66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1478 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_1478  CRISPR-associated protein Cas4  100 
 
 
218 aa  439  9.999999999999999e-123  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.470243 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3372  hypothetical protein  87.08 
 
 
218 aa  369  1e-101  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0652  CRISPR-associated Cas4 family protein  53.48 
 
 
210 aa  187  1e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.915701  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0235  CRISPR-associated Cas4 family protein  53.69 
 
 
211 aa  185  4e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1070  hypothetical protein  47.89 
 
 
204 aa  177  9e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0265039 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0494  CRISPR-associated exonuclease Cas4 family protein  48.13 
 
 
214 aa  177  1e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3906  CRISPR-associated Cas4 family protein  48.97 
 
 
212 aa  175  5e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.164887  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1155  CRISPR-associated Cas4 family protein  50.75 
 
 
212 aa  167  1e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0822  CRISPR-associated protein Cas4  47.31 
 
 
206 aa  167  1e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2723  CRISPR-associated Cas4 family protein  44.97 
 
 
208 aa  166  4e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2652  CRISPR-associated protein Cas4  45.95 
 
 
212 aa  158  7e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0303971  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02697  crispr-associated protein Cas4  46.56 
 
 
210 aa  154  9e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.463213  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31590  CRISPR-associated protein Cas4  46.23 
 
 
199 aa  151  7e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4175  hypothetical protein  38.27 
 
 
196 aa  147  1.0000000000000001e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000176829 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0832  CRISPR-associated exonuclease Cas4 family protein  45.32 
 
 
228 aa  146  3e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1632  CRISPR-associated protein Cas4  44.06 
 
 
218 aa  145  7.0000000000000006e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.98908 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1006  hypothetical protein  40.4 
 
 
215 aa  144  1e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0356084  n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4560  CRISPR-associated protein Cas4  35.05 
 
 
194 aa  144  1e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2974  CRISPR-associated Cas4 family protein  47.15 
 
 
212 aa  142  4e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.948346  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3523  CRISPR-associated exonuclease Cas4 family protein  42.29 
 
 
218 aa  141  9e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1432  CRISPR-associated Cas4 family protein  41.12 
 
 
214 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.343364  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1975  CRISPR-associated protein Cas4  44.51 
 
 
255 aa  137  8.999999999999999e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1299  hypothetical protein  39.8 
 
 
214 aa  136  2e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.938866  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1937  hypothetical protein  44.66 
 
 
216 aa  137  2e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.370637  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1661  CRISPR-associated protein Cas4  43.01 
 
 
214 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.975016  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0793  CRISPR-associated protein Cas4  47.28 
 
 
209 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.813459  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0605  CRISPR-associated exonuclease Cas4 family protein  39.9 
 
 
216 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.452129 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2233  CRISPR-associated Cas4 family protein  41.62 
 
 
205 aa  127  2.0000000000000002e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.874224  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3345  CRISPR-associated Cas4 family protein  38.66 
 
 
221 aa  121  8e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0218123  normal  0.382188 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1625  CRISPR-associated Cas1 family protein  36.7 
 
 
544 aa  120  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.575155  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2461  CRISPR-associated protein Cas4  38.5 
 
 
196 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.587961 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1006  CRISPR-associated Cas4 family protein  35.78 
 
 
219 aa  119  3.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4331  CRISPR-associated Cas4 family protein  36.27 
 
 
222 aa  117  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000854832  normal  0.165932 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1717  CRISPR-associated protein Cas4  36.9 
 
 
200 aa  114  7.999999999999999e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    unclonable  2.73181e-25 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0479  RecB family exonuclease  35.94 
 
 
234 aa  114  1.0000000000000001e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.957708  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0057  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  38.54 
 
 
559 aa  113  2.0000000000000002e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0851  CRISPR-associated exonuclease Cas4 family protein  34.48 
 
 
224 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3507  PE-PGRS family protein  38.3 
 
 
190 aa  112  3e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.366327 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0505  CRISPR-associated protein Cas4  34.74 
 
 
196 aa  111  9e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0522  CRISPR-associated protein Cas4  34.74 
 
 
196 aa  110  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00230563  hitchhiker  0.00000101589 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2433  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  37.85 
 
 
570 aa  108  8.000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0199418  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2913  CRISPR-associated protein Cas1  38.22 
 
 
553 aa  106  2e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0184071  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2974  CRISPR-associated protein Cas1  37.7 
 
 
545 aa  107  2e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2187  CRISPR-associated protein Cas4  33.81 
 
 
223 aa  102  4e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3647  CRISPR-associated protein Cas4  34.13 
 
 
225 aa  102  4e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1481  CRISPR-associated protein Cas4  31.66 
 
 
222 aa  100  1e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2343  hypothetical protein  38.86 
 
 
333 aa  99.8  3e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0179  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  38.34 
 
 
580 aa  98.2  9e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1975  CRISPR-associated protein Cas4  33.67 
 
 
220 aa  97.4  2e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.360978  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3119  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  31.34 
 
 
550 aa  94.7  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00000141365  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1441  CRISPR-associated protein Cas1  31.94 
 
 
598 aa  91.3  1e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0376991  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4852  CRISPR-associated protein Cas1  32.72 
 
 
594 aa  89.4  3e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.464981  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1859  CRISPR-associated Cas4 family protein  29.29 
 
 
193 aa  83.2  0.000000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.343722  normal  0.533704 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1558  CRISPR-associated Cas4 family protein  27.86 
 
 
190 aa  75.5  0.0000000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.681932  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1287  CRISPR-associated Cas4 family protein  28.87 
 
 
190 aa  64.3  0.000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.826986  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1872  CRISPR-associated Cas4 family protein  29.38 
 
 
198 aa  57.4  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2841  CRISPR-associated protein Cas1  28.18 
 
 
525 aa  55.5  0.0000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00141566  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3577  CRISPR-associated protein Cas4  26.92 
 
 
190 aa  55.1  0.0000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3305  CRISPR-associated Cas4 family protein  31.2 
 
 
198 aa  55.1  0.0000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.143494  normal  0.352212 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1765  CRISPR-associated protein Cas4  31.15 
 
 
189 aa  54.3  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5519  CRISPR-associated protein Cas1  27.09 
 
 
558 aa  53.9  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.28105 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0565  CRISPR-associated protein Cas4  27.55 
 
 
202 aa  49.7  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.234335  normal  0.250424 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1076  CRISPR-associated Cas4 family protein  21.54 
 
 
197 aa  46.6  0.0003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3220  CRISPR-associated Cas4 family protein  26.56 
 
 
204 aa  43.5  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.680334  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1816  hypothetical protein  31.3 
 
 
170 aa  43.5  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.115857  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0952  hypothetical protein  30.7 
 
 
263 aa  41.6  0.01  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>