68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_3507 on replicon NC_014213
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014213  Mesil_3507  PE-PGRS family protein  100 
 
 		 190 aa  384  1e-106  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.366327 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2461  CRISPR-associated protein Cas4  42.02 
 
 		 196 aa  135  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.587961 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0505  CRISPR-associated protein Cas4  38.83 
 
 		 196 aa  134  7.000000000000001e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0522  CRISPR-associated protein Cas4  38.83 
 
 		 196 aa  134  9e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00230563  hitchhiker  0.00000101589 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1717  CRISPR-associated protein Cas4  37.43 
 
 		 200 aa  130  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    unclonable  2.73181e-25 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3372  hypothetical protein  40.21 
 
 		 218 aa  117  7.999999999999999e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0652  CRISPR-associated Cas4 family protein  38.02 
 
 		 210 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.915701  n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4560  CRISPR-associated protein Cas4  33.16 
 
 		 194 aa  115  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2233  CRISPR-associated Cas4 family protein  37.43 
 
 		 205 aa  114  8.999999999999998e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.874224  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1478  CRISPR-associated protein Cas4  38.3 
 
 		 218 aa  112  3e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.470243 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31590  CRISPR-associated protein Cas4  35.6 
 
 		 199 aa  111  8.000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1625  CRISPR-associated Cas1 family protein  38.5 
 
 		 544 aa  110  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.575155  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0494  CRISPR-associated exonuclease Cas4 family protein  34.03 
 
 		 214 aa  108  6e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0605  CRISPR-associated exonuclease Cas4 family protein  34.17 
 
 		 216 aa  106  2e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.452129 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4175  hypothetical protein  33.16 
 
 		 196 aa  102  3e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000176829 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2652  CRISPR-associated protein Cas4  32.98 
 
 		 212 aa  101  6e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0303971  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3906  CRISPR-associated Cas4 family protein  36.08 
 
 		 212 aa  101  7e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.164887  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02697  crispr-associated protein Cas4  33.16 
 
 		 210 aa  100  1e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.463213  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2913  CRISPR-associated protein Cas1  33.33 
 
 		 553 aa  100  1e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0184071  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2723  CRISPR-associated Cas4 family protein  33.33 
 
 		 208 aa  97.8  9e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0822  CRISPR-associated protein Cas4  34.55 
 
 		 206 aa  94.7  6e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1006  hypothetical protein  34.69 
 
 		 215 aa  94  1e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0356084  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2974  CRISPR-associated protein Cas1  35.16 
 
 		 545 aa  93.2  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1975  CRISPR-associated protein Cas4  34.17 
 
 		 255 aa  92.4  3e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1481  CRISPR-associated protein Cas4  29.41 
 
 		 222 aa  91.7  5e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1661  CRISPR-associated protein Cas4  33.84 
 
 		 214 aa  91.3  8e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.975016  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1070  hypothetical protein  34.39 
 
 		 204 aa  91.3  8e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0265039 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0235  CRISPR-associated Cas4 family protein  38.3 
 
 		 211 aa  90.5  1e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1432  CRISPR-associated Cas4 family protein  32.31 
 
 		 214 aa  89.4  3e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.343364  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3523  CRISPR-associated exonuclease Cas4 family protein  35.23 
 
 		 218 aa  89  4e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1006  CRISPR-associated Cas4 family protein  33.67 
 
 		 219 aa  87  1e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1975  CRISPR-associated protein Cas4  33.49 
 
 		 220 aa  86.7  2e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.360978  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0057  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  35.57 
 
 		 559 aa  85.1  5e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2187  CRISPR-associated protein Cas4  29.56 
 
 		 223 aa  84.3  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1632  CRISPR-associated protein Cas4  33.66 
 
 		 218 aa  83.2  0.000000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.98908 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0832  CRISPR-associated exonuclease Cas4 family protein  30.61 
 
 		 228 aa  82.8  0.000000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3647  CRISPR-associated protein Cas4  27.94 
 
 		 225 aa  82.8  0.000000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1299  hypothetical protein  30.37 
 
 		 214 aa  82.4  0.000000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.938866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1859  CRISPR-associated Cas4 family protein  31.07 
 
 		 193 aa  82.8  0.000000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.343722  normal  0.533704 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1558  CRISPR-associated Cas4 family protein  28.49 
 
 		 190 aa  82.8  0.000000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.681932  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3345  CRISPR-associated Cas4 family protein  31.61 
 
 		 221 aa  82  0.000000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0218123  normal  0.382188 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1155  CRISPR-associated Cas4 family protein  33.84 
 
 		 212 aa  80.5  0.00000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3119  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  27.98 
 
 		 550 aa  79.7  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00000141365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1937  hypothetical protein  33.5 
 
 		 216 aa  80.1  0.00000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.370637  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2974  CRISPR-associated Cas4 family protein  33.86 
 
 		 212 aa  79.7  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.948346  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3577  CRISPR-associated protein Cas4  30.11 
 
 		 190 aa  77.4  0.0000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0851  CRISPR-associated exonuclease Cas4 family protein  28.99 
 
 		 224 aa  76.6  0.0000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0479  RecB family exonuclease  29.56 
 
 		 234 aa  75.5  0.0000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.957708  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4852  CRISPR-associated protein Cas1  28.85 
 
 		 594 aa  75.1  0.0000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.464981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4331  CRISPR-associated Cas4 family protein  30.96 
 
 		 222 aa  73.9  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000854832  normal  0.165932 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0793  CRISPR-associated protein Cas4  33.33 
 
 		 209 aa  72.4  0.000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.813459  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1441  CRISPR-associated protein Cas1  29.05 
 
 		 598 aa  72  0.000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0376991  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5519  CRISPR-associated protein Cas1  29.44 
 
 		 558 aa  71.2  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.28105 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2433  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  31 
 
 		 570 aa  71.2  0.000000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0199418  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2343  hypothetical protein  29.5 
 
 		 333 aa  63.2  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0179  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  29.5 
 
 		 580 aa  63.5  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1872  CRISPR-associated Cas4 family protein  28.12 
 
 		 198 aa  61.2  0.000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1287  CRISPR-associated Cas4 family protein  26.88 
 
 		 190 aa  55.5  0.0000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.826986  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3305  CRISPR-associated Cas4 family protein  26.87 
 
 		 198 aa  53.9  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.143494  normal  0.352212 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1076  CRISPR-associated Cas4 family protein  22.56 
 
 		 197 aa  53.5  0.000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0672  CRISPR-associated protein Cas4  24.26 
 
 		 169 aa  50.1  0.00002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5083  CRISPR-associated Cas4 family protein  25.52 
 
 		 197 aa  48.9  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0536  protein of unknown function DUF83  31.45 
 
 		 170 aa  47.8  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0513907  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0565  CRISPR-associated protein Cas4  22.11 
 
 		 202 aa  46.6  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.234335  normal  0.250424 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0309  CRISPR-associated protein Cas4  27.78 
 
 		 165 aa  45.8  0.0004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6022  CRISPR-associated protein Cas4  25 
 
 		 195 aa  45.4  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.318812  normal  0.45154 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1765  CRISPR-associated protein Cas4  25.54 
 
 		 189 aa  45.4  0.0005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1816  hypothetical protein  33.61 
 
 		 170 aa  43.9  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.115857  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>