60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0479 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_0479  RecB family exonuclease  100 
 
 		 234 aa  481  1e-135  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.957708  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2187  CRISPR-associated protein Cas4  52.04 
 
 		 223 aa  229  2e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1481  CRISPR-associated protein Cas4  50.45 
 
 		 222 aa  224  9e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3647  CRISPR-associated protein Cas4  50.45 
 
 		 225 aa  219  3e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1975  CRISPR-associated protein Cas4  49.77 
 
 		 220 aa  213  1.9999999999999998e-54  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.360978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2974  CRISPR-associated Cas4 family protein  49.53 
 
 		 212 aa  206  3e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.948346  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4331  CRISPR-associated Cas4 family protein  46.64 
 
 		 222 aa  206  4e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000854832  normal  0.165932 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1006  CRISPR-associated Cas4 family protein  43.95 
 
 		 219 aa  194  8.000000000000001e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1006  hypothetical protein  46.4 
 
 		 215 aa  191  8e-48  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0356084  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0851  CRISPR-associated exonuclease Cas4 family protein  42.92 
 
 		 224 aa  189  2e-47  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1432  CRISPR-associated Cas4 family protein  45.18 
 
 		 214 aa  186  3e-46  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.343364  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1299  hypothetical protein  43.24 
 
 		 214 aa  180  1e-44  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.938866  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1661  CRISPR-associated protein Cas4  43.24 
 
 		 214 aa  168  6e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.975016  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0793  CRISPR-associated protein Cas4  43.26 
 
 		 209 aa  159  3e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.813459  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1975  CRISPR-associated protein Cas4  43.78 
 
 		 255 aa  158  6e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1632  CRISPR-associated protein Cas4  43 
 
 		 218 aa  157  1e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.98908 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3523  CRISPR-associated exonuclease Cas4 family protein  41.47 
 
 		 218 aa  155  7e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31590  CRISPR-associated protein Cas4  40.38 
 
 		 199 aa  154  2e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02697  crispr-associated protein Cas4  39.25 
 
 		 210 aa  153  2e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.463213  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0832  CRISPR-associated exonuclease Cas4 family protein  38.53 
 
 		 228 aa  151  8.999999999999999e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0605  CRISPR-associated exonuclease Cas4 family protein  40.28 
 
 		 216 aa  150  2e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.452129 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1937  hypothetical protein  38.58 
 
 		 216 aa  136  4e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.370637  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0494  CRISPR-associated exonuclease Cas4 family protein  37.98 
 
 		 214 aa  134  9.999999999999999e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0652  CRISPR-associated Cas4 family protein  38.42 
 
 		 210 aa  131  6.999999999999999e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.915701  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1070  hypothetical protein  38.19 
 
 		 204 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0265039 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2652  CRISPR-associated protein Cas4  35.29 
 
 		 212 aa  125  5e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0303971  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2723  CRISPR-associated Cas4 family protein  36.68 
 
 		 208 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3906  CRISPR-associated Cas4 family protein  34.78 
 
 		 212 aa  118  9e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.164887  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1478  CRISPR-associated protein Cas4  35.94 
 
 		 218 aa  114  1.0000000000000001e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.470243 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0822  CRISPR-associated protein Cas4  34.33 
 
 		 206 aa  114  2.0000000000000002e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3372  hypothetical protein  34.3 
 
 		 218 aa  107  1e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2233  CRISPR-associated Cas4 family protein  32.16 
 
 		 205 aa  107  1e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.874224  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0235  CRISPR-associated Cas4 family protein  33.99 
 
 		 211 aa  104  1e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1155  CRISPR-associated Cas4 family protein  33.5 
 
 		 212 aa  104  2e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4560  CRISPR-associated protein Cas4  31.25 
 
 		 194 aa  101  8e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3345  CRISPR-associated Cas4 family protein  30.69 
 
 		 221 aa  100  2e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0218123  normal  0.382188 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4175  hypothetical protein  32.18 
 
 		 196 aa  100  3e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000176829 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1625  CRISPR-associated Cas1 family protein  32.67 
 
 		 544 aa  87.8  1e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.575155  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1717  CRISPR-associated protein Cas4  29.15 
 
 		 200 aa  82  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    unclonable  2.73181e-25 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2433  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  30.77 
 
 		 570 aa  80.1  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0199418  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0505  CRISPR-associated protein Cas4  29.15 
 
 		 196 aa  78.6  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0522  CRISPR-associated protein Cas4  29.15 
 
 		 196 aa  78.6  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00230563  hitchhiker  0.00000101589 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2913  CRISPR-associated protein Cas1  26.89 
 
 		 553 aa  76.3  0.0000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0184071  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3507  PE-PGRS family protein  29.56 
 
 		 190 aa  75.5  0.0000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.366327 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2461  CRISPR-associated protein Cas4  27.27 
 
 		 196 aa  72.4  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.587961 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1441  CRISPR-associated protein Cas1  24.67 
 
 		 598 aa  71.6  0.00000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0376991  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0057  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  29.76 
 
 		 559 aa  69.7  0.00000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2974  CRISPR-associated protein Cas1  29.56 
 
 		 545 aa  67.8  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3119  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  25.12 
 
 		 550 aa  65.9  0.0000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00000141365  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4852  CRISPR-associated protein Cas1  25.68 
 
 		 594 aa  64.7  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.464981  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1859  CRISPR-associated Cas4 family protein  26.26 
 
 		 193 aa  62.4  0.000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.343722  normal  0.533704 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1558  CRISPR-associated Cas4 family protein  26.5 
 
 		 190 aa  58.5  0.00000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.681932  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3305  CRISPR-associated Cas4 family protein  29.63 
 
 		 198 aa  57.8  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.143494  normal  0.352212 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1872  CRISPR-associated Cas4 family protein  28.89 
 
 		 198 aa  56.2  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0565  CRISPR-associated protein Cas4  26.12 
 
 		 202 aa  53.5  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.234335  normal  0.250424 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2343  hypothetical protein  25.58 
 
 		 333 aa  51.2  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3577  CRISPR-associated protein Cas4  25 
 
 		 190 aa  50.8  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0179  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  31.37 
 
 		 580 aa  50.8  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5083  CRISPR-associated Cas4 family protein  24.21 
 
 		 197 aa  42.4  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5519  CRISPR-associated protein Cas1  23.41 
 
 		 558 aa  41.6  0.01  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.28105 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>