296 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_0004 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010718  Nther_0004  DNA replication and repair protein RecF  100 
 
 
386 aa  789  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00780262  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0004  recombination protein F  46.32 
 
 
373 aa  310  2e-83  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.177605  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0004  recombination protein F  45.36 
 
 
375 aa  305  8e-82  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.864622  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0004  recombination protein F  45.36 
 
 
375 aa  305  8e-82  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0004  recombination protein F  45.36 
 
 
375 aa  305  8e-82  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00277064  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0004  recombination protein F  45.36 
 
 
375 aa  305  8e-82  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  1.04808e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0004  recombination protein F  45.36 
 
 
375 aa  305  1e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0004  recombination protein F  45.36 
 
 
375 aa  305  1e-81  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.340003 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5316  recombination protein F  45.36 
 
 
375 aa  305  1e-81  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0155044  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0004  recombination protein F  45.36 
 
 
375 aa  305  1e-81  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0004  recombination protein F  45.36 
 
 
375 aa  305  1e-81  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2550  recombination protein F  44.74 
 
 
371 aa  305  1e-81  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0191996  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0004  recombination protein F  45.09 
 
 
375 aa  304  2e-81  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0004  recombination protein F  43.57 
 
 
370 aa  291  9e-78  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.320094  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0004  recombination protein F  43.57 
 
 
370 aa  291  9e-78  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.188075  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0004  recombination protein F  42.55 
 
 
372 aa  287  2e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0004  recombination protein F  40.43 
 
 
374 aa  285  1e-75  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0004  recombination protein F  42.82 
 
 
374 aa  284  2e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  4.14234e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00040  DNA replication and repair protein RecF  42.48 
 
 
375 aa  273  4e-72  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2374  DNA replication and repair protein RecF  40.06 
 
 
369 aa  268  1e-70  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0003  DNA replication and repair protein RecF  40.74 
 
 
365 aa  263  3e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.390569  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1991  recombination protein F  41.33 
 
 
366 aa  263  4e-69  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2156  recombination protein F  40.43 
 
 
369 aa  263  4e-69  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000779125  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0004  recombination protein F  39.1 
 
 
374 aa  263  5e-69  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0004  DNA replication and repair protein RecF  39.52 
 
 
376 aa  262  7e-69  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0004  recombination protein F  39.73 
 
 
361 aa  261  1e-68  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0004  recombination protein F  39.73 
 
 
361 aa  261  1e-68  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0004  DNA replication and repair protein RecF  38.9 
 
 
373 aa  261  2e-68  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0004  DNA replication and repair protein RecF  39.22 
 
 
360 aa  259  5e-68  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0004  recombination protein F  40.69 
 
 
374 aa  258  1e-67  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  2.60396e-25 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0004  DNA replication and repair protein RecF  38.13 
 
 
372 aa  247  3e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.370076  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1772  DNA replication and repair protein RecF  36.84 
 
 
371 aa  246  4e-64  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0434  DNA replication and repair protein RecF  33.84 
 
 
392 aa  243  3e-63  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.626531  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0004  recombination protein F  39.05 
 
 
362 aa  243  6e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2238  recombination protein F  39.77 
 
 
359 aa  241  1e-62  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0004  recombination protein F  37.93 
 
 
371 aa  241  2e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.106759  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0004  DNA replication and repair protein RecF  35.49 
 
 
371 aa  229  6e-59  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.244423  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0003  recombination protein F  37.67 
 
 
364 aa  228  2e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0003  DNA replication and repair protein RecF  37.4 
 
 
364 aa  227  3e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0003  recombination protein F  35.93 
 
 
364 aa  223  4e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2436  DNA replication and repair protein RecF  31.82 
 
 
398 aa  221  2e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.532549  normal  0.0198697 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3391  recombination protein F  37.5 
 
 
376 aa  214  2e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0003  recombination protein F  34.93 
 
 
365 aa  212  8e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0002  recombination protein F  32.28 
 
 
365 aa  212  1e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1725  recombination protein F  38.11 
 
 
390 aa  211  2e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0005  DNA replication and repair protein RecF  34.72 
 
 
370 aa  208  2e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  3.69508e-07  hitchhiker  1.45417e-07 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5273  recombination protein F  36.48 
 
 
384 aa  206  7e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0402761 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0003  recombination protein F  34.04 
 
 
370 aa  204  2e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.715959  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0003  DNA replication and repair protein RecF  35.36 
 
 
362 aa  202  6e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  1.15018e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3722  DNA replication and repair protein RecF  34.26 
 
 
385 aa  202  9e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000891221  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0004  DNA replication and repair protein RecF  30.71 
 
 
398 aa  200  3e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1094  recombination protein F  37.56 
 
 
380 aa  199  5e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1123  recombination protein F  37.56 
 
 
380 aa  199  5e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.633638 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00040  DNA replication and repair protein RecF  30.56 
 
 
390 aa  197  2e-49  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0003  DNA replication and repair protein RecF  34.93 
 
 
372 aa  197  4e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0003  recombination protein F  31.91 
 
 
368 aa  196  5e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00792918  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0003  DNA replication and repair protein RecF  34.93 
 
 
372 aa  196  7e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0025  DNA replication and repair protein RecF  33.91 
 
 
386 aa  196  8e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0004  DNA replication and repair protein RecF  29.26 
 
 
399 aa  194  1e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2214  DNA replication and repair protein RecF  31.65 
 
 
394 aa  193  3e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00444262 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0004  recombination protein F  29.13 
 
 
401 aa  193  4e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.582462  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0004  recombination protein F  30.47 
 
 
402 aa  193  4e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.15476e-13 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0004  DNA replication and repair protein RecF  29.56 
 
 
381 aa  192  6e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.321306  normal  0.933031 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00040  recombination protein F  29.55 
 
 
390 aa  190  3e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  3.32989e-05  normal  0.373412 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0005  Recombinational DNA repair ATPase (RecF pathway)- like protein  28.27 
 
 
390 aa  190  3e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.518698  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0003  DNA replication and repair protein RecF  30.81 
 
 
382 aa  189  5e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0004  recombination protein F  29.35 
 
 
380 aa  189  6e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0716162 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0003  DNA replication and repair protein RecF  33.61 
 
 
372 aa  189  7e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0004  recombination protein F  29.11 
 
 
380 aa  189  8e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2250  recombination protein F  35.49 
 
 
387 aa  189  8e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.122677 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0012  recombination protein F  29.11 
 
 
380 aa  189  8e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.121144 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16931  recombination protein F  34.92 
 
 
352 aa  188  1e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.919518  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0005  DNA replication and repair protein RecF  29.57 
 
 
401 aa  189  1e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0004  DNA replication and repair protein RecF  29.06 
 
 
397 aa  188  1e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0003  DNA replication and repair protein RecF  29.84 
 
 
397 aa  189  1e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0003  DNA replication and repair protein RecF  32.12 
 
 
365 aa  188  2e-46  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0003  DNA replication and repair protein RecF  31.73 
 
 
360 aa  188  2e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.447101  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2248  recombination protein F  36.44 
 
 
377 aa  187  2e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0004  DNA replication and repair protein RecF  28.73 
 
 
377 aa  188  2e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.780515  decreased coverage  0.00205006 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0004  DNA replication and repair protein RecF  33.71 
 
 
359 aa  186  4e-46  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0003  DNA replication and repair protein RecF  34.21 
 
 
358 aa  187  4e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0004  recombination protein F  28.38 
 
 
386 aa  186  7e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.187663 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0003  DNA replication and repair protein RecF  29.92 
 
 
363 aa  186  7e-46  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00030  recF protein  31.56 
 
 
378 aa  185  9e-46  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.172429  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0004  recombination protein F  29.84 
 
 
399 aa  185  1e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000897119  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0824  recombination protein F  29.11 
 
 
389 aa  185  1e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0004  recombination protein F  31.59 
 
 
377 aa  184  2e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0533102  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0003  recombination protein F  30.81 
 
 
371 aa  184  2e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0004  DNA replication and repair protein RecF  34.38 
 
 
363 aa  184  2e-45  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10003  recombination protein F  28.84 
 
 
385 aa  184  3e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0346  recombination protein F  32.3 
 
 
365 aa  184  3e-45  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.105676  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0003  DNA replication and repair protein RecF  31.64 
 
 
369 aa  183  5e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.979634 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1549  DNA replication and repair protein RecF  33.5 
 
 
359 aa  183  5e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.638976  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0004  DNA replication and repair protein RecF  28.09 
 
 
401 aa  182  6e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0234523  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0003  DNA repair and genetic recombination protein  34.53 
 
 
365 aa  182  9e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0214  DNA replication and repair protein RecF  33.16 
 
 
359 aa  181  1e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.613838  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0004  DNA replication and repair protein RecF  29.56 
 
 
379 aa  180  3e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2998  DNA replication and repair protein RecF  32.27 
 
 
357 aa  180  3e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0957887  normal  0.356139 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0004  recombination protein F  27.21 
 
 
420 aa  180  4e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00030  recF protein  30.08 
 
 
376 aa  180  4e-44  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000612951  decreased coverage  1.32668e-05 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>