76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_1859 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_1859  CRISPR-associated Cas4 family protein  100 
 
 		 193 aa  397  9.999999999999999e-111  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.343722  normal  0.533704 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1558  CRISPR-associated Cas4 family protein  53.23 
 
 		 190 aa  211  3.9999999999999995e-54  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.681932  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3577  CRISPR-associated protein Cas4  44.63 
 
 		 190 aa  171  7.999999999999999e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4560  CRISPR-associated protein Cas4  35.52 
 
 		 194 aa  113  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2461  CRISPR-associated protein Cas4  36.02 
 
 		 196 aa  106  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.587961 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0057  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  35.03 
 
 		 559 aa  104  1e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1717  CRISPR-associated protein Cas4  32.63 
 
 		 200 aa  102  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    unclonable  2.73181e-25 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2233  CRISPR-associated Cas4 family protein  34.43 
 
 		 205 aa  100  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.874224  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02697  crispr-associated protein Cas4  34.59 
 
 		 210 aa  97.4  1e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.463213  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1299  hypothetical protein  30.81 
 
 		 214 aa  95.5  4e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.938866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4175  hypothetical protein  29.83 
 
 		 196 aa  94  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000176829 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0505  CRISPR-associated protein Cas4  30.43 
 
 		 196 aa  93.6  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2652  CRISPR-associated protein Cas4  32.24 
 
 		 212 aa  93.2  2e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0303971  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0522  CRISPR-associated protein Cas4  30.43 
 
 		 196 aa  93.6  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00230563  hitchhiker  0.00000101589 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1070  hypothetical protein  31.67 
 
 		 204 aa  91.7  7e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0265039 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1625  CRISPR-associated Cas1 family protein  28.33 
 
 		 544 aa  90.9  1e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.575155  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1432  CRISPR-associated Cas4 family protein  30.27 
 
 		 214 aa  90.9  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.343364  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4852  CRISPR-associated protein Cas1  29.86 
 
 		 594 aa  90.1  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.464981  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2433  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  31.09 
 
 		 570 aa  88.2  7e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0199418  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0652  CRISPR-associated Cas4 family protein  33.33 
 
 		 210 aa  86.7  2e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.915701  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3372  hypothetical protein  29.32 
 
 		 218 aa  87  2e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0494  CRISPR-associated exonuclease Cas4 family protein  32.07 
 
 		 214 aa  85.9  3e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2974  CRISPR-associated protein Cas1  29.17 
 
 		 545 aa  86.3  3e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3119  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  28.86 
 
 		 550 aa  85.5  5e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00000141365  normal  1 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5519  CRISPR-associated protein Cas1  31.82 
 
 		 558 aa  83.6  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.28105 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31590  CRISPR-associated protein Cas4  30.56 
 
 		 199 aa  83.6  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0605  CRISPR-associated exonuclease Cas4 family protein  28.65 
 
 		 216 aa  83.6  0.000000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.452129 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1478  CRISPR-associated protein Cas4  29.29 
 
 		 218 aa  83.2  0.000000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.470243 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1661  CRISPR-associated protein Cas4  29.47 
 
 		 214 aa  82.8  0.000000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.975016  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3507  PE-PGRS family protein  31.07 
 
 		 190 aa  82.8  0.000000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.366327 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0832  CRISPR-associated exonuclease Cas4 family protein  30.16 
 
 		 228 aa  81.3  0.000000000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1287  CRISPR-associated Cas4 family protein  31.89 
 
 		 190 aa  81.3  0.000000000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.826986  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2913  CRISPR-associated protein Cas1  29.5 
 
 		 553 aa  80.9  0.00000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0184071  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0822  CRISPR-associated protein Cas4  29.89 
 
 		 206 aa  80.9  0.00000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2723  CRISPR-associated Cas4 family protein  30.6 
 
 		 208 aa  79.7  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2974  CRISPR-associated Cas4 family protein  30.11 
 
 		 212 aa  79.7  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.948346  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1006  hypothetical protein  30.11 
 
 		 215 aa  79.3  0.00000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0356084  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2343  hypothetical protein  29.29 
 
 		 333 aa  78.2  0.00000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1975  CRISPR-associated protein Cas4  29.44 
 
 		 255 aa  77.4  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0235  CRISPR-associated Cas4 family protein  27.09 
 
 		 211 aa  76.6  0.0000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1632  CRISPR-associated protein Cas4  27.57 
 
 		 218 aa  74.7  0.0000000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.98908 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0179  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  29.9 
 
 		 580 aa  74.3  0.000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1441  CRISPR-associated protein Cas1  29.49 
 
 		 598 aa  72.8  0.000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0376991  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1975  CRISPR-associated protein Cas4  28.72 
 
 		 220 aa  72.4  0.000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.360978  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0565  CRISPR-associated protein Cas4  25.52 
 
 		 202 aa  71.6  0.000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.234335  normal  0.250424 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1765  CRISPR-associated protein Cas4  27.27 
 
 		 189 aa  71.2  0.000000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4331  CRISPR-associated Cas4 family protein  26.67 
 
 		 222 aa  70.5  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000854832  normal  0.165932 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3523  CRISPR-associated exonuclease Cas4 family protein  30 
 
 		 218 aa  70.9  0.00000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0793  CRISPR-associated protein Cas4  28.96 
 
 		 209 aa  70.9  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.813459  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0851  CRISPR-associated exonuclease Cas4 family protein  24.62 
 
 		 224 aa  70.5  0.00000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3305  CRISPR-associated Cas4 family protein  23.44 
 
 		 198 aa  70.1  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.143494  normal  0.352212 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2187  CRISPR-associated protein Cas4  25.13 
 
 		 223 aa  69.7  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3906  CRISPR-associated Cas4 family protein  27.84 
 
 		 212 aa  68.9  0.00000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.164887  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1872  CRISPR-associated Cas4 family protein  24.48 
 
 		 198 aa  67.4  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3647  CRISPR-associated protein Cas4  25.13 
 
 		 225 aa  66.6  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1937  hypothetical protein  24.19 
 
 		 216 aa  64.7  0.0000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.370637  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0479  RecB family exonuclease  26.26 
 
 		 234 aa  62.4  0.000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.957708  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3220  CRISPR-associated Cas4 family protein  27.66 
 
 		 204 aa  61.6  0.000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.680334  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3345  CRISPR-associated Cas4 family protein  25.51 
 
 		 221 aa  61.6  0.000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0218123  normal  0.382188 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1155  CRISPR-associated Cas4 family protein  26.4 
 
 		 212 aa  60.8  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1481  CRISPR-associated protein Cas4  23.59 
 
 		 222 aa  60.8  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1816  hypothetical protein  33.61 
 
 		 170 aa  59.7  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.115857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1006  CRISPR-associated Cas4 family protein  27.14 
 
 		 219 aa  59.7  0.00000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0637  CRISPR-associated Cas4 family protein  24.48 
 
 		 191 aa  53.9  0.000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.042721  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0728  CRISPR-associated Cas4 family protein  31.93 
 
 		 172 aa  52.4  0.000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1076  CRISPR-associated Cas4 family protein  26.67 
 
 		 197 aa  51.2  0.000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5083  CRISPR-associated Cas4 family protein  29.19 
 
 		 197 aa  50.1  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6022  CRISPR-associated protein Cas4  26.7 
 
 		 195 aa  49.7  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.318812  normal  0.45154 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2603  hypothetical protein  27.69 
 
 		 170 aa  48.5  0.00006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.519513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0774  CRISPR-associated exonuclease Cas4 family protein  23.4 
 
 		 206 aa  47  0.0002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.356687  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1142  CRISPR-associated Cas4 family protein  21.98 
 
 		 190 aa  45.8  0.0004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.142818  hitchhiker  0.00000342837 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0536  protein of unknown function DUF83  28.33 
 
 		 170 aa  45.4  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0513907  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15190  CRISPR-associated protein Cas4  22.04 
 
 		 198 aa  42.4  0.005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03101  RecB family nuclease  26.32 
 
 		 446 aa  42  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03001  RecB family nuclease  25.26 
 
 		 472 aa  41.6  0.006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1083  CRISPR-associated Cas4 family protein  22.86 
 
 		 172 aa  41.6  0.008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>