More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_01160 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009439  Pmen_2332  Rhs element Vgr protein  79.35 
 
 
741 aa  1237  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00996193  normal  0.0126654 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4080  type VI secretion system Vgr family protein  46.55 
 
 
771 aa  668  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.79673e-08 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3960  hypothetical protein  77.9 
 
 
689 aa  1082  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0169  hypothetical protein  97.57 
 
 
741 aa  1499  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29390  hypothetical protein  74.23 
 
 
689 aa  1099  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0163  hypothetical protein  81.9 
 
 
646 aa  986  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.766784  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01160  hypothetical protein  100 
 
 
741 aa  1528  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.73633  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01110  hypothetical protein  81.95 
 
 
643 aa  980  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.124023  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2127  Rhs element Vgr protein  44.7 
 
 
748 aa  631  1e-179  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.519632 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3868  type VI secretion system Vgr family protein  46.61 
 
 
730 aa  624  1e-177  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0373872  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3486  Rhs element Vgr protein  43.29 
 
 
774 aa  625  1e-177  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.740933  normal  0.610265 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0536  type VI secretion system Vgr family protein  42.46 
 
 
792 aa  619  1e-176  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0241  Rhs element Vgr protein  41.88 
 
 
907 aa  610  1e-173  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4009  Rhs element Vgr protein  43.59 
 
 
756 aa  602  1e-170  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0849352  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3133  Rhs element Vgr protein  43.3 
 
 
767 aa  600  1e-170  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.054847  normal  0.114782 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2735  Rhs element Vgr protein  40.31 
 
 
788 aa  595  1e-169  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0298298  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3489  hypothetical protein  43.17 
 
 
767 aa  596  1e-169  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.159566  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0300  type VI secretion system Vgr family protein  45.05 
 
 
794 aa  593  1e-168  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4483  type VI secretion system Vgr family protein  45.05 
 
 
778 aa  594  1e-168  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3752  Rhs element Vgr protein  43.32 
 
 
755 aa  594  1e-168  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.617325 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0460  Rhs element Vgr protein  42.37 
 
 
734 aa  587  1e-166  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.141236  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1790  Rhs element Vgr protein  42.37 
 
 
734 aa  587  1e-166  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.129982  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0410  Rhs element Vgr protein  42.37 
 
 
734 aa  587  1e-166  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.447319  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2828  Rhs element Vgr protein  42.37 
 
 
734 aa  587  1e-166  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1607  Rhs element Vgr protein  42.37 
 
 
734 aa  587  1e-166  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2953  Rhs element Vgr protein  42.23 
 
 
734 aa  584  1e-165  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.527761  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1193  Rhs element Vgr protein  42.21 
 
 
731 aa  584  1e-165  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.598361  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0265  Rhs element Vgr protein  42.21 
 
 
731 aa  580  1e-164  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0698  type VI secretion system Vgr family protein  41.34 
 
 
792 aa  569  1e-161  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3783  Rhs element Vgr protein  42.3 
 
 
785 aa  565  1e-160  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.757692  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2808  Rhs element Vgr protein  41.51 
 
 
734 aa  564  1e-159  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1173  Rhs element Vgr protein  40.71 
 
 
734 aa  559  1e-158  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2439  type VI secretion system Vgr family protein  40.22 
 
 
712 aa  533  1e-150  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2455  Rhs element Vgr protein  40.54 
 
 
783 aa  531  1e-149  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0279877  normal  0.549341 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1581  Rhs element Vgr protein  42.68 
 
 
757 aa  518  1e-145  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.206829 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4429  Rhs element Vgr protein  39.35 
 
 
724 aa  511  1e-143  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1191  Rhs element Vgr protein  39.14 
 
 
703 aa  506  1e-142  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2047  Rhs element Vgr protein  45.72 
 
 
572 aa  506  1e-142  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1216  type VI secretion system Vgr family protein  39.82 
 
 
683 aa  499  1e-140  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3778  type VI secretion system Vgr family protein  39.45 
 
 
796 aa  500  1e-140  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.938556  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3035  type VI secretion system Vgr family protein  40.22 
 
 
683 aa  496  1e-139  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0250  type VI secretion system Vgr family protein  40 
 
 
794 aa  495  1e-138  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0201  type VI secretion system Vgr family protein  41.09 
 
 
777 aa  485  1e-135  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2865  type VI secretion system Vgr family protein  41.72 
 
 
780 aa  474  1e-132  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00256  Rhs-family protein  40.76 
 
 
645 aa  469  1e-131  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3347  Rhs element Vgr protein  46.72 
 
 
841 aa  458  1e-127  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.57735  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2840  Rhs element Vgr protein  46.32 
 
 
838 aa  456  1e-127  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.363054  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0481  Rhs element Vgr protein  46.72 
 
 
841 aa  458  1e-127  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0497  Rhs element Vgr protein  46.12 
 
 
841 aa  454  1e-126  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3024  Rhs element Vgr protein  40.15 
 
 
725 aa  454  1e-126  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.130505 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2357  type VI secretion system Vgr family protein  41.02 
 
 
619 aa  447  1e-124  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.116837 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3015  Rhs element Vgr protein  42.68 
 
 
645 aa  440  1e-122  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5680  type VI secretion system Vgr family protein  45.51 
 
 
975 aa  437  1e-121  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.555449  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6124  type VI secretion system Vgr family protein  40.22 
 
 
714 aa  433  1e-120  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.029227  normal  0.478766 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4187  Rhs element Vgr protein  36.07 
 
 
769 aa  429  1e-119  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2447  type VI secretion system Vgr family protein  36.73 
 
 
735 aa  430  1e-119  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.764507  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0286  Rhs element Vgr protein:Gp5-like  34.12 
 
 
709 aa  427  1e-118  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.856224 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2568  Rhs element Vgr protein  39.87 
 
 
661 aa  426  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3178  type VI secretion system Vgr family protein  38.46 
 
 
1981 aa  429  1e-118  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.568675 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1057  Rhs element Vgr protein  39.7 
 
 
661 aa  425  1e-117  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.517121  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1320  Rhs element Vgr protein  39.87 
 
 
661 aa  426  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.249702  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26600  Rhs element Vgr protein  42.18 
 
 
687 aa  426  1e-117  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.417964  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1269  Rhs element Vgr protein  39.7 
 
 
661 aa  425  1e-117  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0412192  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1401  Rhs element Vgr protein  39.77 
 
 
661 aa  426  1e-117  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.764688  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0511  Rhs element Vgr protein  39.7 
 
 
661 aa  425  1e-117  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0894  type VI secretion system Vgr family protein  44.25 
 
 
886 aa  424  1e-117  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0240  Rhs element Vgr protein  39.7 
 
 
661 aa  425  1e-117  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3859  type VI secretion system Vgr family protein  45.04 
 
 
901 aa  425  1e-117  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_36  VgrG protein, VgrG-2  34.23 
 
 
754 aa  424  1e-117  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1436  Rhs element Vgr protein  39.42 
 
 
661 aa  419  1e-115  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.064161  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1281  Rhs element Vgr protein  38.77 
 
 
676 aa  419  1e-115  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05870  hypothetical protein  33.29 
 
 
692 aa  412  1e-113  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0764  type VI secretion system Vgr family protein  33.95 
 
 
741 aa  409  1e-113  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33960  hypothetical protein  36.35 
 
 
668 aa  412  1e-113  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000148732  normal  0.101757 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0329  Rhs family protein  39.34 
 
 
743 aa  409  1e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.312709  normal  0.985789 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2014  type VI secretion system Vgr family protein  38.1 
 
 
753 aa  408  1e-112  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.758033  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000448  VgrG protein  33.24 
 
 
692 aa  408  1e-112  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  1.07078e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0696  putative VgrG protein  33.24 
 
 
741 aa  407  1e-112  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0322  Rhs-family protein  38.96 
 
 
730 aa  408  1e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0393811 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0310  Rhs family protein  39.09 
 
 
729 aa  408  1e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.261642  normal  0.473286 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0319  Rhs family protein  38.92 
 
 
729 aa  405  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.946115  normal  0.027027 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50870  Rhs element Vgr protein  37.62 
 
 
668 aa  403  1e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3415  Rhs element Vgr protein  35.2 
 
 
669 aa  402  1e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.960838  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1358  VgrG preotein, VgrG-2  33 
 
 
754 aa  403  1e-111  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3106  hypothetical protein  38.43 
 
 
618 aa  400  1e-110  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.166384  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0531  type VI secretion system Vgr family protein  34.37 
 
 
1003 aa  398  1e-109  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5985  type VI secretion system Vgr family protein  37.14 
 
 
641 aa  394  1e-108  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1155  type VI secretion system Vgr family protein  34.56 
 
 
706 aa  393  1e-108  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0542625  normal  0.843476 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1114  type VI secretion system Vgr family protein  32.07 
 
 
713 aa  392  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2760  type VI secretion system Vgr family protein  38.71 
 
 
613 aa  391  1e-107  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.68949 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0129  Rhs element Vgr protein  33.9 
 
 
872 aa  390  1e-107  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.176404  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2888  hypothetical protein  34.63 
 
 
668 aa  391  1e-107  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.882104  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0143  Rhs element Vgr protein  34.46 
 
 
896 aa  388  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.420233  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1613  Rhs element Vgr protein  34.46 
 
 
858 aa  388  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0166  Rhs element Vgr protein  34.46 
 
 
930 aa  388  1e-106  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.275346  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2618  Rhs element Vgr protein  38.33 
 
 
618 aa  389  1e-106  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.576781 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01965  hypothetical protein  32.7 
 
 
771 aa  384  1e-105  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2517  type VI secretion system Vgr family protein  36.65 
 
 
616 aa  382  1e-105  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1234  Vgr family type VI secretion system  32.07 
 
 
704 aa  383  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.270466 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0251  Rhs element Vgr protein  39.64 
 
 
775 aa  380  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.628249  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>