139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0201 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_0201  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 293 aa  608  1e-173  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3046  radical SAM family protein  40.27 
 
 		 293 aa  265  5e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2142  Radical SAM domain protein  44.18 
 
 		 291 aa  246  2e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.608518  decreased coverage  0.00173745 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2963  radical SAM domain-containing protein  39.25 
 
 		 293 aa  240  2e-62  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.854509 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2529  radical SAM domain-containing protein  42.75 
 
 		 296 aa  239  4e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.496911  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2654  Radical SAM domain protein  38.91 
 
 		 291 aa  229  6e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000344406  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3790  Radical SAM domain protein  41.11 
 
 		 338 aa  228  1e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.135303  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1151  Radical SAM domain protein  41.61 
 
 		 291 aa  226  2e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.388903 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0919  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase, Fe-S oxidoreductase  41.02 
 
 		 292 aa  224  9e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1475  radical SAM domain-containing protein  36.27 
 
 		 298 aa  219  3e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0640288  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3059  radical SAM domain-containing protein  38.21 
 
 		 293 aa  203  2e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0453  radical SAM domain-containing protein  36.82 
 
 		 294 aa  204  2e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0456  radical SAM domain-containing protein  36.82 
 
 		 309 aa  202  5e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0530  radical SAM domain-containing protein  36.84 
 
 		 295 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3501  radical SAM domain-containing protein  36.84 
 
 		 295 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0717  radical SAM domain-containing protein  37.54 
 
 		 292 aa  201  9.999999999999999e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0365  radical SAM domain-containing protein  36.99 
 
 		 289 aa  200  1.9999999999999998e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00570597  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3100  Radical SAM domain protein  39.15 
 
 		 295 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.358776  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0486  radical SAM domain-containing protein  36.49 
 
 		 295 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4516  radical SAM domain-containing protein  36.75 
 
 		 293 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.193684 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3668  radical SAM domain-containing protein  36.07 
 
 		 293 aa  196  5.000000000000001e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000789266  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3965  radical SAM domain-containing protein  36.14 
 
 		 295 aa  195  6e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0407  hypothetical protein  37.68 
 
 		 294 aa  195  7e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1162  Radical SAM domain protein  38.08 
 
 		 295 aa  195  8.000000000000001e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0199468 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0528  hypothetical protein  36.2 
 
 		 295 aa  195  9e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25810  hypothetical protein  35.59 
 
 		 298 aa  193  2e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.723648  normal  0.254703 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1360  radical SAM domain-containing protein  36.49 
 
 		 300 aa  193  3e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.397431  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1884  radical SAM family protein  36.15 
 
 		 296 aa  193  4e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.295187  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3076  radical SAM family protein  35.59 
 
 		 292 aa  192  6e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0110421  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0423  radical SAM family protein  35.69 
 
 		 293 aa  192  7e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3395  radical SAM domain-containing protein  35.37 
 
 		 292 aa  192  7e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00495336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1640  radical SAM domain-containing protein  36.36 
 
 		 297 aa  191  1e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.387627  normal  0.955096 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2205  hypothetical protein  35.25 
 
 		 298 aa  189  5e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.42445  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0173  radical SAM domain-containing protein  32.99 
 
 		 292 aa  186  3e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000741532  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2989  radical SAM domain-containing protein  35.51 
 
 		 293 aa  186  6e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000144866  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0443  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase, putative  35.27 
 
 		 291 aa  184  2.0000000000000003e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2265  Radical SAM domain protein  34.51 
 
 		 293 aa  180  2e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3617  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase, Fe-S oxidoreductase  35.46 
 
 		 293 aa  178  1e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0657  Radical SAM domain protein  33.97 
 
 		 292 aa  177  3e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1744  radical SAM domain-containing protein  29.87 
 
 		 380 aa  155  6e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00743194  decreased coverage  0.000183859 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2870  Radical SAM domain protein  30.69 
 
 		 373 aa  153  4e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.578576 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02260  Fe-S oxidoreductase  28.93 
 
 		 293 aa  149  5e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26860  Fe-S oxidoreductase  29.82 
 
 		 291 aa  149  8e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0066  Radical SAM domain protein  30.53 
 
 		 293 aa  148  1.0000000000000001e-34  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.628263  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2726  Radical SAM domain protein  29.69 
 
 		 399 aa  145  7.0000000000000006e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0622  radical SAM domain-containing protein  28.73 
 
 		 311 aa  142  9e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.044899  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3411  Elongator protein 3/MiaB/NifB  32.49 
 
 		 257 aa  142  9e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13790  Fe-S oxidoreductase  30.91 
 
 		 297 aa  142  9e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1410  Radical SAM domain protein  27.93 
 
 		 377 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3023  radical SAM domain-containing protein  29.02 
 
 		 386 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2999  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase putative  29.33 
 
 		 388 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2061  radical SAM domain-containing protein  30.18 
 
 		 294 aa  128  9.000000000000001e-29  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.952171  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1505  radical SAM domain-containing protein  26.91 
 
 		 292 aa  128  1.0000000000000001e-28  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00044584 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04170  Fe-S oxidoreductase  28.35 
 
 		 293 aa  120  3e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.63469 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24530  Fe-S oxidoreductase  29.86 
 
 		 293 aa  117  3e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25530  Fe-S oxidoreductase  25.85 
 
 		 308 aa  114  2.0000000000000002e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.261112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1372  radical SAM domain-containing protein  26.53 
 
 		 402 aa  108  7.000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.798772 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2640  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  24.55 
 
 		 296 aa  105  7e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00660  Fe-S oxidoreductase  28.57 
 
 		 321 aa  105  1e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3579  radical SAM domain-containing protein  28.12 
 
 		 409 aa  103  4e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.630491  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16730  Fe-S oxidoreductase  26.71 
 
 		 332 aa  95.9  6e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.359613 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1019  Radical SAM domain protein  26.39 
 
 		 390 aa  95.9  7e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25380  Fe-S oxidoreductase  27.84 
 
 		 300 aa  94.4  2e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.76381  normal  0.564969 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3838  radical SAM domain-containing protein  28.57 
 
 		 156 aa  63.9  0.000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3496  hypothetical protein  62.16 
 
 		 38 aa  61.2  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.871156  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2393  radical SAM domain-containing protein  25.12 
 
 		 490 aa  60.5  0.00000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.386797  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3411  coproporphyrinogen III oxidase  24.17 
 
 		 401 aa  55.1  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.102052 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1177  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  24 
 
 		 372 aa  55.1  0.000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3127  radical SAM domain-containing protein  23.84 
 
 		 475 aa  52.4  0.000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.543412  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1980  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  24.53 
 
 		 380 aa  52.4  0.000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000136099  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2319  radical SAM family Fe-S protein  27.75 
 
 		 501 aa  52  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.518236  normal  0.0137531 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1119  radical SAM domain-containing protein  28.76 
 
 		 525 aa  51.2  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0138505  normal  0.560391 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11650  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  24.23 
 
 		 411 aa  50.4  0.00003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0627344  normal  0.396756 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3390  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester (oxidative) cyclase  24.53 
 
 		 485 aa  49.3  0.00008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2010  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  21.3 
 
 		 371 aa  48.9  0.00009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0774  ELP3 component of the RNA polymerase II complex  24.77 
 
 		 362 aa  48.5  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000160735  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0353  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester (oxidative) cyclase  26.32 
 
 		 485 aa  48.5  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.90319 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1243  radical SAM domain-containing protein  39.13 
 
 		 533 aa  48.5  0.0001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.445572  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3320  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  21.86 
 
 		 357 aa  48.5  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00918826  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2239  coproporphyrinogen III oxidase  24.77 
 
 		 409 aa  47.8  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.167009  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3090  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  22.84 
 
 		 476 aa  48.1  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000038537  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0852  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  23.18 
 
 		 436 aa  47.8  0.0003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2825  radical SAM domain-containing protein  25.86 
 
 		 476 aa  47  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000393045  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1150  oxidative cyclase-related protein  23.46 
 
 		 475 aa  46.6  0.0005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2416  radical SAM family protein  24.02 
 
 		 475 aa  46.6  0.0005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000137144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2963  radical SAM domain-containing protein  24.12 
 
 		 476 aa  46.6  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000286011  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0516  radical SAM domain-containing protein  25.87 
 
 		 501 aa  46.2  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00191  Mg-protoporphyrin IX monomethyl ester oxidative cyclase  24.5 
 
 		 506 aa  45.8  0.0007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0104  Elongator protein 3/MiaB/NifB  20.25 
 
 		 471 aa  45.8  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.016324  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0219  coproporphyrinogen III oxidase  19.34 
 
 		 445 aa  45.1  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.809943  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1170  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  25.19 
 
 		 369 aa  45.4  0.001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3382  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  22.67 
 
 		 473 aa  45.1  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0221  coproporphyrinogen III oxidase  19.34 
 
 		 445 aa  45.1  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0517942 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4118  coproporphyrinogen III oxidase  19.34 
 
 		 445 aa  45.1  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1224  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  22.79 
 
 		 370 aa  45.4  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.948437  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4239  coproporphyrinogen III oxidase  19.34 
 
 		 445 aa  45.1  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000466804 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6080  radical SAM domain-containing protein  23.86 
 
 		 527 aa  45.4  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0853304  hitchhiker  0.00330735 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0878  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  22.67 
 
 		 473 aa  45.4  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.858521  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1503  Elongator protein 3/MiaB/NifB  25.61 
 
 		 478 aa  44.3  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0448289  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3730  coproporphyrinogen III oxidase  19.34 
 
 		 445 aa  44.7  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.421344 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>