62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1661 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_1661  CRISPR-associated protein Cas4  100 
 
 		 214 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.975016  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1432  CRISPR-associated Cas4 family protein  74.77 
 
 		 214 aa  342  2e-93  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.343364  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1299  hypothetical protein  72.9 
 
 		 214 aa  337  8e-92  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.938866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1006  hypothetical protein  69.16 
 
 		 215 aa  316  2e-85  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0356084  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1975  CRISPR-associated protein Cas4  50 
 
 		 255 aa  215  2.9999999999999998e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1632  CRISPR-associated protein Cas4  52.69 
 
 		 218 aa  207  1e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.98908 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1006  CRISPR-associated Cas4 family protein  46.58 
 
 		 219 aa  198  5e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0605  CRISPR-associated exonuclease Cas4 family protein  47.32 
 
 		 216 aa  197  7.999999999999999e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.452129 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02697  crispr-associated protein Cas4  48.28 
 
 		 210 aa  196  1.0000000000000001e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.463213  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31590  CRISPR-associated protein Cas4  50.75 
 
 		 199 aa  196  2.0000000000000003e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2974  CRISPR-associated Cas4 family protein  49.75 
 
 		 212 aa  196  2.0000000000000003e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.948346  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0793  CRISPR-associated protein Cas4  52.15 
 
 		 209 aa  193  2e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.813459  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1481  CRISPR-associated protein Cas4  45.67 
 
 		 222 aa  192  3e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1070  hypothetical protein  45.63 
 
 		 204 aa  191  1e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0265039 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3647  CRISPR-associated protein Cas4  46.19 
 
 		 225 aa  186  3e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3523  CRISPR-associated exonuclease Cas4 family protein  47.92 
 
 		 218 aa  184  7e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0851  CRISPR-associated exonuclease Cas4 family protein  42.6 
 
 		 224 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0494  CRISPR-associated exonuclease Cas4 family protein  43.41 
 
 		 214 aa  176  2e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1937  hypothetical protein  47.09 
 
 		 216 aa  176  3e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.370637  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2187  CRISPR-associated protein Cas4  42.08 
 
 		 223 aa  175  5e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1975  CRISPR-associated protein Cas4  42.86 
 
 		 220 aa  174  8e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.360978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0479  RecB family exonuclease  43.24 
 
 		 234 aa  168  5e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.957708  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2723  CRISPR-associated Cas4 family protein  42.03 
 
 		 208 aa  167  1e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0832  CRISPR-associated exonuclease Cas4 family protein  43.87 
 
 		 228 aa  167  1e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4331  CRISPR-associated Cas4 family protein  40.38 
 
 		 222 aa  161  6e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000854832  normal  0.165932 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0235  CRISPR-associated Cas4 family protein  42.19 
 
 		 211 aa  155  4e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0822  CRISPR-associated protein Cas4  40.98 
 
 		 206 aa  154  8e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0652  CRISPR-associated Cas4 family protein  41.5 
 
 		 210 aa  153  2e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.915701  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2652  CRISPR-associated protein Cas4  42.39 
 
 		 212 aa  152  5e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0303971  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3372  hypothetical protein  43.23 
 
 		 218 aa  142  3e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3906  CRISPR-associated Cas4 family protein  39.9 
 
 		 212 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.164887  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1478  CRISPR-associated protein Cas4  43.01 
 
 		 218 aa  135  3.0000000000000003e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.470243 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4560  CRISPR-associated protein Cas4  31.79 
 
 		 194 aa  130  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1155  CRISPR-associated Cas4 family protein  40.28 
 
 		 212 aa  130  1.0000000000000001e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2233  CRISPR-associated Cas4 family protein  37.89 
 
 		 205 aa  126  2.0000000000000002e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.874224  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4175  hypothetical protein  32.29 
 
 		 196 aa  125  5e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000176829 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1625  CRISPR-associated Cas1 family protein  37.37 
 
 		 544 aa  112  4.0000000000000004e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.575155  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1717  CRISPR-associated protein Cas4  35.11 
 
 		 200 aa  111  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    unclonable  2.73181e-25 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0505  CRISPR-associated protein Cas4  32.31 
 
 		 196 aa  105  8e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0522  CRISPR-associated protein Cas4  32.31 
 
 		 196 aa  104  8e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00230563  hitchhiker  0.00000101589 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2913  CRISPR-associated protein Cas1  36.7 
 
 		 553 aa  102  4e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0184071  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3345  CRISPR-associated Cas4 family protein  32.8 
 
 		 221 aa  101  8e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0218123  normal  0.382188 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2974  CRISPR-associated protein Cas1  33.33 
 
 		 545 aa  99.4  4e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0057  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  35.2 
 
 		 559 aa  97.4  1e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2433  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  35.1 
 
 		 570 aa  97.1  2e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0199418  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2461  CRISPR-associated protein Cas4  32.07 
 
 		 196 aa  95.9  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.587961 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3507  PE-PGRS family protein  33.84 
 
 		 190 aa  91.3  1e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.366327 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3119  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  30.48 
 
 		 550 aa  85.9  4e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00000141365  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4852  CRISPR-associated protein Cas1  30.33 
 
 		 594 aa  85.5  6e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.464981  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1859  CRISPR-associated Cas4 family protein  29.47 
 
 		 193 aa  82.8  0.000000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.343722  normal  0.533704 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1558  CRISPR-associated Cas4 family protein  28.19 
 
 		 190 aa  73.9  0.000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.681932  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2343  hypothetical protein  30.14 
 
 		 333 aa  67  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0179  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  30.14 
 
 		 580 aa  67  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1441  CRISPR-associated protein Cas1  28.3 
 
 		 598 aa  66.2  0.0000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0376991  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5519  CRISPR-associated protein Cas1  26.24 
 
 		 558 aa  64.3  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.28105 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3577  CRISPR-associated protein Cas4  26.37 
 
 		 190 aa  62.8  0.000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1872  CRISPR-associated Cas4 family protein  27.89 
 
 		 198 aa  52.8  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3305  CRISPR-associated Cas4 family protein  27.18 
 
 		 198 aa  52.4  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.143494  normal  0.352212 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0728  CRISPR-associated Cas4 family protein  28.46 
 
 		 172 aa  51.6  0.000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2838  hypothetical protein  30.88 
 
 		 171 aa  47  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000529444  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0565  CRISPR-associated protein Cas4  22.73 
 
 		 202 aa  44.7  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.234335  normal  0.250424 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0637  CRISPR-associated Cas4 family protein  25.13 
 
 		 191 aa  43.5  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.042721  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>