111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_08801 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008820  P9303_08801  hypothetical protein  100 
 
 		 188 aa  389  1e-107  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26321  porin  99.35 
 
 		 543 aa  311  2.9999999999999996e-84  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.57594 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11091  porin  98.7 
 
 		 555 aa  310  1e-83  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.559273 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14071  porin  98.05 
 
 		 531 aa  308  2.9999999999999997e-83  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.422429 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2367  porin  76.33 
 
 		 500 aa  263  1e-69  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0323  porin  75.6 
 
 		 513 aa  260  6.999999999999999e-69  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.222297  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0324  porin  75.15 
 
 		 510 aa  260  8.999999999999999e-69  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1575  porin  81.82 
 
 		 514 aa  259  2e-68  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.415305  normal  0.0658959 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1999  porin  79.87 
 
 		 524 aa  257  5.0000000000000005e-68  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0137122  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1095  porin  70.49 
 
 		 475 aa  226  2e-58  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.319287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2366  porin  70.49 
 
 		 561 aa  225  4e-58  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.231063  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1591  porin  77.7 
 
 		 528 aa  224  8e-58  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.411467  hitchhiker  0.00286278 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2012  porin  67.3 
 
 		 518 aa  218  3.9999999999999997e-56  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0833  porin  70 
 
 		 544 aa  170  1e-41  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.039396  hitchhiker  0.000166509 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0838  carbohydrate-selective porin OprB  58.99 
 
 		 550 aa  160  1e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.832217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2510  S-layer region-like  64.23 
 
 		 574 aa  159  2e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.0000000000393409  normal  0.0737899 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4465  carbohydrate-selective porin OprB  56.05 
 
 		 572 aa  159  2e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00227345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0200  hypothetical protein  50.29 
 
 		 533 aa  157  6e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4440  S-layer region-like  63.57 
 
 		 531 aa  158  6e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.016737  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1635  porin; major outer membrane protein  52.5 
 
 		 548 aa  156  1e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00492408  normal  0.132701 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3779  carbohydrate-selective porin OprB  62.9 
 
 		 561 aa  156  1e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.00000785609  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3365  S-layer region-like  61.79 
 
 		 539 aa  156  2e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.382297  normal  0.674286 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1463  porin  57.25 
 
 		 543 aa  155  4e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000578184  normal  0.0560138 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08291  hypothetical protein  51.57 
 
 		 450 aa  155  4e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0885219  hitchhiker  0.0000555529 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1234  carbohydrate-selective porin OprB  56.13 
 
 		 639 aa  154  1e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.373435  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2737  carbohydrate-selective porin OprB  50.59 
 
 		 542 aa  152  2e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.000147214  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2214  S-layer domain protein  57.78 
 
 		 643 aa  152  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000900458  normal  0.0461421 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4247  S-layer domain protein  53.38 
 
 		 629 aa  152  4e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000142849  unclonable  0.000000000425549 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4059  S-layer region-like  51.85 
 
 		 581 aa  151  5.9999999999999996e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.0000000000841951  normal  0.105376 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4466  carbohydrate-selective porin OprB  63.41 
 
 		 491 aa  150  8e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.666985  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3648  Carbohydrate-selective porin OprB  61.67 
 
 		 622 aa  150  8.999999999999999e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000847402  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1464  porin  57.03 
 
 		 531 aa  150  1e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00000540569  normal  0.0535262 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1069  Carbohydrate-selective porin OprB  62.5 
 
 		 658 aa  150  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000390313  unclonable  0.000000000285099 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12581  hypothetical protein  51.23 
 
 		 515 aa  150  2e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00206869 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0823  S-layer domain protein  62.39 
 
 		 578 aa  149  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.000211926  normal  0.0522919 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12591  hypothetical protein  51.23 
 
 		 515 aa  148  4e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.375416  hitchhiker  0.00229564 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1607  porin; major outer membrane protein  49.38 
 
 		 518 aa  146  2.0000000000000003e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.657278 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4536  S-layer region-like  54.17 
 
 		 624 aa  145  3e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0239  hypothetical protein  59.35 
 
 		 563 aa  145  4.0000000000000006e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000660522  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1448  Carbohydrate-selective porin OprB  50.32 
 
 		 604 aa  144  5e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4567  carbohydrate-selective porin OprB  60.16 
 
 		 529 aa  144  6e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.316045  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2677  carbohydrate-selective porin OprB  55.65 
 
 		 571 aa  142  2e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2174  S-layer region-like  57.26 
 
 		 530 aa  140  9.999999999999999e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.721353  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2328  Carbohydrate-selective porin OprB  47.5 
 
 		 586 aa  137  1e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2379  Carbohydrate-selective porin OprB  47.5 
 
 		 586 aa  137  1e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.934978 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0432  Carbohydrate-selective porin OprB  43.62 
 
 		 666 aa  136  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0443  Carbohydrate-selective porin OprB  43.62 
 
 		 666 aa  136  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000473343  normal  0.0116841 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1501  Carbohydrate-selective porin OprB  41.21 
 
 		 641 aa  131  6e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    unclonable  2.9541800000000004e-24 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4705  Carbohydrate-selective porin OprB  51.91 
 
 		 550 aa  127  7.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4184  Carbohydrate-selective porin OprB  48.55 
 
 		 581 aa  127  8.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4223  Carbohydrate-selective porin OprB  48.55 
 
 		 581 aa  127  8.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.219563  normal  0.747154 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0793  Carbohydrate-selective porin OprB  52.89 
 
 		 551 aa  127  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.443673 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1931  S-layer region-like  53.23 
 
 		 606 aa  126  2.0000000000000002e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.575111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4140  S-layer region-like  44.12 
 
 		 600 aa  125  3e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0020254  normal  0.0305803 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3604  Carbohydrate-selective porin OprB  47.83 
 
 		 591 aa  125  3e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0134108 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3603  Carbohydrate-selective porin OprB  48.82 
 
 		 593 aa  123  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0055182 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1445  Carbohydrate-selective porin OprB  48.82 
 
 		 645 aa  121  6e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1471  Carbohydrate-selective porin OprB  48.03 
 
 		 632 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.633309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4515  carbohydrate-selective porin OprB  41.79 
 
 		 589 aa  105  4e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0777365  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1923  S-layer domain protein  47.97 
 
 		 527 aa  104  9e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0684445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0023  major outer membrane protein  45.04 
 
 		 568 aa  102  4e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.500646  normal  0.0378832 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12401  porin  38.1 
 
 		 449 aa  98.6  4e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.137225  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0721  porin precursor-like  39.61 
 
 		 440 aa  98.6  5e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3571  S-layer domain protein  42.16 
 
 		 262 aa  90.1  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2542  S-layer domain protein  42.16 
 
 		 262 aa  90.1  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.89792  normal  0.0876667 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1122  S-layer domain protein  40.38 
 
 		 261 aa  83.6  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2437  hypothetical protein  34.68 
 
 		 508 aa  73.9  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13341  porin  31.13 
 
 		 426 aa  64.7  0.0000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1274  S-layer domain protein  34.35 
 
 		 485 aa  64.7  0.0000000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000376078  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1724  S-layer domain-containing protein  30.61 
 
 		 441 aa  56.6  0.0000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000217367  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13641  porin-like protein  29.14 
 
 		 432 aa  55.5  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12121  porin  53.06 
 
 		 383 aa  53.9  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12261  porin  61.11 
 
 		 399 aa  52.4  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16211  porin-like protein  66.67 
 
 		 415 aa  51.6  0.000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.191112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0458  S-layer domain-containing protein  29.25 
 
 		 400 aa  51.6  0.000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000061041  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0443  S-layer domain-containing protein  28.76 
 
 		 400 aa  50.4  0.00001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000189503  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0777  porin-like protein  64.29 
 
 		 414 aa  50.1  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3655  S-layer domain protein  30.2 
 
 		 673 aa  50.4  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.2791  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1771  S-layer domain-containing protein  27.27 
 
 		 361 aa  50.1  0.00002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.797057  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0331  S-layer-like protein region  32.69 
 
 		 946 aa  49.3  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.491966  hitchhiker  0.00612825 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1597  S-layer-like protein region  31.82 
 
 		 416 aa  49.7  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.408429  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1264  porin-like  26 
 
 		 437 aa  48.5  0.00006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17460  S-layer domain protein  31.51 
 
 		 784 aa  48.5  0.00006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1057  porin-like protein  87.5 
 
 		 335 aa  47.8  0.00009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1757  porin-like protein  87.5 
 
 		 332 aa  47.4  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04791  hypothetical protein  87.5 
 
 		 333 aa  47.8  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0282732  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12271  porin  57.5 
 
 		 355 aa  47  0.0002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19301  hypothetical protein  83.33 
 
 		 336 aa  46.6  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.665373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2990  S-layer domain-containing protein  31 
 
 		 932 aa  47  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.00000140027  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11770  S-layer domain protein  31.4 
 
 		 255 aa  45.4  0.0004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.175649  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0107  S-layer domain protein  31.96 
 
 		 919 aa  45.4  0.0005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.0000309483  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12251  porin  52.78 
 
 		 369 aa  45.4  0.0005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.624505  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1024  S-layer domain-containing protein  40 
 
 		 403 aa  45.1  0.0006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000117034  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0715  S-layer domain-containing protein  26.42 
 
 		 1036 aa  45.1  0.0006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1096  S-layer domain-containing protein  40 
 
 		 403 aa  45.1  0.0006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000091055  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1130  porin precursor-like  50 
 
 		 384 aa  44.3  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0788851  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1131  porin precursor-like  66.67 
 
 		 371 aa  43.9  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  decreased coverage  0.00125322  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0176  S-layer domain-containing protein  28 
 
 		 343 aa  44.7  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.000000342894  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3023  S-layer domain-containing protein  31.87 
 
 		 408 aa  44.3  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.80605  normal  0.105642 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11511  porin  75 
 
 		 328 aa  43.1  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0116362 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>