61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1481 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_1481  CRISPR-associated protein Cas4  100 
 
 		 222 aa  463  1e-129  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3647  CRISPR-associated protein Cas4  68.78 
 
 		 225 aa  350  1e-95  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2187  CRISPR-associated protein Cas4  64.38 
 
 		 223 aa  330  1e-89  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1975  CRISPR-associated protein Cas4  51.83 
 
 		 220 aa  259  2e-68  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.360978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4331  CRISPR-associated Cas4 family protein  55.71 
 
 		 222 aa  259  2e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000854832  normal  0.165932 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0851  CRISPR-associated exonuclease Cas4 family protein  47.44 
 
 		 224 aa  225  4e-58  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0479  RecB family exonuclease  50.45 
 
 		 234 aa  224  8e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.957708  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1006  CRISPR-associated Cas4 family protein  50.71 
 
 		 219 aa  221  8e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1006  hypothetical protein  45.33 
 
 		 215 aa  196  2.0000000000000003e-49  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0356084  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1661  CRISPR-associated protein Cas4  45.67 
 
 		 214 aa  192  3e-48  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.975016  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1299  hypothetical protein  43.78 
 
 		 214 aa  189  4e-47  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.938866  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1432  CRISPR-associated Cas4 family protein  44.24 
 
 		 214 aa  187  1e-46  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.343364  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02697  crispr-associated protein Cas4  39.91 
 
 		 210 aa  168  5e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.463213  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0605  CRISPR-associated exonuclease Cas4 family protein  40.19 
 
 		 216 aa  164  8e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.452129 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1975  CRISPR-associated protein Cas4  42.93 
 
 		 255 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2974  CRISPR-associated Cas4 family protein  42.72 
 
 		 212 aa  163  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.948346  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31590  CRISPR-associated protein Cas4  39.91 
 
 		 199 aa  159  2e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3523  CRISPR-associated exonuclease Cas4 family protein  40.39 
 
 		 218 aa  156  3e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1632  CRISPR-associated protein Cas4  38.89 
 
 		 218 aa  154  1e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.98908 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0793  CRISPR-associated protein Cas4  40.47 
 
 		 209 aa  153  2e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.813459  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0832  CRISPR-associated exonuclease Cas4 family protein  39 
 
 		 228 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2652  CRISPR-associated protein Cas4  35.78 
 
 		 212 aa  141  7e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0303971  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1937  hypothetical protein  38.12 
 
 		 216 aa  141  9e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.370637  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0494  CRISPR-associated exonuclease Cas4 family protein  34 
 
 		 214 aa  129  2.0000000000000002e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0652  CRISPR-associated Cas4 family protein  33.02 
 
 		 210 aa  122  5e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.915701  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0235  CRISPR-associated Cas4 family protein  34.52 
 
 		 211 aa  121  8e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1070  hypothetical protein  30.19 
 
 		 204 aa  119  4.9999999999999996e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0265039 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2723  CRISPR-associated Cas4 family protein  31.12 
 
 		 208 aa  115  6.9999999999999995e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4560  CRISPR-associated protein Cas4  32.32 
 
 		 194 aa  113  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0822  CRISPR-associated protein Cas4  31.47 
 
 		 206 aa  111  7.000000000000001e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3906  CRISPR-associated Cas4 family protein  31.4 
 
 		 212 aa  104  1e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.164887  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3372  hypothetical protein  32 
 
 		 218 aa  103  2e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1155  CRISPR-associated Cas4 family protein  33.63 
 
 		 212 aa  103  3e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2233  CRISPR-associated Cas4 family protein  29.21 
 
 		 205 aa  102  4e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.874224  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3345  CRISPR-associated Cas4 family protein  29.15 
 
 		 221 aa  102  4e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0218123  normal  0.382188 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1478  CRISPR-associated protein Cas4  31.66 
 
 		 218 aa  100  1e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.470243 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1717  CRISPR-associated protein Cas4  29.59 
 
 		 200 aa  101  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    unclonable  2.73181e-25 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4175  hypothetical protein  28.72 
 
 		 196 aa  95.5  5e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000176829 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3507  PE-PGRS family protein  29.41 
 
 		 190 aa  91.7  7e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.366327 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0522  CRISPR-associated protein Cas4  28.64 
 
 		 196 aa  91.7  7e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00230563  hitchhiker  0.00000101589 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0505  CRISPR-associated protein Cas4  28.64 
 
 		 196 aa  92  7e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2974  CRISPR-associated protein Cas1  30.05 
 
 		 545 aa  88.6  7e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2461  CRISPR-associated protein Cas4  28 
 
 		 196 aa  85.9  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.587961 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1625  CRISPR-associated Cas1 family protein  28.93 
 
 		 544 aa  82.8  0.000000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.575155  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2913  CRISPR-associated protein Cas1  26.7 
 
 		 553 aa  82  0.000000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0184071  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1441  CRISPR-associated protein Cas1  22.91 
 
 		 598 aa  66.6  0.0000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0376991  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1558  CRISPR-associated Cas4 family protein  25.51 
 
 		 190 aa  66.6  0.0000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.681932  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0057  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  26.56 
 
 		 559 aa  63.5  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2433  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  25.87 
 
 		 570 aa  63.2  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0199418  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1859  CRISPR-associated Cas4 family protein  23.59 
 
 		 193 aa  60.8  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.343722  normal  0.533704 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3577  CRISPR-associated protein Cas4  26.56 
 
 		 190 aa  60.5  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3119  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  21.74 
 
 		 550 aa  60.1  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00000141365  normal  1 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5519  CRISPR-associated protein Cas1  25.12 
 
 		 558 aa  57.4  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.28105 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4852  CRISPR-associated protein Cas1  23.61 
 
 		 594 aa  51.6  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.464981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0774  CRISPR-associated exonuclease Cas4 family protein  20.19 
 
 		 206 aa  47.8  0.0001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.356687  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0728  CRISPR-associated Cas4 family protein  27.84 
 
 		 172 aa  44.7  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2343  hypothetical protein  22.17 
 
 		 333 aa  43.9  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3220  CRISPR-associated Cas4 family protein  21.26 
 
 		 204 aa  42.7  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.680334  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3305  CRISPR-associated Cas4 family protein  24.03 
 
 		 198 aa  42.4  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.143494  normal  0.352212 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0179  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  21.23 
 
 		 580 aa  42  0.008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1872  CRISPR-associated Cas4 family protein  24.03 
 
 		 198 aa  41.6  0.009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>