56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3345 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_3345  CRISPR-associated Cas4 family protein  100 
 
 		 221 aa  452  1.0000000000000001e-126  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0218123  normal  0.382188 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2652  CRISPR-associated protein Cas4  43.55 
 
 		 212 aa  141  7e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0303971  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0652  CRISPR-associated Cas4 family protein  37.93 
 
 		 210 aa  131  7.999999999999999e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.915701  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0822  CRISPR-associated protein Cas4  40.76 
 
 		 206 aa  131  7.999999999999999e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0494  CRISPR-associated exonuclease Cas4 family protein  38.71 
 
 		 214 aa  129  3e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1070  hypothetical protein  39.01 
 
 		 204 aa  128  5.0000000000000004e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0265039 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3372  hypothetical protein  38.5 
 
 		 218 aa  128  8.000000000000001e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2723  CRISPR-associated Cas4 family protein  35.82 
 
 		 208 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3906  CRISPR-associated Cas4 family protein  36.84 
 
 		 212 aa  124  1e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.164887  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1478  CRISPR-associated protein Cas4  38.66 
 
 		 218 aa  121  8e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.470243 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1006  CRISPR-associated Cas4 family protein  31.53 
 
 		 219 aa  119  3e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1975  CRISPR-associated protein Cas4  34.33 
 
 		 220 aa  110  1.0000000000000001e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.360978  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1155  CRISPR-associated Cas4 family protein  40.74 
 
 		 212 aa  109  3e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0605  CRISPR-associated exonuclease Cas4 family protein  33 
 
 		 216 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.452129 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31590  CRISPR-associated protein Cas4  36.22 
 
 		 199 aa  107  1e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1299  hypothetical protein  32.98 
 
 		 214 aa  106  2e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.938866  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1632  CRISPR-associated protein Cas4  36.02 
 
 		 218 aa  106  3e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.98908 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0235  CRISPR-associated Cas4 family protein  32.84 
 
 		 211 aa  102  3e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1481  CRISPR-associated protein Cas4  29.15 
 
 		 222 aa  102  4e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1975  CRISPR-associated protein Cas4  33.52 
 
 		 255 aa  102  5e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1661  CRISPR-associated protein Cas4  32.8 
 
 		 214 aa  101  8e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.975016  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2187  CRISPR-associated protein Cas4  28.64 
 
 		 223 aa  101  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0479  RecB family exonuclease  30.69 
 
 		 234 aa  100  2e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.957708  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3523  CRISPR-associated exonuclease Cas4 family protein  30.62 
 
 		 218 aa  99.8  3e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1937  hypothetical protein  37.31 
 
 		 216 aa  99.8  3e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.370637  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3647  CRISPR-associated protein Cas4  27.64 
 
 		 225 aa  99  6e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4560  CRISPR-associated protein Cas4  30.27 
 
 		 194 aa  98.6  7e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4331  CRISPR-associated Cas4 family protein  33.5 
 
 		 222 aa  98.2  9e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000854832  normal  0.165932 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1006  hypothetical protein  32.8 
 
 		 215 aa  96.7  3e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0356084  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1432  CRISPR-associated Cas4 family protein  31.91 
 
 		 214 aa  95.1  7e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.343364  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02697  crispr-associated protein Cas4  34.03 
 
 		 210 aa  94  2e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.463213  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0851  CRISPR-associated exonuclease Cas4 family protein  24.89 
 
 		 224 aa  93.6  2e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0832  CRISPR-associated exonuclease Cas4 family protein  33.68 
 
 		 228 aa  89.7  3e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4175  hypothetical protein  28.96 
 
 		 196 aa  89.4  4e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000176829 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2974  CRISPR-associated Cas4 family protein  35.83 
 
 		 212 aa  89.4  4e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.948346  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0793  CRISPR-associated protein Cas4  34.78 
 
 		 209 aa  89.4  4e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.813459  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1717  CRISPR-associated protein Cas4  30.27 
 
 		 200 aa  86.7  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    unclonable  2.73181e-25 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0505  CRISPR-associated protein Cas4  29.89 
 
 		 196 aa  86.3  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0522  CRISPR-associated protein Cas4  29.89 
 
 		 196 aa  85.9  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00230563  hitchhiker  0.00000101589 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1441  CRISPR-associated protein Cas1  30.66 
 
 		 598 aa  85.1  7e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0376991  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3507  PE-PGRS family protein  31.61 
 
 		 190 aa  82  0.000000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.366327 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2233  CRISPR-associated Cas4 family protein  29.89 
 
 		 205 aa  82.4  0.000000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.874224  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2343  hypothetical protein  33.17 
 
 		 333 aa  76.3  0.0000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0179  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  33.17 
 
 		 580 aa  75.5  0.0000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0057  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  29.95 
 
 		 559 aa  74.7  0.0000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2974  CRISPR-associated protein Cas1  27.83 
 
 		 545 aa  73.9  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1625  CRISPR-associated Cas1 family protein  26.37 
 
 		 544 aa  73.9  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.575155  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4852  CRISPR-associated protein Cas1  29.91 
 
 		 594 aa  72  0.000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.464981  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2461  CRISPR-associated protein Cas4  28.96 
 
 		 196 aa  70.5  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.587961 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2433  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  27.14 
 
 		 570 aa  67  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0199418  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3119  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  24.24 
 
 		 550 aa  66.6  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00000141365  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1558  CRISPR-associated Cas4 family protein  22.84 
 
 		 190 aa  62  0.000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.681932  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1859  CRISPR-associated Cas4 family protein  25.51 
 
 		 193 aa  61.6  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.343722  normal  0.533704 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2913  CRISPR-associated protein Cas1  26.37 
 
 		 553 aa  51.6  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0184071  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3577  CRISPR-associated protein Cas4  20.65 
 
 		 190 aa  48.5  0.00008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5519  CRISPR-associated protein Cas1  23.79 
 
 		 558 aa  44.3  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.28105 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>