61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_3647 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_3647  CRISPR-associated protein Cas4  100 
 
 
225 aa  468  1.0000000000000001e-131  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2187  CRISPR-associated protein Cas4  86.04 
 
 
223 aa  408  1e-113  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1481  CRISPR-associated protein Cas4  68.78 
 
 
222 aa  350  1e-95  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1975  CRISPR-associated protein Cas4  51.6 
 
 
220 aa  256  1e-67  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.360978  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4331  CRISPR-associated Cas4 family protein  54.3 
 
 
222 aa  251  5.000000000000001e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000854832  normal  0.165932 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0479  RecB family exonuclease  50.45 
 
 
234 aa  219  3e-56  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.957708  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0851  CRISPR-associated exonuclease Cas4 family protein  49.25 
 
 
224 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1006  CRISPR-associated Cas4 family protein  45.25 
 
 
219 aa  205  5e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1432  CRISPR-associated Cas4 family protein  45.5 
 
 
214 aa  191  7e-48  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.343364  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1006  hypothetical protein  44.59 
 
 
215 aa  190  1e-47  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0356084  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1299  hypothetical protein  44.59 
 
 
214 aa  187  1e-46  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.938866  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1661  CRISPR-associated protein Cas4  46.19 
 
 
214 aa  186  3e-46  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.975016  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2974  CRISPR-associated Cas4 family protein  42.41 
 
 
212 aa  166  2.9999999999999998e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.948346  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0605  CRISPR-associated exonuclease Cas4 family protein  39.17 
 
 
216 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.452129 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02697  crispr-associated protein Cas4  38.53 
 
 
210 aa  162  3e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.463213  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3523  CRISPR-associated exonuclease Cas4 family protein  42.21 
 
 
218 aa  157  1e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0793  CRISPR-associated protein Cas4  40.09 
 
 
209 aa  155  4e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.813459  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1975  CRISPR-associated protein Cas4  41.41 
 
 
255 aa  155  7e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1632  CRISPR-associated protein Cas4  38.65 
 
 
218 aa  154  2e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.98908 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31590  CRISPR-associated protein Cas4  40.48 
 
 
199 aa  153  2e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1937  hypothetical protein  40.57 
 
 
216 aa  145  3e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.370637  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0832  CRISPR-associated exonuclease Cas4 family protein  38.79 
 
 
228 aa  144  8.000000000000001e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2652  CRISPR-associated protein Cas4  34.29 
 
 
212 aa  139  3e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0303971  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0494  CRISPR-associated exonuclease Cas4 family protein  36 
 
 
214 aa  138  6e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0652  CRISPR-associated Cas4 family protein  35.21 
 
 
210 aa  132  3e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.915701  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1070  hypothetical protein  35.71 
 
 
204 aa  131  9e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0265039 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2723  CRISPR-associated Cas4 family protein  34.18 
 
 
208 aa  123  2e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0235  CRISPR-associated Cas4 family protein  36.04 
 
 
211 aa  119  4.9999999999999996e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0822  CRISPR-associated protein Cas4  33.33 
 
 
206 aa  118  6e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3906  CRISPR-associated Cas4 family protein  34.95 
 
 
212 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.164887  n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4560  CRISPR-associated protein Cas4  31.82 
 
 
194 aa  112  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2233  CRISPR-associated Cas4 family protein  33.33 
 
 
205 aa  109  4.0000000000000004e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.874224  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3372  hypothetical protein  34.45 
 
 
218 aa  107  1e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1155  CRISPR-associated Cas4 family protein  36.41 
 
 
212 aa  104  1e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1478  CRISPR-associated protein Cas4  34.13 
 
 
218 aa  102  4e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.470243 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3345  CRISPR-associated Cas4 family protein  27.64 
 
 
221 aa  99  6e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0218123  normal  0.382188 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4175  hypothetical protein  29.23 
 
 
196 aa  98.6  8e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000176829 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0505  CRISPR-associated protein Cas4  31.5 
 
 
196 aa  96.3  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0522  CRISPR-associated protein Cas4  31.5 
 
 
196 aa  96.3  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00230563  hitchhiker  0.00000101589 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1717  CRISPR-associated protein Cas4  27.55 
 
 
200 aa  94.7  9e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    unclonable  2.73181e-25 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2461  CRISPR-associated protein Cas4  27.57 
 
 
196 aa  87.8  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.587961 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2974  CRISPR-associated protein Cas1  29.53 
 
 
545 aa  84  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3507  PE-PGRS family protein  27.94 
 
 
190 aa  82.8  0.000000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.366327 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1625  CRISPR-associated Cas1 family protein  29.95 
 
 
544 aa  82  0.000000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.575155  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2913  CRISPR-associated protein Cas1  26.7 
 
 
553 aa  76.6  0.0000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0184071  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1558  CRISPR-associated Cas4 family protein  25.63 
 
 
190 aa  67  0.0000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.681932  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1859  CRISPR-associated Cas4 family protein  25.13 
 
 
193 aa  66.6  0.0000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.343722  normal  0.533704 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1441  CRISPR-associated protein Cas1  24.23 
 
 
598 aa  66.2  0.0000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0376991  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3119  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  27.62 
 
 
550 aa  65.9  0.0000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00000141365  normal 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5519  CRISPR-associated protein Cas1  28.43 
 
 
558 aa  64.7  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.28105 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2433  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  27.36 
 
 
570 aa  64.3  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0199418  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0057  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  26.92 
 
 
559 aa  63.5  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3577  CRISPR-associated protein Cas4  25 
 
 
190 aa  55.5  0.0000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2343  hypothetical protein  25 
 
 
333 aa  51.6  0.000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0179  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  24.53 
 
 
580 aa  49.7  0.00004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3220  CRISPR-associated Cas4 family protein  24.88 
 
 
204 aa  49.3  0.00005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.680334  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4852  CRISPR-associated protein Cas1  20.47 
 
 
594 aa  47.4  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.464981  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0728  CRISPR-associated Cas4 family protein  30.3 
 
 
172 aa  44.3  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2517  hypothetical protein  25.13 
 
 
168 aa  43.1  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0774  CRISPR-associated exonuclease Cas4 family protein  21.84 
 
 
206 aa  43.5  0.003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.356687  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3305  CRISPR-associated Cas4 family protein  24.81 
 
 
198 aa  42  0.007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.143494  normal  0.352212 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>