232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_2672 on replicon NC_010184
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011658  BCAH187_A2917  peptidase, family M3  71.89 
 
 
527 aa  789    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.496699  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2902  oligoendopeptidase F, putative  72.3 
 
 
527 aa  798    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000435555  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2360  peptidase, family M3  71.91 
 
 
529 aa  786    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.995178  normal  0.643034 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2676  peptidase  78.12 
 
 
394 aa  658    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000426358  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2628  oligoendopeptidase F  71.13 
 
 
527 aa  782    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000191518  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2599  oligoendopeptidase F  71.13 
 
 
527 aa  778    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.013987  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2885  peptidase, family M3  73.22 
 
 
527 aa  795    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2874  peptidase, family M3  71.13 
 
 
527 aa  783    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000399677 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2672  peptidase M3A and M3B thimet/oligopeptidase F  100 
 
 
539 aa  1117    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0535944  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0856  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  29.08 
 
 
598 aa  243  7.999999999999999e-63  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0130  Oligopeptidase F  32.94 
 
 
593 aa  242  1e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1955  peptidase M3A and M3B thimet/oligopeptidase F  30.59 
 
 
607 aa  213  4.9999999999999996e-54  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0281  oligoendopeptidase F  32.58 
 
 
600 aa  206  1e-51  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.651782  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02130  oligopeptidase  28.77 
 
 
599 aa  201  1.9999999999999998e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0490  oligoendopeptidase F  30.21 
 
 
603 aa  200  6e-50  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1212  pepF/M3 family oligoendopeptidase  34.57 
 
 
586 aa  194  3e-48  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0407734  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003689  oligoendopeptidase F  27.69 
 
 
598 aa  191  2.9999999999999997e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1729  oligopeptidase F  27.19 
 
 
593 aa  186  8e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0341754  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1998  pepF/M3 family oligoendopeptidase  31 
 
 
603 aa  178  3e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0556432 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6864  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  32.44 
 
 
612 aa  174  5e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.176327 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3298  pepF/M3 family oligoendopeptidase  28.6 
 
 
582 aa  169  9e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2001  oligoendopeptidase F, putative  31.58 
 
 
597 aa  162  2e-38  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0875927  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1167  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  29.47 
 
 
593 aa  162  2e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2647  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  26.5 
 
 
584 aa  159  1e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00961781  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4682  peptidase M3A and M3B thimet/oligopeptidase F  24.89 
 
 
606 aa  158  2e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3273  pepF/M3 family oligoendopeptidase  28.46 
 
 
603 aa  159  2e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.474589 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1211  oligoendopeptidase pepF/M3 family  25.21 
 
 
587 aa  159  2e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000000802852  normal  0.797975 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2052  pepF/M3 family oligoendopeptidase  25.76 
 
 
614 aa  145  2e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.841739  hitchhiker  0.00000309933 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3702  oligoendopeptidase F  25.54 
 
 
619 aa  139  1e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0882  pepF/M3 family oligoendopeptidase  26.57 
 
 
608 aa  136  9e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.83984  normal  0.332504 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3597  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  30.56 
 
 
617 aa  136  9e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.794644  normal  0.398139 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3296  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  27.46 
 
 
617 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0081  oligoendopeptidase F  28.09 
 
 
620 aa  134  5e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0076  oligoendopeptidase F  27.84 
 
 
620 aa  131  3e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4260  pepF/M3 family oligoendopeptidase  27.84 
 
 
620 aa  131  3e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2877  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  31.25 
 
 
601 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0929363  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0993  peptidase M3B, oligoendopeptidase-related clade 3  28.9 
 
 
625 aa  129  1.0000000000000001e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2754  pepF/M3 family oligoendopeptidase  30.9 
 
 
625 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2730  pepF/M3 family oligoendopeptidase  29.86 
 
 
616 aa  127  4.0000000000000003e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.797581  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1225  peptidase M3B, oligoendopeptidase-related clade 3  28.64 
 
 
626 aa  127  5e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.100343  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2981  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  30.85 
 
 
625 aa  127  6e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.54197  normal  0.947222 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2684  pepF/M3 family oligoendopeptidase  27.53 
 
 
627 aa  126  1e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.667149 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0066  rhomboid family protein  26.05 
 
 
573 aa  124  3e-27  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.411672  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1570  pepF/M3 family oligoendopeptidase  30.17 
 
 
606 aa  125  3e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.713222  normal  0.288392 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3148  pepF/M3 family oligoendopeptidase  28.92 
 
 
616 aa  124  4e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00629046 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2412  oligoendopeptidase F  30.17 
 
 
606 aa  124  5e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0632065  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0213  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  28.52 
 
 
616 aa  124  6e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.227297  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1075  pepF/M3 family oligoendopeptidase  30.17 
 
 
606 aa  124  6e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.371255  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0370  pepF/M3 family oligoendopeptidase  29.68 
 
 
622 aa  123  7e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3392  peptidase M3B, oligoendopeptidase-related clade 3  24.42 
 
 
607 aa  123  9.999999999999999e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.935472  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1832  pepF/M3 family oligoendopeptidase  29.93 
 
 
620 aa  122  9.999999999999999e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.657708 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2603  oligoendopeptidase  29.83 
 
 
611 aa  122  9.999999999999999e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0093862 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1431  peptidase M3B, oligoendopeptidase-like clade 3  28.91 
 
 
610 aa  121  3e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.838587  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0569  peptidase M3B, oligoendopeptidase-related clade 3  28.47 
 
 
606 aa  120  3.9999999999999996e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0425519  hitchhiker  0.00000722694 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2803  pepF/M3 family oligoendopeptidase  29.59 
 
 
623 aa  120  7.999999999999999e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.121144  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1873  oligoendopeptidase F  24.46 
 
 
596 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.201769  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6862  putative oligoendopeptidase F  30.18 
 
 
664 aa  119  9.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.916639  normal  0.20394 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4665  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  30.18 
 
 
638 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4566  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  25.52 
 
 
607 aa  118  3e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0554379  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3974  peptidase M3B, oligoendopeptidase-like clade 3  28.57 
 
 
626 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.221188  normal  0.896374 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1411  peptidase M3B, oligoendopeptidase-like clade 3  28.91 
 
 
632 aa  117  5e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.249086  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1382  pepF/M3 family oligoendopeptidase  25.65 
 
 
589 aa  117  6e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000209164  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0701  putative oligoendopeptidase F  25.36 
 
 
571 aa  115  1.0000000000000001e-24  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2070  pepF/M3 family oligoendopeptidase  25.93 
 
 
634 aa  115  2.0000000000000002e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.024965  normal  0.33011 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1636  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  25.33 
 
 
573 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1105  peptidase  26.15 
 
 
566 aa  114  3e-24  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.567346  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0329  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  27.53 
 
 
615 aa  113  7.000000000000001e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.559929 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2674  oligoendopeptidase F, putative  28.99 
 
 
598 aa  113  1.0000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2299  peptidase M3A and M3B thimet/oligopeptidase F  28.99 
 
 
598 aa  113  1.0000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.39572 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1482  pepF/M3 family oligoendopeptidase  23.73 
 
 
615 aa  113  1.0000000000000001e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2576  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  27.52 
 
 
620 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.855226 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0533  pepF/M3 family oligoendopeptidase  25.76 
 
 
589 aa  110  7.000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.18439  normal  0.721981 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1054  oligoendopeptidase F  27.25 
 
 
573 aa  108  2e-22  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1295  peptidase M3B, oligoendopeptidase-related clade 3  30.8 
 
 
612 aa  108  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000104369  hitchhiker  0.000569902 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2192  peptidase M3B, oligoendopeptidase-related clade 3  28.57 
 
 
597 aa  108  2e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.246068  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1993  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  25.59 
 
 
592 aa  108  3e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000167694  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1295  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  22.77 
 
 
588 aa  106  1e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0778267  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2055  pepF/M3 family oligoendopeptidase  25.38 
 
 
591 aa  105  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00862679  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2988  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  28.24 
 
 
588 aa  105  3e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.68469e-23 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0719  oligoendopeptidase F, putative  25.32 
 
 
569 aa  104  3e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.954418  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1242  oligoendopeptidase F  24.87 
 
 
573 aa  103  6e-21  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.906065  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1117  oligoendopeptidase F  24.87 
 
 
572 aa  102  1e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1177  pepF/M3 family oligoendopeptidase  28.82 
 
 
590 aa  100  5e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2002  oligoendopeptidase F  27.05 
 
 
594 aa  100  8e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000655164  normal  0.321245 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0623  oligoendopeptidase F  25.52 
 
 
573 aa  100  8e-20  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1694  peptidase M3A and M3B thimet/oligopeptidase F  27.34 
 
 
584 aa  97.1  7e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2169  peptidase M3A and M3B, thimet/oligopeptidase F  27.09 
 
 
601 aa  95.1  3e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.944442 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3699  oligoendopeptidase F  26.06 
 
 
597 aa  94  6e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2677  hypothetical protein  45.76 
 
 
118 aa  93.2  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00267995  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1896  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  26.09 
 
 
601 aa  92.8  1e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2068  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  23.02 
 
 
603 aa  92.4  2e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.733195 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5250  oligoendopeptidase F  24.83 
 
 
605 aa  91.7  3e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1539  oligoendopeptidase F  25.94 
 
 
622 aa  91.7  3e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2626  oligoendopeptidase F  27.97 
 
 
618 aa  91.7  3e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5310  oligoendopeptidase F  24.83 
 
 
605 aa  90.9  5e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5706  oligoendopeptidase F  24.83 
 
 
605 aa  90.9  5e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5579  putative oligoendopeptidase F  24.91 
 
 
605 aa  89.7  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0757693  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5138  oligoendopeptidase F  24.83 
 
 
605 aa  89.7  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5152  oligoendopeptidase F  24.48 
 
 
605 aa  89  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0490597  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5641  oligoendopeptidase F  24.48 
 
 
605 aa  89.4  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000270778  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>