 		 598 aa  66.6  0.0000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0376991  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2433  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  28.86 
 
 		 570 aa  66.2  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0199418  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5519  CRISPR-associated protein Cas1  26.96 
 
 		 558 aa  63.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.28105 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3577  CRISPR-associated protein Cas4  26.94 
 
 		 190 aa  62.8  0.000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2343  hypothetical protein  25.84 
 
 		 333 aa  57.8  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0179  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  25.84 
 
 		 580 aa  55.8  0.0000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4852  CRISPR-associated protein Cas1  23.26 
 
 		 594 aa  51.6  0.000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.464981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3220  CRISPR-associated Cas4 family protein  25 
 
 		 204 aa  50.4  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.680334  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0728  CRISPR-associated Cas4 family protein  30.3 
 
 		 172 aa  45.4  0.0006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1872  CRISPR-associated Cas4 family protein  26.36 
 
 		 198 aa  43.5  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2517  hypothetical protein  24.73 
 
 		 168 aa  42.7  0.005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3305  CRISPR-associated Cas4 family protein  25.58 
 
 		 198 aa  42  0.007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.143494  normal  0.352212 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2023  CRISPR-associated Cas4 family protein  23.94 
 
 		 165 aa  42  0.008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.84369  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>