22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_2838 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_2838  hypothetical protein  100 
 
 
171 aa  347  4e-95  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000529444  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0536  protein of unknown function DUF83  50.59 
 
 
170 aa  165  2e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0513907  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2603  hypothetical protein  50.3 
 
 
170 aa  163  9e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.519513  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1816  hypothetical protein  52.7 
 
 
170 aa  151  5e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.115857  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0728  CRISPR-associated Cas4 family protein  35.85 
 
 
172 aa  92.8  2e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0305  CRISPR-associated protein Cas4  29.41 
 
 
323 aa  91.7  4e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1015  CRISPR-associated Cas4 family protein  26.95 
 
 
186 aa  63.2  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1558  CRISPR-associated Cas4 family protein  28 
 
 
190 aa  50.1  0.00001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.681932  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1717  CRISPR-associated protein Cas4  35.54 
 
 
200 aa  47.8  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    unclonable  2.73181e-25 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1661  CRISPR-associated protein Cas4  30.88 
 
 
214 aa  47.4  0.00009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.975016  n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4560  CRISPR-associated protein Cas4  29.75 
 
 
194 aa  45.1  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0652  CRISPR-associated Cas4 family protein  34.09 
 
 
210 aa  45.1  0.0005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.915701  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1975  CRISPR-associated protein Cas4  31.54 
 
 
255 aa  43.5  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1930  hypothetical protein  25.77 
 
 
272 aa  42.7  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0505  CRISPR-associated protein Cas4  30 
 
 
196 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3577  CRISPR-associated protein Cas4  27.2 
 
 
190 aa  42.7  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0522  CRISPR-associated protein Cas4  30 
 
 
196 aa  42.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00230563  hitchhiker  0.00000101589 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1287  CRISPR-associated Cas4 family protein  26.24 
 
 
190 aa  42.4  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.826986  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1698  DNA replication factor Dna2  33.05 
 
 
901 aa  42  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1070  hypothetical protein  29.93 
 
 
204 aa  41.2  0.008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0265039 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4175  hypothetical protein  29.75 
 
 
196 aa  40.8  0.008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000176829 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0637  CRISPR-associated Cas4 family protein  26.72 
 
 
191 aa  40.8  0.009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.042721  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>