234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1211 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_2647  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  63.57 
 
 
584 aa  753  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00961781  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1211  oligoendopeptidase pepF/M3 family  100 
 
 
587 aa  1193  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  8.02852e-07  normal  0.797975 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1167  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  44.05 
 
 
593 aa  504  1e-141  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3273  pepF/M3 family oligoendopeptidase  46.36 
 
 
603 aa  493  1e-138  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.474589 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1998  pepF/M3 family oligoendopeptidase  46.52 
 
 
603 aa  494  1e-138  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0556432 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4682  peptidase M3A and M3B thimet/oligopeptidase F  46.32 
 
 
606 aa  491  1e-137  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2001  oligoendopeptidase F, putative  39.26 
 
 
597 aa  423  1e-117  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0875927  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1212  pepF/M3 family oligoendopeptidase  38.89 
 
 
586 aa  411  1e-113  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0407734  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3298  pepF/M3 family oligoendopeptidase  36.96 
 
 
582 aa  380  1e-104  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6864  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  35.12 
 
 
612 aa  294  3e-78  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.176327 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1955  peptidase M3A and M3B thimet/oligopeptidase F  33.01 
 
 
607 aa  285  1e-75  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0130  Oligopeptidase F  29.27 
 
 
593 aa  266  8e-70  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0856  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  32.05 
 
 
598 aa  250  5e-65  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0490  oligoendopeptidase F  26.8 
 
 
603 aa  233  5e-60  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2576  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  30 
 
 
620 aa  229  8e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.855226 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1729  oligopeptidase F  28.21 
 
 
593 aa  226  8e-58  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0341754  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02130  oligopeptidase  30.75 
 
 
599 aa  218  2e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0281  oligoendopeptidase F  26.3 
 
 
600 aa  217  6e-55  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.651782  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0081  oligoendopeptidase F  28.05 
 
 
620 aa  216  8e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4260  pepF/M3 family oligoendopeptidase  27.55 
 
 
620 aa  216  9e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3296  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  28.91 
 
 
617 aa  215  2e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0076  oligoendopeptidase F  27.88 
 
 
620 aa  214  3e-54  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6862  putative oligoendopeptidase F  28.81 
 
 
664 aa  209  9e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.916639  normal  0.20394 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3597  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  27.99 
 
 
617 aa  209  1e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.794644  normal  0.398139 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003689  oligoendopeptidase F  30.11 
 
 
598 aa  208  2e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0370  pepF/M3 family oligoendopeptidase  28.15 
 
 
622 aa  207  5e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2981  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  28.24 
 
 
625 aa  206  7e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.54197  normal  0.947222 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1896  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  30.32 
 
 
601 aa  206  9e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0213  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  28.43 
 
 
616 aa  206  1e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.227297  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2052  pepF/M3 family oligoendopeptidase  27.71 
 
 
614 aa  204  3e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.841739  hitchhiker  3.09933e-06 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2754  pepF/M3 family oligoendopeptidase  28.07 
 
 
625 aa  204  4e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3702  oligoendopeptidase F  28.29 
 
 
619 aa  204  4e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2684  pepF/M3 family oligoendopeptidase  27.97 
 
 
627 aa  202  9e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.667149 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1431  peptidase M3B, oligoendopeptidase-like clade 3  31.96 
 
 
610 aa  202  1e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.838587  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2877  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  28.29 
 
 
601 aa  202  1e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0929363  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2070  pepF/M3 family oligoendopeptidase  27.53 
 
 
634 aa  202  1e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.024965  normal  0.33011 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3148  pepF/M3 family oligoendopeptidase  28.69 
 
 
616 aa  201  2e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00629046 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1411  peptidase M3B, oligoendopeptidase-like clade 3  31.3 
 
 
632 aa  200  5e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.249086  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2803  pepF/M3 family oligoendopeptidase  28.09 
 
 
623 aa  200  7e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.121144  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2730  pepF/M3 family oligoendopeptidase  27.27 
 
 
616 aa  199  8e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.797581  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4566  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  28.89 
 
 
607 aa  199  1e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0554379  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1636  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  26.32 
 
 
573 aa  198  2e-49  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3974  peptidase M3B, oligoendopeptidase-like clade 3  27.96 
 
 
626 aa  197  3e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.221188  normal  0.896374 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1075  pepF/M3 family oligoendopeptidase  28.76 
 
 
606 aa  197  5e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.371255  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1482  pepF/M3 family oligoendopeptidase  32.45 
 
 
615 aa  197  7e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0882  pepF/M3 family oligoendopeptidase  31.6 
 
 
608 aa  196  1e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.83984  normal  0.332504 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1225  peptidase M3B, oligoendopeptidase-related clade 3  27.63 
 
 
626 aa  195  2e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.100343  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2412  oligoendopeptidase F  28.6 
 
 
606 aa  195  2e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0632065  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1570  pepF/M3 family oligoendopeptidase  27.68 
 
 
606 aa  193  6e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.713222  normal  0.288392 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1295  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  27.47 
 
 
588 aa  193  8e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0778267  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0993  peptidase M3B, oligoendopeptidase-related clade 3  27.26 
 
 
625 aa  192  1e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2988  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  27.42 
 
 
588 aa  192  2e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.68469e-23 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1832  pepF/M3 family oligoendopeptidase  28.28 
 
 
620 aa  189  1e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.657708 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3392  peptidase M3B, oligoendopeptidase-related clade 3  26.68 
 
 
607 aa  189  1e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.935472  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4665  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  28.14 
 
 
638 aa  187  4e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1873  oligoendopeptidase F  26.94 
 
 
596 aa  186  1e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.201769  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1054  oligoendopeptidase F  26.23 
 
 
573 aa  185  2e-45  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2299  peptidase M3A and M3B thimet/oligopeptidase F  29.66 
 
 
598 aa  184  3e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.39572 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2674  oligoendopeptidase F, putative  29.66 
 
 
598 aa  184  3e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2192  peptidase M3B, oligoendopeptidase-related clade 3  27.09 
 
 
597 aa  184  4e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.246068  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2603  oligoendopeptidase  26.72 
 
 
611 aa  182  1e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0093862 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1295  peptidase M3B, oligoendopeptidase-related clade 3  28.33 
 
 
612 aa  182  1e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000104369  hitchhiker  0.000569902 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2055  pepF/M3 family oligoendopeptidase  27.45 
 
 
591 aa  181  4e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00862679  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0884  peptidase M3A and M3B thimet/oligopeptidase F  24.86 
 
 
578 aa  179  9e-44  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  2.2902e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0533  pepF/M3 family oligoendopeptidase  27.24 
 
 
589 aa  177  4e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.18439  normal  0.721981 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1177  pepF/M3 family oligoendopeptidase  23.55 
 
 
590 aa  175  2e-42  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0569  peptidase M3B, oligoendopeptidase-related clade 3  26.26 
 
 
606 aa  174  4e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0425519  hitchhiker  7.22694e-06 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0329  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  27.14 
 
 
615 aa  172  1e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.559929 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0066  rhomboid family protein  24.5 
 
 
573 aa  169  1e-40  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.411672  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2068  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  30.15 
 
 
603 aa  169  2e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.733195 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1694  peptidase M3A and M3B thimet/oligopeptidase F  25.21 
 
 
584 aa  167  6e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1993  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  25.87 
 
 
592 aa  167  6e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000167694  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2599  oligoendopeptidase F  26.28 
 
 
527 aa  164  4e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.013987  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0738  oligoendopeptidase F  27.53 
 
 
609 aa  162  2e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1242  oligoendopeptidase F  26.01 
 
 
573 aa  162  2e-38  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.906065  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1117  oligoendopeptidase F  26.06 
 
 
572 aa  161  3e-38  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0623  oligoendopeptidase F  25.72 
 
 
573 aa  160  7e-38  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2672  peptidase M3A and M3B thimet/oligopeptidase F  24.01 
 
 
539 aa  159  1e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0535944  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2902  oligoendopeptidase F, putative  24.91 
 
 
527 aa  159  2e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000435555  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0701  putative oligoendopeptidase F  23.17 
 
 
571 aa  157  4e-37  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2874  peptidase, family M3  25.73 
 
 
527 aa  155  2e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000399677 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2360  peptidase, family M3  25.27 
 
 
529 aa  155  2e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.995178  normal  0.643034 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2628  oligoendopeptidase F  25.73 
 
 
527 aa  155  2e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.91518e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0719  oligoendopeptidase F, putative  25.77 
 
 
569 aa  155  3e-36  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.954418  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2917  peptidase, family M3  24.45 
 
 
527 aa  152  2e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.496699  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2676  peptidase  30.94 
 
 
394 aa  148  2e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000426358  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34179  predicted protein  26.43 
 
 
577 aa  148  3e-34  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.137613  normal  0.109742 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2885  peptidase, family M3  29.6 
 
 
527 aa  147  6e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1422  oligoendopeptidase F  26.02 
 
 
596 aa  143  8e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0811423  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3050  oligoendopeptidase F  25.74 
 
 
599 aa  141  3e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1382  pepF/M3 family oligoendopeptidase  27.13 
 
 
589 aa  140  6e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  2.09164e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0388  oligoendopeptidase F  25.91 
 
 
608 aa  140  8e-32  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0196949  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2169  peptidase M3A and M3B, thimet/oligopeptidase F  25.82 
 
 
601 aa  139  1e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.944442 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2626  oligoendopeptidase F  30.14 
 
 
618 aa  138  2e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08170  Oligoendopeptidase F  23.48 
 
 
598 aa  132  1e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D12  oligopeptidase F  24.8 
 
 
604 aa  132  2e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1121  oligoendopeptidase F  22.98 
 
 
600 aa  131  3e-29  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0099  oligoendopeptidase F  26.47 
 
 
619 aa  131  4e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.893555  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1255  oligoendopeptidase F  29.76 
 
 
600 aa  130  6e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0012526 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4751  oligoendopeptidase F  25.08 
 
 
605 aa  129  1e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>