More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_0708 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_0708  glycine oxidase ThiO  100 
 
 		 338 aa  654    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.740866  normal  0.0447216 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0197  glycine oxidase ThiO  86.05 
 
 		 342 aa  534  1e-151  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0535  glycine oxidase ThiO  81.6 
 
 		 338 aa  514  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0557  glycine oxidase ThiO  81.6 
 
 		 338 aa  514  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.959703  normal  0.488282 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0545  glycine oxidase ThiO  81.6 
 
 		 338 aa  514  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10420  thiamine biosynthesis oxidoreductase thiO  80 
 
 		 340 aa  513  1e-144  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.219353  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4390  glycine oxidase ThiO  49.55 
 
 		 361 aa  254  2.0000000000000002e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3748  glycine oxidase ThiO  49.85 
 
 		 342 aa  242  7.999999999999999e-63  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34650  glycine oxidase  44.29 
 
 		 375 aa  216  5.9999999999999996e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.048332  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0408  glycine oxidase ThiO  46.67 
 
 		 335 aa  205  8e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0882665  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0912  glycine oxidase ThiO  44.72 
 
 		 349 aa  183  3e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.970325  normal  0.149805 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0989  glycine oxidase ThiO  43.39 
 
 		 404 aa  175  9.999999999999999e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.136129  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1340  glycine oxidase ThiO  42.48 
 
 		 375 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.55181  hitchhiker  0.0035061 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3888  glycine oxidase ThiO  41.57 
 
 		 385 aa  158  1e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2783  glycine oxidase ThiO  42.94 
 
 		 372 aa  157  3e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.256999  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3033  glycine oxidase ThiO  39.89 
 
 		 382 aa  154  2e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000572882  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3405  glycine oxidase ThiO  38.83 
 
 		 371 aa  142  7e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.289575  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1044  thiamine biosynthesis oxidoreductase ThiO  39.49 
 
 		 391 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0577  glycine oxidase ThiO  36.03 
 
 		 405 aa  132  9e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2562  glycine oxidase ThiO  36.75 
 
 		 331 aa  132  9e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.185136  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4279  glycine oxidase ThiO  40.84 
 
 		 398 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.196313  hitchhiker  0.00513964 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2099  glycine oxidase ThiO  34.56 
 
 		 374 aa  129  7.000000000000001e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.119028  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3116  glycine oxidase ThiO  37.79 
 
 		 393 aa  128  1.0000000000000001e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.248059  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5997  glycine oxidase ThiO  37.88 
 
 		 388 aa  128  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.217156 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0445  thiamine biosynthesis oxidoreductase  31.1 
 
 		 316 aa  125  7e-28  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0094  glycine oxidase ThiO  41.71 
 
 		 368 aa  124  2e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.883041  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4885  glycine oxidase ThiO  36.54 
 
 		 384 aa  122  9e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1286  glycine oxidase ThiO  34.68 
 
 		 356 aa  120  3.9999999999999996e-26  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0773  glycine oxidase ThiO  38.01 
 
 		 392 aa  119  9.999999999999999e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.194429 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3428  glycine oxidase ThiO  35.14 
 
 		 369 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2781  glycine oxidase ThiO  35.25 
 
 		 450 aa  117  3e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.207412  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6396  glycine oxidase ThiO  33.44 
 
 		 316 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0605  glycine oxidase ThiO  34.65 
 
 		 440 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.14254  normal  0.0463062 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1152  glycine oxidase ThiO  34.29 
 
 		 360 aa  116  5e-25  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0616  glycine oxidase ThiO  34.66 
 
 		 411 aa  116  6e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.121955 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4092  FAD dependent oxidoreductase  35.14 
 
 		 368 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0346042  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1735  glycine oxidase ThiO  33.72 
 
 		 368 aa  113  4.0000000000000004e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1958  glycine oxidase ThiO  34.72 
 
 		 338 aa  113  5e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0655991  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2406  FAD dependent oxidoreductase  33.24 
 
 		 379 aa  113  6e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.000101651  normal  0.0131925 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1414  glycine oxidase ThiO  37.12 
 
 		 339 aa  112  8.000000000000001e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0284  glycine oxidase ThiO  32.61 
 
 		 334 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2502  glycine oxidase ThiO  33.42 
 
 		 454 aa  110  3e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000131028 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0208  glycine oxidase ThiO  32.92 
 
 		 334 aa  110  3e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.642429  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0217  D-amino acid oxidase family protein  32.92 
 
 		 334 aa  110  4.0000000000000004e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3650  glycine oxidase ThiO  34.76 
 
 		 324 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0750  glycine oxidase ThiO  29.62 
 
 		 365 aa  110  5e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2223  glycine oxidase ThiO  36.21 
 
 		 401 aa  109  8.000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.210224 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2166  glycine oxidase ThiO  34.11 
 
 		 346 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.402403 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2891  glycine oxidase ThiO  34.35 
 
 		 338 aa  108  1e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.894969  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01740  glycine oxidase ThiO  32.49 
 
 		 388 aa  107  2e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2166  glycine oxidase ThiO  34.14 
 
 		 337 aa  107  2e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.232699  normal  0.765835 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1568  glycine oxidase ThiO  34.28 
 
 		 652 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.272773 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5918  glycine oxidase ThiO  30.47 
 
 		 330 aa  108  2e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.669561  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0914  glycine oxidase ThiO  36.61 
 
 		 325 aa  108  2e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.173839  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31544  predicted protein  31.01 
 
 		 1033 aa  105  1e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0495  glycine oxidase ThiO  38.78 
 
 		 395 aa  104  2e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00233014 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0452  FAD-dependent oxidoreductase  27.75 
 
 		 354 aa  104  2e-21  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2170  aromatic-ring hydroxylase  32.77 
 
 		 371 aa  103  4e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2464  FAD dependent oxidoreductase  34.04 
 
 		 338 aa  102  1e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.750874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0041  FAD dependent oxidoreductase  32.73 
 
 		 325 aa  102  1e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.161257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1456  glycine oxidase ThiO  37.16 
 
 		 389 aa  102  1e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.307588  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07960  glycine oxidase ThiO  36.18 
 
 		 389 aa  102  1e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0404626  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0009  glycine oxidase ThiO  34.74 
 
 		 338 aa  100  3e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.363265 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6222  thiamine biosynthesis oxidoreductase thiO  33.54 
 
 		 338 aa  99.8  6e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.787474  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0580  glycine oxidase ThiO  34.28 
 
 		 406 aa  99  1e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0590429  decreased coverage  0.00474558 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1380  glycine/D-amino acid oxidase family protein  28.15 
 
 		 367 aa  97.1  3e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00611  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  27.91 
 
 		 367 aa  97.8  3e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.741936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4173  glycine oxidase ThiO  33.94 
 
 		 334 aa  97.1  4e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.269428 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1786  FAD dependent oxidoreductase  31.63 
 
 		 374 aa  96.7  5e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0563944  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1936  FAD dependent oxidoreductase  31.33 
 
 		 374 aa  95.5  1e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.969419  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0284  glycine oxidase ThiO  28.44 
 
 		 367 aa  95.1  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00610276 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3219  thiazole synthase  33.94 
 
 		 652 aa  93.2  6e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0462  glycine oxidase  33.98 
 
 		 378 aa  93.2  6e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0020  glycine oxidase ThiO  30.77 
 
 		 355 aa  89.7  6e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.504997 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0964  glycine oxidase ThiO  34.17 
 
 		 373 aa  89.7  6e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4109  glycine oxidase ThiO  32.51 
 
 		 666 aa  89.7  7e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0038  FAD dependent oxidoreductase  31.34 
 
 		 353 aa  89.4  9e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0048  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  26.56 
 
 		 369 aa  89  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0139  glycine oxidase ThiO  33.43 
 
 		 376 aa  88.6  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00501  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  26.56 
 
 		 369 aa  87.4  3e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00481  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  26.56 
 
 		 369 aa  87.4  3e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.254103  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0570  FAD dependent oxidoreductase  27.51 
 
 		 353 aa  86.7  5e-16  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4149  glycine oxidase ThiO  32.2 
 
 		 666 aa  86.3  7e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.572473 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0112  putative D-amino acid oxidase flavoprotein oxidoreductase  30.68 
 
 		 379 aa  85.9  9e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.333695  normal  0.56231 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3293  FAD dependent oxidoreductase  33.66 
 
 		 398 aa  85.9  9e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.204133 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3068  FAD dependent oxidoreductase  30.86 
 
 		 372 aa  85.9  9e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0186757  normal  0.325054 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1932  FAD dependent oxidoreductase  26.11 
 
 		 410 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4797  glycine oxidase ThiO  33.93 
 
 		 684 aa  84.7  0.000000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.937607  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2715  oxidoreductase, FAD-binding  29.49 
 
 		 361 aa  84.7  0.000000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.725073  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5036  glycine oxidase ThiO  32.57 
 
 		 360 aa  83.6  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3643  FAD dependent oxidoreductase  30.52 
 
 		 381 aa  83.6  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6771  glycine oxidase ThiO  32.76 
 
 		 410 aa  83.6  0.000000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3319  FAD dependent oxidoreductase  30.55 
 
 		 381 aa  82.4  0.000000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0947  FAD dependent oxidoreductase  28.01 
 
 		 374 aa  82.4  0.000000000000009  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4544  glycine oxidase ThiO  26.04 
 
 		 369 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.569361 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0251  oxidoreductase, FAD-dependent  24.93 
 
 		 393 aa  82.4  0.00000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2697  FAD dependent oxidoreductase  32.94 
 
 		 378 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0410  FAD dependent oxidoreductase  32.94 
 
 		 378 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.533271  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00541  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  26.56 
 
 		 367 aa  81.6  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3008  oxidoreductase, FAD-binding  32.75 
 
 		 377 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>