64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_1432 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_1432  CRISPR-associated Cas4 family protein  100 
 
 
214 aa  447  1e-125  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.343364  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1299  hypothetical protein  86.92 
 
 
214 aa  394  1e-109  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.938866  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1661  CRISPR-associated protein Cas4  74.77 
 
 
214 aa  342  2e-93  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.975016  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1006  hypothetical protein  64.49 
 
 
215 aa  302  3.0000000000000004e-81  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0356084  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1632  CRISPR-associated protein Cas4  56.45 
 
 
218 aa  217  1e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.98908 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31590  CRISPR-associated protein Cas4  53.69 
 
 
199 aa  216  2.9999999999999998e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1975  CRISPR-associated protein Cas4  50.93 
 
 
255 aa  214  5.9999999999999996e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02697  crispr-associated protein Cas4  50.94 
 
 
210 aa  211  5.999999999999999e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.463213  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2974  CRISPR-associated Cas4 family protein  49.29 
 
 
212 aa  205  4e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.948346  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0793  CRISPR-associated protein Cas4  53.76 
 
 
209 aa  199  3e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.813459  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0851  CRISPR-associated exonuclease Cas4 family protein  44.5 
 
 
224 aa  197  7e-50  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3523  CRISPR-associated exonuclease Cas4 family protein  49.02 
 
 
218 aa  197  7e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1006  CRISPR-associated Cas4 family protein  45.07 
 
 
219 aa  191  6e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3647  CRISPR-associated protein Cas4  45.5 
 
 
225 aa  191  6e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1070  hypothetical protein  46.45 
 
 
204 aa  187  7e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0265039 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1481  CRISPR-associated protein Cas4  44.24 
 
 
222 aa  187  1e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1937  hypothetical protein  50.26 
 
 
216 aa  187  1e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.370637  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0479  RecB family exonuclease  45.18 
 
 
234 aa  186  2e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.957708  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0605  CRISPR-associated exonuclease Cas4 family protein  45.15 
 
 
216 aa  186  2e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.452129 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1975  CRISPR-associated protein Cas4  45.87 
 
 
220 aa  184  9e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.360978  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2187  CRISPR-associated protein Cas4  43.12 
 
 
223 aa  181  9.000000000000001e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0494  CRISPR-associated exonuclease Cas4 family protein  44.74 
 
 
214 aa  178  7e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0832  CRISPR-associated exonuclease Cas4 family protein  44.65 
 
 
228 aa  175  4e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4331  CRISPR-associated Cas4 family protein  43.19 
 
 
222 aa  172  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000854832  normal  0.165932 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2723  CRISPR-associated Cas4 family protein  44.15 
 
 
208 aa  163  2.0000000000000002e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0822  CRISPR-associated protein Cas4  40.58 
 
 
206 aa  162  4.0000000000000004e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0652  CRISPR-associated Cas4 family protein  43.46 
 
 
210 aa  157  1e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.915701  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0235  CRISPR-associated Cas4 family protein  44.92 
 
 
211 aa  157  1e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2652  CRISPR-associated protein Cas4  41.58 
 
 
212 aa  154  7e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0303971  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3372  hypothetical protein  44.79 
 
 
218 aa  149  3e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3906  CRISPR-associated Cas4 family protein  40.87 
 
 
212 aa  144  8.000000000000001e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.164887  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1478  CRISPR-associated protein Cas4  41.12 
 
 
218 aa  140  1.9999999999999998e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.470243 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1155  CRISPR-associated Cas4 family protein  41.33 
 
 
212 aa  134  9e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4560  CRISPR-associated protein Cas4  34.36 
 
 
194 aa  134  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2233  CRISPR-associated Cas4 family protein  38.54 
 
 
205 aa  130  2.0000000000000002e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.874224  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4175  hypothetical protein  32.81 
 
 
196 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000176829 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1625  CRISPR-associated Cas1 family protein  34.76 
 
 
544 aa  112  4.0000000000000004e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.575155  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1717  CRISPR-associated protein Cas4  34.57 
 
 
200 aa  109  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    unclonable  2.73181e-25 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2461  CRISPR-associated protein Cas4  36.87 
 
 
196 aa  105  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.587961 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2974  CRISPR-associated protein Cas1  34.43 
 
 
545 aa  102  4e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2913  CRISPR-associated protein Cas1  35.35 
 
 
553 aa  99.4  4e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0184071  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0522  CRISPR-associated protein Cas4  31.61 
 
 
196 aa  97.4  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00230563  hitchhiker  0.00000101589 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0505  CRISPR-associated protein Cas4  31.61 
 
 
196 aa  97.8  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3345  CRISPR-associated Cas4 family protein  31.91 
 
 
221 aa  95.1  6e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0218123  normal  0.382188 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0057  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  33.84 
 
 
559 aa  92.8  3e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2433  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  32.49 
 
 
570 aa  93.2  3e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0199418  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3119  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  32.32 
 
 
550 aa  92.4  5e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00000141365  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1859  CRISPR-associated Cas4 family protein  30.27 
 
 
193 aa  90.9  1e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.343722  normal  0.533704 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3507  PE-PGRS family protein  32.31 
 
 
190 aa  89.4  4e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.366327 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4852  CRISPR-associated protein Cas1  28.77 
 
 
594 aa  82.8  0.000000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.464981  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1558  CRISPR-associated Cas4 family protein  27.13 
 
 
190 aa  72.4  0.000000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.681932  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1441  CRISPR-associated protein Cas1  30.7 
 
 
598 aa  71.2  0.00000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0376991  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5519  CRISPR-associated protein Cas1  29.74 
 
 
558 aa  69.3  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.28105 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3577  CRISPR-associated protein Cas4  27.47 
 
 
190 aa  67.8  0.0000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2343  hypothetical protein  24.64 
 
 
333 aa  56.6  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0179  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  24.64 
 
 
580 aa  57  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3305  CRISPR-associated Cas4 family protein  27.55 
 
 
198 aa  56.6  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.143494  normal  0.352212 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1872  CRISPR-associated Cas4 family protein  28.12 
 
 
198 aa  53.5  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0637  CRISPR-associated Cas4 family protein  25.39 
 
 
191 aa  46.2  0.0003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.042721  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1816  hypothetical protein  27.05 
 
 
170 aa  45.8  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.115857  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1287  CRISPR-associated Cas4 family protein  27.51 
 
 
190 aa  45.4  0.0006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.826986  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0565  CRISPR-associated protein Cas4  21.88 
 
 
202 aa  45.4  0.0007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.234335  normal  0.250424 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0728  CRISPR-associated Cas4 family protein  26.83 
 
 
172 aa  43.9  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2603  hypothetical protein  27.84 
 
 
170 aa  42  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.519513  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>