78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA0652 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA0652  CRISPR-associated Cas4 family protein  100 
 
 		 210 aa  425  1e-118  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.915701  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0822  CRISPR-associated protein Cas4  53.92 
 
 		 206 aa  223  1e-57  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3906  CRISPR-associated Cas4 family protein  51.64 
 
 		 212 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.164887  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0494  CRISPR-associated exonuclease Cas4 family protein  53.85 
 
 		 214 aa  212  2.9999999999999995e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1155  CRISPR-associated Cas4 family protein  51.67 
 
 		 212 aa  201  5e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1478  CRISPR-associated protein Cas4  53.48 
 
 		 218 aa  187  1e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.470243 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1070  hypothetical protein  48.29 
 
 		 204 aa  184  9e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0265039 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3372  hypothetical protein  50.8 
 
 		 218 aa  182  2.0000000000000003e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2723  CRISPR-associated Cas4 family protein  45.45 
 
 		 208 aa  176  2e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02697  crispr-associated protein Cas4  43.6 
 
 		 210 aa  174  9e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.463213  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31590  CRISPR-associated protein Cas4  46.35 
 
 		 199 aa  170  2e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0832  CRISPR-associated exonuclease Cas4 family protein  47.85 
 
 		 228 aa  166  2e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0235  CRISPR-associated Cas4 family protein  48.66 
 
 		 211 aa  164  8e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1006  hypothetical protein  43.32 
 
 		 215 aa  164  1.0000000000000001e-39  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0356084  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2652  CRISPR-associated protein Cas4  43.81 
 
 		 212 aa  162  4.0000000000000004e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0303971  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0605  CRISPR-associated exonuclease Cas4 family protein  39.7 
 
 		 216 aa  161  5.0000000000000005e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.452129 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1975  CRISPR-associated protein Cas4  45.55 
 
 		 255 aa  162  5.0000000000000005e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1937  hypothetical protein  45.31 
 
 		 216 aa  161  8.000000000000001e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.370637  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1632  CRISPR-associated protein Cas4  43.41 
 
 		 218 aa  157  1e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.98908 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1432  CRISPR-associated Cas4 family protein  43.46 
 
 		 214 aa  157  1e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.343364  n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4560  CRISPR-associated protein Cas4  40.22 
 
 		 194 aa  155  5.0000000000000005e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1299  hypothetical protein  41.55 
 
 		 214 aa  155  6e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.938866  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1661  CRISPR-associated protein Cas4  41.5 
 
 		 214 aa  153  2e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.975016  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2974  CRISPR-associated Cas4 family protein  42 
 
 		 212 aa  152  5e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.948346  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3523  CRISPR-associated exonuclease Cas4 family protein  43.59 
 
 		 218 aa  151  7e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0793  CRISPR-associated protein Cas4  44.22 
 
 		 209 aa  145  6e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.813459  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4175  hypothetical protein  38.25 
 
 		 196 aa  136  2e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000176829 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2187  CRISPR-associated protein Cas4  36.49 
 
 		 223 aa  135  3.0000000000000003e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1975  CRISPR-associated protein Cas4  36.7 
 
 		 220 aa  135  6.0000000000000005e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.360978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0851  CRISPR-associated exonuclease Cas4 family protein  34.93 
 
 		 224 aa  134  7.000000000000001e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4331  CRISPR-associated Cas4 family protein  37.75 
 
 		 222 aa  135  7.000000000000001e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000854832  normal  0.165932 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3647  CRISPR-associated protein Cas4  35.21 
 
 		 225 aa  132  3e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0479  RecB family exonuclease  38.42 
 
 		 234 aa  131  6e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.957708  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1006  CRISPR-associated Cas4 family protein  34.15 
 
 		 219 aa  131  6.999999999999999e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3345  CRISPR-associated Cas4 family protein  37.93 
 
 		 221 aa  131  6.999999999999999e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0218123  normal  0.382188 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2233  CRISPR-associated Cas4 family protein  38.62 
 
 		 205 aa  124  9e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.874224  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1481  CRISPR-associated protein Cas4  33.02 
 
 		 222 aa  122  5e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2461  CRISPR-associated protein Cas4  37.84 
 
 		 196 aa  119  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.587961 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3507  PE-PGRS family protein  38.02 
 
 		 190 aa  116  1.9999999999999998e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.366327 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1717  CRISPR-associated protein Cas4  35 
 
 		 200 aa  115  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    unclonable  2.73181e-25 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0522  CRISPR-associated protein Cas4  34.78 
 
 		 196 aa  115  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00230563  hitchhiker  0.00000101589 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0505  CRISPR-associated protein Cas4  34.78 
 
 		 196 aa  115  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1625  CRISPR-associated Cas1 family protein  34.72 
 
 		 544 aa  109  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.575155  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2974  CRISPR-associated protein Cas1  35 
 
 		 545 aa  94.4  1e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0057  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  33.64 
 
 		 559 aa  90.9  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2433  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  32.64 
 
 		 570 aa  90.5  1e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0199418  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1859  CRISPR-associated Cas4 family protein  33.33 
 
 		 193 aa  86.7  2e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.343722  normal  0.533704 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4852  CRISPR-associated protein Cas1  31.73 
 
 		 594 aa  86.7  3e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.464981  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3119  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  31.31 
 
 		 550 aa  85.5  5e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00000141365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2343  hypothetical protein  32.99 
 
 		 333 aa  85.1  6e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0179  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  32.99 
 
 		 580 aa  85.1  6e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2913  CRISPR-associated protein Cas1  29.9 
 
 		 553 aa  82.8  0.000000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0184071  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1441  CRISPR-associated protein Cas1  29.05 
 
 		 598 aa  80.9  0.00000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0376991  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1558  CRISPR-associated Cas4 family protein  27.75 
 
 		 190 aa  71.2  0.000000000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.681932  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1872  CRISPR-associated Cas4 family protein  32.26 
 
 		 198 aa  65.9  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5519  CRISPR-associated protein Cas1  29.41 
 
 		 558 aa  65.9  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.28105 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3220  CRISPR-associated Cas4 family protein  27.41 
 
 		 204 aa  65.5  0.0000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.680334  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3577  CRISPR-associated protein Cas4  28.33 
 
 		 190 aa  62.8  0.000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0565  CRISPR-associated protein Cas4  26.56 
 
 		 202 aa  62  0.000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.234335  normal  0.250424 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1287  CRISPR-associated Cas4 family protein  31.93 
 
 		 190 aa  60.8  0.00000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.826986  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0637  CRISPR-associated Cas4 family protein  27.41 
 
 		 191 aa  60.1  0.00000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.042721  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1765  CRISPR-associated protein Cas4  34.45 
 
 		 189 aa  59.7  0.00000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15190  CRISPR-associated protein Cas4  22.11 
 
 		 198 aa  58.2  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0126  CRISPR-associated protein Cas4  26.7 
 
 		 171 aa  57.4  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0774  CRISPR-associated exonuclease Cas4 family protein  23.86 
 
 		 206 aa  57  0.0000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.356687  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3305  CRISPR-associated Cas4 family protein  30.65 
 
 		 198 aa  57.4  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.143494  normal  0.352212 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0536  protein of unknown function DUF83  37.3 
 
 		 170 aa  55.1  0.0000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0513907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1816  hypothetical protein  35.54 
 
 		 170 aa  53.9  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.115857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0227  CRISPR-associated Cas4 family protein  22.55 
 
 		 209 aa  52  0.000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.279714  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2841  CRISPR-associated protein Cas1  29.46 
 
 		 525 aa  47.8  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00141566  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2837  CRISPR-associated protein Cas4  25.14 
 
 		 186 aa  47  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.679978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2060  hypothetical protein  29.1 
 
 		 236 aa  47.4  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.456181 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6022  CRISPR-associated protein Cas4  23 
 
 		 195 aa  46.6  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.318812  normal  0.45154 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2838  hypothetical protein  34.09 
 
 		 171 aa  45.4  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000529444  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2603  hypothetical protein  30.95 
 
 		 170 aa  43.9  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.519513  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1142  CRISPR-associated Cas4 family protein  28.95 
 
 		 190 aa  43.5  0.002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.142818  hitchhiker  0.00000342837 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0728  CRISPR-associated Cas4 family protein  30.16 
 
 		 172 aa  43.1  0.003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0383  putative PAS/PAC sensor protein  30.08 
 
 		 227 aa  41.6  0.009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>