298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_1194 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_1194  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 340 aa  672    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.232264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5142  monooxygenase, FAD-binding  81.71 
 
 		 348 aa  477  1e-133  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1088  monooxygenase, FAD-binding  62.94 
 
 		 338 aa  393  1e-108  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.129242  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1061  monooxygenase, FAD-binding protein  62.06 
 
 		 338 aa  388  1e-107  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1077  monooxygenase, FAD-binding  62.06 
 
 		 338 aa  388  1e-107  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0754157 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2102  monooxygenase FAD-binding  54.84 
 
 		 340 aa  317  2e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5951  monooxygenase FAD-binding protein  57.02 
 
 		 337 aa  305  1.0000000000000001e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0515432 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11161  oxidoreductase  49.69 
 
 		 338 aa  275  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.264314 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5117  monooxygenase FAD-binding  56.56 
 
 		 343 aa  275  1.0000000000000001e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1158  FAD dependent oxidoreductase  49.24 
 
 		 342 aa  269  4e-71  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.327107  hitchhiker  0.00150467 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00520  flavin-dependent dehydrogenase  44.63 
 
 		 363 aa  230  3e-59  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.845908  normal  0.877711 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4182  monooxygenase FAD-binding  42.3 
 
 		 362 aa  176  4e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.787993  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3104  monooxygenase, FAD-binding  35.63 
 
 		 373 aa  171  1e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0390  FAD-binding monooxygenase  45.32 
 
 		 368 aa  156  5.0000000000000005e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0418  monooxygenase FAD-binding  40.77 
 
 		 364 aa  155  1e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2603  monooxygenase FAD-binding  36.84 
 
 		 377 aa  150  2e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.425135  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0419  monooxygenase FAD-binding  43.56 
 
 		 363 aa  132  6e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5035  FAD dependent oxidoreductase  23.87 
 
 		 374 aa  84  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.378834 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0468  geranylgeranyl reductase  27.72 
 
 		 431 aa  82.8  0.000000000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3043  geranylgeranyl reductase  27.13 
 
 		 376 aa  82  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.483009 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1407  geranylgeranyl reductase  26.19 
 
 		 398 aa  81.6  0.00000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.426262  normal  0.248213 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1294  geranylgeranyl reductase  30.89 
 
 		 420 aa  81.6  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.730528  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4420  geranylgeranyl reductase  28.7 
 
 		 418 aa  80.9  0.00000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1268  geranylgeranyl reductase  29.56 
 
 		 375 aa  79.7  0.00000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0390  monooxygenase FAD-binding  27.88 
 
 		 425 aa  77  0.0000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0398453 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6208  monooxygenase FAD-binding protein  29.77 
 
 		 403 aa  76.3  0.0000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00171157  normal  0.384261 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3185  monooxygenase FAD-binding protein  25.6 
 
 		 375 aa  76.3  0.0000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.388588  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5052  geranylgeranyl reductase  28.06 
 
 		 434 aa  75.9  0.0000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2269  geranylgeranyl reductase  25.08 
 
 		 398 aa  75.9  0.000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1134  geranylgeranyl reductase  25.98 
 
 		 389 aa  74.7  0.000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.719323  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0583  geranylgeranyl reductase  28.48 
 
 		 425 aa  73.9  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4559  geranylgeranyl reductase  28.44 
 
 		 419 aa  72  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0279  geranylgeranyl reductase  26.83 
 
 		 424 aa  72  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.615542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3796  oxidoreductase  22.31 
 
 		 377 aa  72  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.204918 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1066  geranylgeranyl reductase  24.01 
 
 		 382 aa  72  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000111291  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6683  geranylgeranyl reductase  27.13 
 
 		 426 aa  71.6  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00871957  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1250  geranylgeranyl reductase  26.14 
 
 		 390 aa  70.5  0.00000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.375977  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1119  geranylgeranyl reductase  30.43 
 
 		 367 aa  70.5  0.00000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.920793 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0522  geranylgeranyl reductase  26.61 
 
 		 390 aa  70.1  0.00000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3806  FAD dependent oxidoreductase  23.3 
 
 		 375 aa  69.3  0.00000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.749975  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1355  geranylgeranyl reductase  28.03 
 
 		 358 aa  69.3  0.00000000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0520333 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2696  geranylgeranyl reductase, plantal and  27.66 
 
 		 435 aa  68.6  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1375  geranylgeranyl reductase  24.5 
 
 		 390 aa  68.6  0.0000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.545102  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1193  geranylgeranyl reductase  25 
 
 		 362 aa  68.6  0.0000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0917874  hitchhiker  0.0000705466 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0973  geranylgeranyl reductase  26.99 
 
 		 430 aa  67.8  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0266  geranylgeranyl reductase  29.01 
 
 		 445 aa  68.2  0.0000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.224418  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1343  geranylgeranyl reductase  28.12 
 
 		 411 aa  67.8  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.263408 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8053  geranylgeranyl reductase  28.26 
 
 		 423 aa  67.8  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.661392 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1199  geranylgeranyl reductase  31.66 
 
 		 423 aa  67.8  0.0000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17730  geranylgeranyl reductase family protein  32.25 
 
 		 466 aa  67  0.0000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1386  geranylgeranyl reductase  25.07 
 
 		 390 aa  66.6  0.0000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2536  geranylgeranyl reductase  29.84 
 
 		 382 aa  66.6  0.0000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000189662 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0537  geranylgeranyl reductase  29.18 
 
 		 434 aa  66.6  0.0000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.118976 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0023  geranylgeranyl reductase  26.61 
 
 		 398 aa  65.9  0.0000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2717  geranylgeranyl reductase  26.63 
 
 		 443 aa  65.5  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.593407 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0022  geranylgeranyl reductase  25.71 
 
 		 380 aa  65.5  0.000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07370  geranylgeranyl reductase family protein  28.57 
 
 		 431 aa  64.7  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0284516 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03738  hydroxylase  28.78 
 
 		 461 aa  64.7  0.000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1376  dehydrogenase, flavoprotein containing  28.18 
 
 		 384 aa  65.1  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000125722  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3079  monooxygenase FAD-binding protein  29.72 
 
 		 503 aa  65.1  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.591797  normal  0.0830218 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0035  geranylgeranyl reductase  24.92 
 
 		 380 aa  64.3  0.000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.916237  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3230  geranylgeranyl reductase  25.3 
 
 		 431 aa  64.3  0.000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716202 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0029  geranylgeranyl reductase  25.32 
 
 		 380 aa  63.9  0.000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1062  geranylgeranyl reductase  25.6 
 
 		 385 aa  63.5  0.000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4464  geranylgeranyl reductase  26.17 
 
 		 423 aa  63.2  0.000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.152921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2279  geranylgeranyl reductase  29.83 
 
 		 413 aa  63.2  0.000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1512  FAD dependent oxidoreductase  28.07 
 
 		 365 aa  63.2  0.000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.193117  normal  0.45553 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10918  putative oxidoreductase  22.04 
 
 		 374 aa  62.8  0.000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.183929  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4066  geranylgeranyl reductase  27.1 
 
 		 423 aa  62.8  0.000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.449431  normal  0.299227 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1273  geranylgeranyl reductase  26.13 
 
 		 457 aa  62.8  0.000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0513601 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1429  hypothetical protein  27.3 
 
 		 395 aa  62.8  0.000000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0716636 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0808  geranylgeranyl reductase  28.52 
 
 		 378 aa  61.2  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000424296 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1307  geranylgeranyl reductase  23.08 
 
 		 391 aa  61.6  0.00000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.398981  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3552  FAD dependent oxidoreductase  23.38 
 
 		 563 aa  60.5  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0311  hypothetical protein  29.08 
 
 		 409 aa  60.5  0.00000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.172492  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2035  FAD dependent oxidoreductase  23.68 
 
 		 379 aa  60.5  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1644  FAD dependent oxidoreductase  20.83 
 
 		 378 aa  60.5  0.00000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00782092 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0982  geranylgeranyl reductase  27.99 
 
 		 384 aa  60.1  0.00000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0176875  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0388  geranylgeranyl reductase  25.99 
 
 		 362 aa  59.7  0.00000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.1431 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2826  geranylgeranyl reductase  33.33 
 
 		 443 aa  59.3  0.00000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0858816 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0023  geranylgeranyl reductase  23.97 
 
 		 379 aa  58.9  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.086385  normal  0.74185 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0164  putative electron transfer oxidoreductase  27.91 
 
 		 420 aa  58.5  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.762503  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0648  geranylgeranyl reductase  25.97 
 
 		 430 aa  58.5  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0626765  normal  0.0232794 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0369  geranylgeranyl reductase  27.54 
 
 		 408 aa  58.2  0.0000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0683691  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0023  geranylgeranyl reductase  24.37 
 
 		 379 aa  58.2  0.0000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0136897  hitchhiker  0.00371909 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5969  geranylgeranyl reductase  28.66 
 
 		 409 aa  57.8  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.365894  normal  0.508891 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6095  geranylgeranyl reductase  26.77 
 
 		 440 aa  58.2  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0614228 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0044  geranylgeranyl reductase  24.05 
 
 		 380 aa  58.5  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0114  FAD dependent oxidoreductase  26.09 
 
 		 399 aa  58.5  0.0000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00154267  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2391  geranylgeranyl reductase  29.51 
 
 		 375 aa  58.5  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5384  monooxygenase FAD-binding  26.92 
 
 		 506 aa  58.2  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.297257  normal  0.119449 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3620  Ubiquinone biosynthesis hydroxylase, UbiH/UbiF/VisC/COQ6 family  26.7 
 
 		 407 aa  57.4  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3394  hypothetical protein  25.31 
 
 		 400 aa  57.8  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.626262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3292  hypothetical protein  25.12 
 
 		 400 aa  57.4  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.61616  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3289  hypothetical protein  25.12 
 
 		 400 aa  57.4  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.672486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0616  UbiH/UbiF/VisC/COQ6 family ubiquinone biosynthesis hydroxylase  26.58 
 
 		 407 aa  57.4  0.0000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0665574  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3227  hypothetical protein  25.12 
 
 		 400 aa  57.4  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.470901  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3214  hypothetical protein  25.12 
 
 		 400 aa  57.4  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00565491  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0807  geranylgeranyl reductase  23.6 
 
 		 348 aa  57  0.0000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00458422  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2388  flavoprotein-containing dehydrogenase  28.04 
 
 		 414 aa  56.6  0.0000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0523144  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>