More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_4118 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_3506  coproporphyrinogen III oxidase  98.65 
 
 		 445 aa  920    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4520  coproporphyrinogen III oxidase  97.08 
 
 		 445 aa  910    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0221  coproporphyrinogen III oxidase  99.78 
 
 		 445 aa  929    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0517942 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4414  coproporphyrinogen III oxidase  91.91 
 
 		 445 aa  867    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.481198 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0219  coproporphyrinogen III oxidase  99.55 
 
 		 445 aa  927    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.809943  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4118  coproporphyrinogen III oxidase  100 
 
 		 445 aa  931    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3730  coproporphyrinogen III oxidase  97.08 
 
 		 445 aa  910    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.421344 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3801  coproporphyrinogen III oxidase  97.08 
 
 		 445 aa  910    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4239  coproporphyrinogen III oxidase  99.55 
 
 		 445 aa  927    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000466804 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0076  coproporphyrinogen III oxidase  84.27 
 
 		 445 aa  801    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3926  coproporphyrinogen III oxidase  96.85 
 
 		 445 aa  907    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4126  coproporphyrinogen III oxidase  89.44 
 
 		 442 aa  841    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3604  coproporphyrinogen III oxidase  82.46 
 
 		 444 aa  769    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0073  coproporphyrinogen III oxidase  92.34 
 
 		 447 aa  867    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4806  coproporphyrinogen III oxidase  90.79 
 
 		 445 aa  855    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0830506 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1666  coproporphyrinogen III oxidase  41.91 
 
 		 435 aa  339  5.9999999999999996e-92  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1710  Coproporphyrinogen dehydrogenase  40.19 
 
 		 441 aa  336  5.999999999999999e-91  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11490  Fe-S oxidoreductase, coproporphyrinogen III oxidase  42.51 
 
 		 435 aa  335  7e-91  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.297605  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0275  Coproporphyrinogen dehydrogenase  43.04 
 
 		 421 aa  335  9e-91  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0557282  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1563  coproporphyrinogen III oxidase  40.38 
 
 		 443 aa  335  1e-90  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0037  Coproporphyrinogen dehydrogenase  42.23 
 
 		 438 aa  331  2e-89  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0386  coproporphyrinogen III oxidase  40.58 
 
 		 448 aa  324  2e-87  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0412  coproporphyrinogen III oxidase  40.58 
 
 		 456 aa  323  3e-87  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0809182  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00440  Fe-S oxidoreductase, coproporphyrinogen III oxidase  39.24 
 
 		 443 aa  322  9.999999999999999e-87  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1654  coproporphyrinogen III oxidase  40.2 
 
 		 454 aa  311  1e-83  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27820  Fe-S oxidoreductase, coproporphyrinogen III oxidase  36.5 
 
 		 461 aa  310  2.9999999999999997e-83  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1538  coproporphyrinogen III oxidase  37.65 
 
 		 454 aa  304  2.0000000000000002e-81  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0047  coproporphyrinogen III oxidase  37.62 
 
 		 424 aa  298  1e-79  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3397  coproporphyrinogen dehydrogenase  39.71 
 
 		 439 aa  291  2e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2394  coproporphyrinogen dehydrogenase  36.63 
 
 		 428 aa  271  1e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4306  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  30.41 
 
 		 375 aa  136  8e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0329595  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3875  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  27.11 
 
 		 406 aa  135  9.999999999999999e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4436  coproporphyrinogen III oxidase  27.78 
 
 		 379 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000959102  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4168  coproporphyrinogen III oxidase  29.1 
 
 		 379 aa  131  3e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0038285  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0800  coproporphyrinogen III oxidase  27.18 
 
 		 379 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000109269  hitchhiker  5.6543700000000005e-18 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4339  coproporphyrinogen III oxidase  27.78 
 
 		 378 aa  127  3e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.26628e-29 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4216  coproporphyrinogen III oxidase  27.78 
 
 		 379 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4542  coproporphyrinogen III oxidase  27.78 
 
 		 378 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.3385  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1108  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  32.09 
 
 		 360 aa  127  4.0000000000000003e-28  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1151  coproporphyrinogen III oxidase  26.88 
 
 		 374 aa  127  5e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3351  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  32.42 
 
 		 384 aa  127  6e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1325  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  27.54 
 
 		 380 aa  126  8.000000000000001e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4054  coproporphyrinogen III oxidase  27.78 
 
 		 379 aa  125  1e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.749761  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1980  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  29.63 
 
 		 380 aa  126  1e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000136099  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4450  coproporphyrinogen III oxidase  27.25 
 
 		 378 aa  124  2e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000131876  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4398  coproporphyrinogen III oxidase  27.25 
 
 		 378 aa  124  3e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.601746  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1216  coproporphyrinogen III oxidase  28.65 
 
 		 378 aa  124  3e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4064  coproporphyrinogen III oxidase  27.32 
 
 		 379 aa  124  4e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.659192  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1442  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  30.03 
 
 		 368 aa  124  4e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000616139  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3306  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  26.12 
 
 		 423 aa  124  4e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.661128  normal  0.0726751 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3043  coproporphyrinogen III oxidase  27.59 
 
 		 378 aa  123  6e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000458873  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1626  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  25.77 
 
 		 387 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.981357 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0144  Coproporphyrinogen dehydrogenase  28.49 
 
 		 465 aa  121  1.9999999999999998e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1654  coproporphyrinogen III oxidase  27.67 
 
 		 350 aa  121  3e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.58488  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1363  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  26.78 
 
 		 389 aa  120  7e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2008  coproporphyrinogen III oxidase  30.47 
 
 		 377 aa  120  7e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2293  coproporphyrinogen III oxidase  30.29 
 
 		 377 aa  119  7.999999999999999e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1304  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  29.74 
 
 		 381 aa  119  9.999999999999999e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3225  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  26.19 
 
 		 432 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000826969  normal  0.0243619 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6524  Coproporphyrinogen dehydrogenase  27.08 
 
 		 431 aa  119  1.9999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2440  coproporphyrinogen III oxidase  28.01 
 
 		 382 aa  116  7.999999999999999e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000264436  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0858  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase, putative  31.23 
 
 		 378 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0560367  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0890  coproporphyrinogen III oxidase  27.3 
 
 		 376 aa  115  2.0000000000000002e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.112069  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0781  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  28.7 
 
 		 400 aa  114  3e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.41975  normal  0.123732 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1109  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  27.55 
 
 		 377 aa  114  4.0000000000000004e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.298913  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1641  coproporphyrinogen III oxidase  25.27 
 
 		 374 aa  114  4.0000000000000004e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.905653  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1675  coproporphyrinogen III oxidase  25.27 
 
 		 374 aa  114  4.0000000000000004e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.370593  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1249  coproporphyrinogen III oxidase  29.02 
 
 		 379 aa  114  5e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0603  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  26.63 
 
 		 378 aa  113  6e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1010  coproporphyrinogen III oxidase  25.5 
 
 		 379 aa  112  9e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12830  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  26.89 
 
 		 385 aa  112  9e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.402755  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1638  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  27.81 
 
 		 349 aa  112  1.0000000000000001e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17330  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  26.43 
 
 		 389 aa  112  1.0000000000000001e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.395345  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2500  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  26.69 
 
 		 378 aa  112  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000623828  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2285  Coproporphyrinogen dehydrogenase  26.22 
 
 		 403 aa  110  5e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.617284 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0776  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  30.21 
 
 		 378 aa  110  5e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00749552  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2082  coproporphyrinogen III oxidase  26.88 
 
 		 375 aa  110  5e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1148  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  24.15 
 
 		 403 aa  110  6e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.61254 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0501  coproporphyrinogen III oxidase  30 
 
 		 460 aa  109  1e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2687  coproporphyrinogen III oxidase  23.89 
 
 		 398 aa  108  1e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.992517  normal  0.224392 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1228  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  27.56 
 
 		 380 aa  109  1e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0208  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  28.3 
 
 		 381 aa  108  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000567402  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0582  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  28.13 
 
 		 388 aa  108  2e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1240  coproporphyrinogen III oxidase  24.57 
 
 		 404 aa  108  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000912695  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3559  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  25.32 
 
 		 393 aa  108  3e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3535  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  29.91 
 
 		 383 aa  108  3e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000160096  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0352  hypothetical protein  29.11 
 
 		 375 aa  108  3e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.332966 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1180  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  28.57 
 
 		 401 aa  107  4e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.219055  hitchhiker  0.00393596 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11650  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  23.29 
 
 		 411 aa  107  4e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0627344  normal  0.396756 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0030  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase, putative  28.3 
 
 		 385 aa  107  5e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.949331  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2444  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  25.84 
 
 		 385 aa  107  5e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3486  coproporphyrinogen III oxidase  27.42 
 
 		 392 aa  106  6e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2215  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  24.32 
 
 		 412 aa  107  6e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.892548  normal  0.0148235 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3320  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  28.53 
 
 		 357 aa  106  7e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00918826  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1554  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  26.82 
 
 		 376 aa  106  9e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000769723  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2843  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  28.23 
 
 		 374 aa  106  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.225724  normal  0.624237 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4155  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  27.86 
 
 		 416 aa  105  1e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1631  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  27.47 
 
 		 394 aa  105  2e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.526463  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04915  coproporphyrinogen III oxidase  26.89 
 
 		 376 aa  105  2e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0630  coproporphyrinogen III oxidase  26.23 
 
 		 393 aa  105  2e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.824124  normal  0.0911038 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>