More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2998 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_2998  DNA replication and repair protein RecF  100 
 
 		 357 aa  705    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0957887  normal  0.356139 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0053  DNA replication and repair protein RecF  73 
 
 		 347 aa  501  1e-141  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1620  recombination protein F  40.95 
 
 		 358 aa  220  3e-56  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.251361 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0004  DNA replication and repair protein RecF  32.94 
 
 		 376 aa  187  2e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0003  DNA replication and repair protein RecF  35.69 
 
 		 360 aa  185  1.0000000000000001e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.447101  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0004  DNA replication and repair protein RecF  32.27 
 
 		 386 aa  180  2.9999999999999997e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00780262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0003  DNA replication and repair protein RecF  34.57 
 
 		 365 aa  179  7e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.390569  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0004  recombination protein F  32.44 
 
 		 371 aa  170  3e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.106759  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0434  DNA replication and repair protein RecF  36.69 
 
 		 392 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.626531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1991  recombination protein F  35.01 
 
 		 366 aa  163  4.0000000000000004e-39  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0004  recombination protein F  30.83 
 
 		 375 aa  163  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.864622  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0004  recombination protein F  30.83 
 
 		 375 aa  163  5.0000000000000005e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0004  recombination protein F  30.83 
 
 		 375 aa  163  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000104808  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0003  recombination protein F  33.53 
 
 		 370 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.715959  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00040  DNA replication and repair protein RecF  32.02 
 
 		 375 aa  162  6e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0004  recombination protein F  30.83 
 
 		 375 aa  162  6e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00277064  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0004  recombination protein F  30.83 
 
 		 375 aa  162  7e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0004  recombination protein F  30.83 
 
 		 375 aa  162  7e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0004  recombination protein F  30.83 
 
 		 375 aa  162  7e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.340003 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0004  recombination protein F  31.28 
 
 		 372 aa  162  1e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0004  recombination protein F  30.21 
 
 		 370 aa  162  1e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.188075  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0004  recombination protein F  30.83 
 
 		 375 aa  161  1e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5316  recombination protein F  30.83 
 
 		 375 aa  162  1e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0155044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0004  recombination protein F  31.39 
 
 		 373 aa  161  1e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.177605  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0004  recombination protein F  31.38 
 
 		 374 aa  161  1e-38  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0004  recombination protein F  30.21 
 
 		 370 aa  162  1e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.320094  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0004  recombination protein F  29.26 
 
 		 361 aa  161  1e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0004  recombination protein F  29.26 
 
 		 361 aa  161  1e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2550  recombination protein F  31.2 
 
 		 371 aa  161  2e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0191996  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0004  recombination protein F  31.2 
 
 		 374 aa  160  2e-38  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.60396e-25 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0003  DNA replication and repair protein RecF  36.01 
 
 		 372 aa  160  3e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0004  recombination protein F  30.83 
 
 		 375 aa  160  5e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2238  recombination protein F  34.13 
 
 		 359 aa  160  5e-38  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0003  DNA replication and repair protein RecF  35.49 
 
 		 372 aa  159  6e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0004  DNA replication and repair protein RecF  33.61 
 
 		 397 aa  159  6e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0004  DNA replication and repair protein RecF  31.37 
 
 		 360 aa  159  9e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0346  recombination protein F  31.46 
 
 		 365 aa  158  1e-37  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.105676  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0003  DNA replication and repair protein RecF  33.05 
 
 		 358 aa  157  3e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0004  DNA replication and repair protein RecF  34.28 
 
 		 371 aa  154  2e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.244423  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0003  DNA replication and repair protein RecF  29.07 
 
 		 369 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0749386  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0004  DNA replication and repair protein RecF  34.2 
 
 		 381 aa  154  2.9999999999999998e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.321306  normal  0.933031 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0004  DNA replication and repair protein RecF  31.56 
 
 		 373 aa  152  8e-36  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0003  DNA replication and repair protein RecF  31.73 
 
 		 382 aa  151  1e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0003  RecF protein  30.39 
 
 		 364 aa  150  2e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.056932  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0004  recombination protein F  30.21 
 
 		 374 aa  150  2e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000414234  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2156  recombination protein F  31.91 
 
 		 369 aa  150  3e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000779125  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3722  DNA replication and repair protein RecF  36.72 
 
 		 385 aa  150  3e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000891221  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0005  DNA replication and repair protein RecF  34.08 
 
 		 401 aa  149  6e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0004  DNA replication and repair protein RecF  35.19 
 
 		 374 aa  149  7e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000920069  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0004  DNA replication and repair protein RecF  35.07 
 
 		 377 aa  149  7e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.780515  decreased coverage  0.00205006 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2374  DNA replication and repair protein RecF  28.17 
 
 		 369 aa  149  8e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00040  recombination protein F  33.42 
 
 		 390 aa  148  2.0000000000000003e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.0000332989  normal  0.373412 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0004  recombination protein F  32.39 
 
 		 374 aa  148  2.0000000000000003e-34  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1772  DNA replication and repair protein RecF  32.39 
 
 		 371 aa  147  3e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0004  DNA replication and repair protein RecF  35.16 
 
 		 399 aa  147  3e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0004  recombination protein F  30.21 
 
 		 362 aa  147  3e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0003  DNA replication and repair protein RecF  29.81 
 
 		 370 aa  146  7.0000000000000006e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.152297 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0003  DNA replication and repair protein RecF  28.33 
 
 		 365 aa  146  7.0000000000000006e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0004  recombination protein F  34.81 
 
 		 377 aa  145  9e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0533102  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00040  DNA replication and repair protein RecF  32.28 
 
 		 414 aa  145  1e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0003  DNA replication and repair protein RecF  36.01 
 
 		 372 aa  145  2e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0004  DNA replication and repair protein RecF  31.94 
 
 		 398 aa  142  6e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0002  RecF protein  31.84 
 
 		 369 aa  142  7e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000642266  normal  0.645599 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0005  Recombinational DNA repair ATPase (RecF pathway)- like protein  31.62 
 
 		 390 aa  142  7e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.518698  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0004  recombination protein F  32.81 
 
 		 399 aa  142  8e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000897119  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0003  DNA replication and repair protein RecF  30.32 
 
 		 364 aa  142  8e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0004  recombination protein F  29.21 
 
 		 401 aa  142  8e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.582462  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0004  recombination protein F  33.43 
 
 		 386 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.187663 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0003  DNA replication and repair protein RecF  36.5 
 
 		 369 aa  140  3e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.979634 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0005  DNA replication and repair protein RecF  32.76 
 
 		 370 aa  140  3e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000369508  hitchhiker  0.000000145417 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09773  putative DNA replication and repair protein  27.12 
 
 		 359 aa  140  3e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.753312  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10003  recombination protein F  33.24 
 
 		 385 aa  139  4.999999999999999e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0003  recombination protein F  27.2 
 
 		 364 aa  139  6e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0004  recombination protein F  29.82 
 
 		 402 aa  139  7e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000215476 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0004  DNA replication and repair protein RecF  29.25 
 
 		 372 aa  138  1e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.370076  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0003  recombination protein F  29.74 
 
 		 364 aa  139  1e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0003  DNA replication and repair protein RecF  30.98 
 
 		 363 aa  137  2e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0824  recombination protein F  32.31 
 
 		 389 aa  137  2e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0004  DNA replication and repair protein RecF  28.81 
 
 		 363 aa  138  2e-31  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0003  DNA replication and repair protein RecF  25.2 
 
 		 362 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000115018  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2436  DNA replication and repair protein RecF  31.95 
 
 		 398 aa  137  3.0000000000000003e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.532549  normal  0.0198697 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0003  recombination protein F  34.41 
 
 		 371 aa  137  3.0000000000000003e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0003  recombination protein F  31.4 
 
 		 365 aa  137  4e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0004  DNA replication and repair protein RecF  31.87 
 
 		 380 aa  136  6.0000000000000005e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0004  recombination protein F  31.68 
 
 		 420 aa  136  6.0000000000000005e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0498  hypothetical protein  29.36 
 
 		 370 aa  135  9.999999999999999e-31  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0004  recombination protein F  32.44 
 
 		 380 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0012  recombination protein F  32.44 
 
 		 380 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.121144 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00030  DNA replication and repair protein RecF  31.99 
 
 		 414 aa  134  3e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0950556  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0004  DNA replication and repair protein RecF  30.96 
 
 		 378 aa  134  3e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.332828  normal  0.294433 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3391  recombination protein F  34.98 
 
 		 376 aa  133  3.9999999999999996e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0004  recombination protein F  32.44 
 
 		 380 aa  133  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0716162 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1725  recombination protein F  31.19 
 
 		 390 aa  132  6.999999999999999e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0002  recombination protein F  30.54 
 
 		 365 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0003  DNA replication and repair protein RecF  29.89 
 
 		 397 aa  131  2.0000000000000002e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00030  recF protein  30.77 
 
 		 378 aa  130  3e-29  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.172429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0004  DNA replication and repair protein RecF  34.19 
 
 		 391 aa  130  3e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00428915 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0003  recombination protein F  29.14 
 
 		 360 aa  130  3e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0130388  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0003  recombination protein F  28.69 
 
 		 360 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0851424  hitchhiker  0.00000000117147 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0003  recombination protein F  28.69 
 
 		 360 aa  129  6e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.133569  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>