62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_3523 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_3523  CRISPR-associated exonuclease Cas4 family protein  100 
 
 		 218 aa  454  1e-127  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02697  crispr-associated protein Cas4  56.84 
 
 		 210 aa  204  8e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.463213  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1975  CRISPR-associated protein Cas4  51.31 
 
 		 255 aa  198  5e-50  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1432  CRISPR-associated Cas4 family protein  49.02 
 
 		 214 aa  197  7.999999999999999e-50  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.343364  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1632  CRISPR-associated protein Cas4  52.24 
 
 		 218 aa  197  9e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.98908 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31590  CRISPR-associated protein Cas4  51.49 
 
 		 199 aa  196  3e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1299  hypothetical protein  48.44 
 
 		 214 aa  190  1e-47  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.938866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1006  hypothetical protein  49.74 
 
 		 215 aa  190  1e-47  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0356084  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1661  CRISPR-associated protein Cas4  47.92 
 
 		 214 aa  184  7e-46  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.975016  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2974  CRISPR-associated Cas4 family protein  47.06 
 
 		 212 aa  182  4.0000000000000006e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.948346  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0832  CRISPR-associated exonuclease Cas4 family protein  51.34 
 
 		 228 aa  181  5.0000000000000004e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0793  CRISPR-associated protein Cas4  52.66 
 
 		 209 aa  181  9.000000000000001e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.813459  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0605  CRISPR-associated exonuclease Cas4 family protein  46.34 
 
 		 216 aa  180  2e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.452129 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1937  hypothetical protein  47.98 
 
 		 216 aa  165  5.9999999999999996e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.370637  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4331  CRISPR-associated Cas4 family protein  44.22 
 
 		 222 aa  162  3e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000854832  normal  0.165932 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2187  CRISPR-associated protein Cas4  43.5 
 
 		 223 aa  157  1e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3647  CRISPR-associated protein Cas4  42.21 
 
 		 225 aa  157  1e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1481  CRISPR-associated protein Cas4  40.39 
 
 		 222 aa  156  3e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0479  RecB family exonuclease  41.47 
 
 		 234 aa  155  6e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.957708  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1975  CRISPR-associated protein Cas4  41.15 
 
 		 220 aa  154  1e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.360978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1006  CRISPR-associated Cas4 family protein  43.75 
 
 		 219 aa  154  1e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0822  CRISPR-associated protein Cas4  40.86 
 
 		 206 aa  153  2e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0851  CRISPR-associated exonuclease Cas4 family protein  42.36 
 
 		 224 aa  152  5e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1070  hypothetical protein  42.39 
 
 		 204 aa  151  7e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0265039 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0652  CRISPR-associated Cas4 family protein  43.59 
 
 		 210 aa  151  7e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.915701  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0494  CRISPR-associated exonuclease Cas4 family protein  40.21 
 
 		 214 aa  150  2e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2652  CRISPR-associated protein Cas4  40 
 
 		 212 aa  147  1.0000000000000001e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0303971  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3906  CRISPR-associated Cas4 family protein  41.71 
 
 		 212 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.164887  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3372  hypothetical protein  44 
 
 		 218 aa  147  2.0000000000000003e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2723  CRISPR-associated Cas4 family protein  40.31 
 
 		 208 aa  143  2e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1478  CRISPR-associated protein Cas4  42.29 
 
 		 218 aa  141  9e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.470243 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1155  CRISPR-associated Cas4 family protein  42.35 
 
 		 212 aa  132  3e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4560  CRISPR-associated protein Cas4  34.2 
 
 		 194 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0235  CRISPR-associated Cas4 family protein  41.18 
 
 		 211 aa  127  1.0000000000000001e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4175  hypothetical protein  34.72 
 
 		 196 aa  123  2e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000176829 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2233  CRISPR-associated Cas4 family protein  37.56 
 
 		 205 aa  108  5e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.874224  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3345  CRISPR-associated Cas4 family protein  30.62 
 
 		 221 aa  99.8  3e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0218123  normal  0.382188 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3119  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  31.9 
 
 		 550 aa  95.1  8e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00000141365  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2974  CRISPR-associated protein Cas1  31.52 
 
 		 545 aa  91.3  1e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1625  CRISPR-associated Cas1 family protein  30 
 
 		 544 aa  90.5  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.575155  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2433  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  33.8 
 
 		 570 aa  89.4  4e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0199418  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3507  PE-PGRS family protein  35.23 
 
 		 190 aa  89  5e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.366327 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0057  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  34.27 
 
 		 559 aa  88.2  9e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2913  CRISPR-associated protein Cas1  31.48 
 
 		 553 aa  85.9  5e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0184071  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1441  CRISPR-associated protein Cas1  28.88 
 
 		 598 aa  80.9  0.00000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0376991  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0505  CRISPR-associated protein Cas4  30.26 
 
 		 196 aa  81.3  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0522  CRISPR-associated protein Cas4  30.26 
 
 		 196 aa  80.9  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00230563  hitchhiker  0.00000101589 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4852  CRISPR-associated protein Cas1  30.43 
 
 		 594 aa  79.7  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.464981  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2461  CRISPR-associated protein Cas4  32.64 
 
 		 196 aa  79  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.587961 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1717  CRISPR-associated protein Cas4  30.48 
 
 		 200 aa  78.6  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    unclonable  2.73181e-25 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1859  CRISPR-associated Cas4 family protein  30 
 
 		 193 aa  70.9  0.00000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.343722  normal  0.533704 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3305  CRISPR-associated Cas4 family protein  32.31 
 
 		 198 aa  68.2  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.143494  normal  0.352212 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1558  CRISPR-associated Cas4 family protein  27.37 
 
 		 190 aa  62.4  0.000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.681932  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1872  CRISPR-associated Cas4 family protein  30.77 
 
 		 198 aa  61.2  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2343  hypothetical protein  28.43 
 
 		 333 aa  58.5  0.00000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0179  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  28.43 
 
 		 580 aa  58.2  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5519  CRISPR-associated protein Cas1  28.08 
 
 		 558 aa  56.2  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.28105 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3577  CRISPR-associated protein Cas4  25.4 
 
 		 190 aa  51.6  0.000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0565  CRISPR-associated protein Cas4  25.25 
 
 		 202 aa  50.8  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.234335  normal  0.250424 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1816  hypothetical protein  27.56 
 
 		 170 aa  45.4  0.0007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.115857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0728  CRISPR-associated Cas4 family protein  30.77 
 
 		 172 aa  44.3  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2603  hypothetical protein  25.98 
 
 		 170 aa  44.3  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.519513  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>