19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp0163 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006368  lpp0163  hypothetical protein  100 
 
 		 197 aa  408  1e-113  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1872  CRISPR-associated Cas4 family protein  27.5 
 
 		 198 aa  80.1  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1287  CRISPR-associated Cas4 family protein  26.06 
 
 		 190 aa  75.1  0.0000000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.826986  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3305  CRISPR-associated Cas4 family protein  27.5 
 
 		 198 aa  74.7  0.0000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.143494  normal  0.352212 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1765  CRISPR-associated protein Cas4  23.66 
 
 		 189 aa  62.8  0.000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0565  CRISPR-associated protein Cas4  23.44 
 
 		 202 aa  61.6  0.000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.234335  normal  0.250424 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5083  CRISPR-associated Cas4 family protein  27.32 
 
 		 197 aa  60.8  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2974  CRISPR-associated protein Cas1  25.65 
 
 		 545 aa  55.8  0.0000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1625  CRISPR-associated Cas1 family protein  26.2 
 
 		 544 aa  54.7  0.0000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.575155  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2652  CRISPR-associated protein Cas4  20.21 
 
 		 212 aa  53.5  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0303971  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0774  CRISPR-associated exonuclease Cas4 family protein  25.85 
 
 		 206 aa  48.9  0.00005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.356687  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0728  CRISPR-associated Cas4 family protein  24.17 
 
 		 172 aa  47  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6022  CRISPR-associated protein Cas4  22.06 
 
 		 195 aa  46.2  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.318812  normal  0.45154 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3577  CRISPR-associated protein Cas4  23.78 
 
 		 190 aa  45.1  0.0006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1076  CRISPR-associated Cas4 family protein  21.5 
 
 		 197 aa  44.3  0.001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3119  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  21.61 
 
 		 550 aa  43.5  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00000141365  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1558  CRISPR-associated Cas4 family protein  24.06 
 
 		 190 aa  42.7  0.004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.681932  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15190  CRISPR-associated protein Cas4  24.24 
 
 		 198 aa  41.6  0.007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0227  CRISPR-associated Cas4 family protein  22.39 
 
 		 209 aa  41.2  0.01  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.279714  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>