55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_3758 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_3758  hypothetical protein  100 
 
 		 337 aa  674    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0466  hypothetical protein  74.62 
 
 		 341 aa  476  1e-133  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.447492  normal  0.0433853 
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3203  hypothetical protein  61.59 
 
 		 332 aa  351  1e-95  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1816  hypothetical protein  51.75 
 
 		 326 aa  327  1.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1285  hypothetical protein  51.58 
 
 		 322 aa  320  3e-86  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.253608  normal  0.342893 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1254  hypothetical protein  51.58 
 
 		 322 aa  320  3e-86  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4599  hypothetical protein  49.06 
 
 		 325 aa  303  2.0000000000000002e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.934593  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0707  hypothetical protein  52.7 
 
 		 326 aa  290  2e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0855  hypothetical protein  52.7 
 
 		 326 aa  290  2e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3364  hypothetical protein  48.89 
 
 		 325 aa  289  5.0000000000000004e-77  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.175832  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3867  hypothetical protein  45.77 
 
 		 327 aa  270  2e-71  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0474  tetratricopeptide TPR_4  40.13 
 
 		 405 aa  108  1e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.223886 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1074  hypothetical protein  36.89 
 
 		 416 aa  103  3e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0537877  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3227  tetratricopeptide domain-containing protein  33.16 
 
 		 412 aa  96.7  5e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.654756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3801  tetratricopeptide TPR_4  31.37 
 
 		 425 aa  96.7  5e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4853  TPR repeat-containing protein  33.66 
 
 		 421 aa  95.1  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.712178  normal  0.175346 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4958  TPR repeat-containing protein  32.38 
 
 		 1621 aa  92.8  7e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2368  hypothetical protein  30 
 
 		 426 aa  87.4  3e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.021674 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2219  hypothetical protein  36.97 
 
 		 720 aa  83.6  0.000000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0983083 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2009  TPR repeat-containing protein  34.5 
 
 		 1502 aa  83.2  0.000000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0574678  decreased coverage  0.000390887 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0542  TPR repeat-containing protein  30.84 
 
 		 994 aa  82.4  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.397005  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2335  copper amine oxidase domain protein  26.39 
 
 		 934 aa  81.3  0.00000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8810  Tetratricopeptide domain protein  34.86 
 
 		 724 aa  81.3  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.872699  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4136  Tetratricopeptide domain protein  34.66 
 
 		 1219 aa  81.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2763  TPR repeat-containing protein  33.67 
 
 		 1711 aa  81.6  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0270  hypothetical protein  31.1 
 
 		 560 aa  80.9  0.00000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0400509 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0381  TPR repeat-containing protein  32.12 
 
 		 422 aa  79  0.0000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1936  TPR repeat-containing protein  33.78 
 
 		 1911 aa  79  0.0000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.261102  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6111  hypothetical protein  34.58 
 
 		 599 aa  75.5  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0209  Tetratricopeptide domain protein  27.57 
 
 		 552 aa  75.5  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000260586 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3677  TPR repeat-containing protein  34.66 
 
 		 1448 aa  74.7  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.114945  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2765  TPR repeat-containing protein  30.66 
 
 		 1083 aa  74.3  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1546  TPR repeat-containing protein  32.99 
 
 		 1779 aa  73.9  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.362162  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3125  Tetratricopeptide domain protein  30.26 
 
 		 1141 aa  73.6  0.000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3883  hypothetical protein  32.58 
 
 		 501 aa  72  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.879407 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6113  hypothetical protein  32.96 
 
 		 596 aa  70.1  0.00000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3809  hypothetical protein  28.94 
 
 		 405 aa  69.3  0.00000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3607  hypothetical protein  26.86 
 
 		 393 aa  67.4  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.496069  normal  0.349432 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4791  hypothetical protein  29.3 
 
 		 720 aa  65.5  0.000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3221  hypothetical protein  31.48 
 
 		 737 aa  64.3  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2481  TPR repeat-containing protein  30.04 
 
 		 1321 aa  64.3  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.834883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3460  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  32.81 
 
 		 644 aa  63.9  0.000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1977  hypothetical protein  30.06 
 
 		 714 aa  62.8  0.000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.574809 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4959  TPR repeat-containing protein  32.95 
 
 		 1544 aa  61.2  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.117684  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3302  Tetratricopeptide domain protein  33.76 
 
 		 982 aa  62  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0968  hypothetical protein  28.28 
 
 		 419 aa  57  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.364744  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2345  TPR repeat-containing protein  34.08 
 
 		 1869 aa  55.8  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.386383 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0848  Tetratricopeptide domain protein  32 
 
 		 992 aa  55.5  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0302645  normal  0.423245 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4460  TPR repeat-containing protein  30.68 
 
 		 1247 aa  55.5  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0317978  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2334  copper amine oxidase domain protein  33.67 
 
 		 460 aa  53.5  0.000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3871  hypothetical protein  65.79 
 
 		 42 aa  53.5  0.000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1908  copper amine oxidase-like protein  24.66 
 
 		 962 aa  50.8  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.510602  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1909  copper amine oxidase-like protein  26.09 
 
 		 490 aa  47.4  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0548415  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0210  hypothetical protein  25.78 
 
 		 476 aa  46.2  0.0008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3483  TPR repeat-containing protein  26.25 
 
 		 1054 aa  43.1  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.423026 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>