125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_3819 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_3819  Carboxymuconolactone decarboxylase  100 
 
 		 210 aa  430  1e-120  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.632879  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1494  carboxymuconolactone decarboxylase  38.81 
 
 		 213 aa  138  7e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.269396 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0928  carboxymuconolactone decarboxylase  37.77 
 
 		 859 aa  132  5e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.714443  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1611  hypothetical protein  31.72 
 
 		 189 aa  109  3e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0145659 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0594  hypothetical protein  35.94 
 
 		 211 aa  99  4e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0886  hypothetical protein  31.22 
 
 		 186 aa  98.6  6e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.717688  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0712  hypothetical protein  31.05 
 
 		 186 aa  94.4  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.212334 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6153  Carboxymuconolactone decarboxylase  31.18 
 
 		 191 aa  88.6  6e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1168  Carboxymuconolactone decarboxylase  30.85 
 
 		 236 aa  87  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0628655  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1268  hypothetical protein  32.65 
 
 		 204 aa  86.7  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.739045 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1399  hypothetical protein  32.19 
 
 		 207 aa  82  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0802655  normal  0.0447539 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1334  hypothetical protein  31.51 
 
 		 207 aa  80.9  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.256445 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2093  hypothetical protein  35.42 
 
 		 187 aa  78.6  0.00000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0291682  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1482  hypothetical protein  35.42 
 
 		 187 aa  78.6  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1121  hypothetical protein  35.42 
 
 		 187 aa  78.6  0.00000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1401  hypothetical protein  35.42 
 
 		 187 aa  78.6  0.00000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3153  hypothetical protein  35.42 
 
 		 193 aa  78.6  0.00000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2386  4-carboxymuconolactone decarboxylase  35.42 
 
 		 193 aa  78.6  0.00000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1625  hypothetical protein  31.38 
 
 		 217 aa  78.2  0.00000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.113582 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1143  hypothetical protein  33.57 
 
 		 185 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.245046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0028  carboxymuconolactone decarboxylase  31.97 
 
 		 185 aa  77  0.0000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5467  Carboxymuconolactone decarboxylase  34.04 
 
 		 184 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.309116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3267  hypothetical protein  34.27 
 
 		 187 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2050  hypothetical protein  31.97 
 
 		 216 aa  76.3  0.0000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.562513  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3981  hypothetical protein  34.56 
 
 		 195 aa  75.1  0.0000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.354663  decreased coverage  0.000440982 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4499  carboxymuconolactone decarboxylase  32.87 
 
 		 184 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.414463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1658  carboxymuconolactone decarboxylase  31.55 
 
 		 187 aa  73.2  0.000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.565944  normal  0.978426 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5881  Carboxymuconolactone decarboxylase  33.11 
 
 		 190 aa  72  0.000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1659  carboxymuconolactone decarboxylase  28.66 
 
 		 183 aa  72  0.000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.413809  normal  0.9764 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2163  carboxymuconolactone decarboxylase  28.8 
 
 		 194 aa  70.9  0.00000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.175503  normal  0.568346 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5221  carboxymuconolactone decarboxylase  32.62 
 
 		 184 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.520498  normal  0.214637 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4279  carboxymuconolactone decarboxylase  31.47 
 
 		 184 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.445226  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0805  carboxymuconolactone decarboxylase  28.57 
 
 		 188 aa  70.1  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4087  carboxymuconolactone decarboxylase  31.47 
 
 		 184 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4676  carboxymuconolactone decarboxylase  31.97 
 
 		 181 aa  69.7  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3436  hypothetical protein  31.91 
 
 		 184 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1956  hypothetical protein  32.9 
 
 		 184 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0715147  normal  0.617384 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3497  carboxymuconolactone decarboxylase  32.45 
 
 		 184 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0111  carboxymuconolactone decarboxylase  30.88 
 
 		 174 aa  69.3  0.00000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.75447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1053  carboxymuconolactone decarboxylase  30.82 
 
 		 187 aa  69.3  0.00000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3980  carboxymuconolactone decarboxylase  33.8 
 
 		 184 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.395763  normal  0.33482 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4385  hypothetical protein  32.65 
 
 		 181 aa  68.9  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.275783  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41770  hypothetical protein  29.93 
 
 		 149 aa  68.9  0.00000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.285503  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4181  carboxymuconolactone decarboxylase  30.6 
 
 		 173 aa  68.2  0.00000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.917886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2440  carboxymuconolactone decarboxylase  30.5 
 
 		 176 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0701  hypothetical protein  33.33 
 
 		 181 aa  68.2  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.880116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1934  hypothetical protein  30.59 
 
 		 174 aa  67  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000792468  normal  0.160018 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0988  hypothetical protein  31.58 
 
 		 186 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2352  hypothetical protein  31.47 
 
 		 187 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5286  Carboxymuconolactone decarboxylase  31.97 
 
 		 181 aa  65.1  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0750237  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4212  carboxymuconolactone decarboxylase  32.62 
 
 		 176 aa  64.3  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0509659  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3120  Carboxymuconolactone decarboxylase  32.38 
 
 		 220 aa  59.3  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.104846  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0971  hypothetical protein  30.07 
 
 		 170 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000637227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0484  hypothetical protein  28.28 
 
 		 192 aa  58.9  0.00000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.457573  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2144  carboxymuconolactone decarboxylase  29.11 
 
 		 173 aa  58.2  0.00000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.547762  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2839  carboxymuconolactone decarboxylase  31.71 
 
 		 187 aa  57.4  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.242216  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1632  carboxymuconolactone decarboxylase  25.76 
 
 		 190 aa  57.8  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.543997 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3712  carboxymuconolactone decarboxylase  27.15 
 
 		 193 aa  57.8  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1193  carboxymuconolactone decarboxylase  27.89 
 
 		 180 aa  57.4  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.739413  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4644  hypothetical protein  27.15 
 
 		 177 aa  57  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.350838  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7432  hypothetical protein  27.27 
 
 		 182 aa  56.6  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2473  carboxymuconolactone decarboxylase  28.19 
 
 		 178 aa  57  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.227868  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3746  carboxymuconolactone decarboxylase  31.39 
 
 		 176 aa  55.5  0.0000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.444516  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3819  carboxymuconolactone decarboxylase  31.39 
 
 		 176 aa  55.5  0.0000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.89884 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3758  carboxymuconolactone decarboxylase  31.39 
 
 		 176 aa  55.5  0.0000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.284023  normal  0.718458 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1245  Carboxymuconolactone decarboxylase  28.17 
 
 		 178 aa  54.3  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5137  alkylhydroperoxidase AhpD core  31.9 
 
 		 185 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5226  alkylhydroperoxidase  31.9 
 
 		 185 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.528293 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5518  alkylhydroperoxidase  31.9 
 
 		 185 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.707884 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3707  carboxymuconolactone decarboxylase  29.08 
 
 		 176 aa  52.4  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3780  carboxymuconolactone decarboxylase  29.08 
 
 		 176 aa  52.4  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.422655  normal  0.467747 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0965  hypothetical protein  29.75 
 
 		 180 aa  52.4  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3720  carboxymuconolactone decarboxylase  29.08 
 
 		 176 aa  52.4  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2975  alkylhydroperoxidase  27.21 
 
 		 217 aa  52  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3269  hypothetical protein  25.29 
 
 		 220 aa  52  0.000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000290598 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6223  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  28.68 
 
 		 179 aa  52  0.000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.218919  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2075  Carboxymuconolactone decarboxylase  31.03 
 
 		 180 aa  51.6  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.138932  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4242  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  29.85 
 
 		 184 aa  51.2  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.938374 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0110  carboxymuconolactone decarboxylase  28.32 
 
 		 179 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.819214  normal  0.0623628 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4779  carboxymuconolactone decarboxylase  28.57 
 
 		 229 aa  50.8  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3003  alkylhydroperoxidase AhpD family core domain protein  30.25 
 
 		 144 aa  50.1  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0047955 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2951  alkylhydroperoxidase AhpD family core domain protein  30.25 
 
 		 144 aa  50.1  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0696867  normal  0.0134978 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6226  carboxymuconolactone decarboxylase  29.37 
 
 		 184 aa  49.3  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.676342  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1906  uncharacterized peroxidase-related enzyme  25.3 
 
 		 180 aa  48.9  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0226007  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1341  alkylhydroperoxidase  29.6 
 
 		 156 aa  48.9  0.00006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.728032 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7158  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  29.85 
 
 		 178 aa  47.8  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0798  carboxymuconolactone decarboxylase  27.1 
 
 		 180 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.629789  normal  0.833566 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0155  alkylhydroperoxidase  27.78 
 
 		 153 aa  47.8  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.804329 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7422  hypothetical protein  29.02 
 
 		 186 aa  47  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.752552  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2623  alkylhydroperoxidase  28.43 
 
 		 153 aa  47.4  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3241  hypothetical protein  29.47 
 
 		 144 aa  47.4  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.371033  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2150  uncharacterized peroxidase-related enzyme  28.57 
 
 		 178 aa  47  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0515  alkylhydroperoxidase AhpD core  28.79 
 
 		 178 aa  46.2  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.51071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3500  alkylhydroperoxidase  33.02 
 
 		 177 aa  46.2  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3952  hypothetical protein  27.85 
 
 		 180 aa  46.2  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.99956 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3109  alkylhydroperoxidase AhpD family core domain-containing protein  29.41 
 
 		 144 aa  45.8  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.280387  normal  0.494752 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2986  alkylhydroperoxidase AhpD family core domain-containing protein  29.41 
 
 		 144 aa  45.8  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0876914 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2920  alkylhydroperoxidase AhpD family core domain protein  29.41 
 
 		 144 aa  45.8  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.789877  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6281  carboxymuconolactone decarboxylase  25.42 
 
 		 179 aa  45.4  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00558931  normal  0.0302802 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0851  Carboxymuconolactone decarboxylase  25.36 
 
 		 185 aa  45.4  0.0007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>