38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1816 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_1816  hypothetical protein  100 
 
 		 170 aa  340  4e-93  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.115857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2603  hypothetical protein  82.74 
 
 		 170 aa  288  2e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.519513  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0536  protein of unknown function DUF83  54.76 
 
 		 170 aa  174  3e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0513907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2838  hypothetical protein  52.7 
 
 		 171 aa  151  5e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000529444  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0728  CRISPR-associated Cas4 family protein  38.92 
 
 		 172 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0305  CRISPR-associated protein Cas4  32.78 
 
 		 323 aa  91.7  4e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1015  CRISPR-associated Cas4 family protein  25.17 
 
 		 186 aa  68.9  0.00000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1859  CRISPR-associated Cas4 family protein  33.61 
 
 		 193 aa  59.7  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.343722  normal  0.533704 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2270  CRISPR-associated protein Cas4  28.46 
 
 		 201 aa  54.3  0.0000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.160192  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0652  CRISPR-associated Cas4 family protein  35.54 
 
 		 210 aa  53.9  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.915701  n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4560  CRISPR-associated protein Cas4  26.89 
 
 		 194 aa  50.8  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1006  hypothetical protein  27.34 
 
 		 215 aa  50.4  0.00001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0356084  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02697  crispr-associated protein Cas4  33.6 
 
 		 210 aa  49.7  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.463213  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0832  CRISPR-associated exonuclease Cas4 family protein  33.59 
 
 		 228 aa  49.3  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1717  CRISPR-associated protein Cas4  27.87 
 
 		 200 aa  48.5  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    unclonable  2.73181e-25 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0505  CRISPR-associated protein Cas4  28.7 
 
 		 196 aa  48.5  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0522  CRISPR-associated protein Cas4  28.7 
 
 		 196 aa  48.1  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00230563  hitchhiker  0.00000101589 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2461  CRISPR-associated protein Cas4  29.32 
 
 		 196 aa  47.8  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.587961 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1698  DNA replication factor Dna2  43.21 
 
 		 901 aa  47.8  0.00008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0455  DNA replication factor Dna2  42.86 
 
 		 902 aa  47  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2233  CRISPR-associated Cas4 family protein  30.33 
 
 		 205 aa  47.4  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.874224  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3372  hypothetical protein  30.33 
 
 		 218 aa  46.2  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3220  CRISPR-associated Cas4 family protein  24.79 
 
 		 204 aa  45.8  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.680334  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3523  CRISPR-associated exonuclease Cas4 family protein  27.56 
 
 		 218 aa  45.4  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1432  CRISPR-associated Cas4 family protein  27.05 
 
 		 214 aa  45.4  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.343364  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4175  hypothetical protein  27.73 
 
 		 196 aa  45.1  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000176829 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0822  CRISPR-associated protein Cas4  31.4 
 
 		 206 aa  45.1  0.0005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1975  CRISPR-associated protein Cas4  32.52 
 
 		 255 aa  44.3  0.0008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2111  DNA replication factor Dna2  40.26 
 
 		 934 aa  44.3  0.0008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1478  CRISPR-associated protein Cas4  31.3 
 
 		 218 aa  43.1  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.470243 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3507  PE-PGRS family protein  33.61 
 
 		 190 aa  43.1  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.366327 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3577  CRISPR-associated protein Cas4  30.4 
 
 		 190 aa  43.1  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0494  CRISPR-associated exonuclease Cas4 family protein  30.53 
 
 		 214 aa  42.7  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1070  hypothetical protein  30.58 
 
 		 204 aa  42.4  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0265039 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5519  CRISPR-associated protein Cas1  31.3 
 
 		 558 aa  42.4  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.28105 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1558  CRISPR-associated Cas4 family protein  38.75 
 
 		 190 aa  41.6  0.006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.681932  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1722  CRISPR-associated Cas4 family protein  33.33 
 
 		 218 aa  41.2  0.007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.523221 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31590  CRISPR-associated protein Cas4  29.92 
 
 		 199 aa  40.4  0.01  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>