More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0145 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_0145  ABC transporter related  100 
 
 		 295 aa  600  1e-170  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0967597  decreased coverage  0.0026708 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0395  ABC transporter-related protein  62.16 
 
 		 295 aa  372  1e-102  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1464  ABC transporter related  61.02 
 
 		 293 aa  367  1e-100  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.708189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2285  ABC transporter related  60.81 
 
 		 296 aa  356  1.9999999999999998e-97  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1546  ABC transporter related protein  43.92 
 
 		 341 aa  257  2e-67  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2709  ABC transporter related  44.11 
 
 		 298 aa  253  2.0000000000000002e-66  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0350953 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2980  ABC transporter related  42.71 
 
 		 306 aa  244  9.999999999999999e-64  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1427  ABC transporter related  42.67 
 
 		 332 aa  229  4e-59  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2942  ABC transporter related protein  39.11 
 
 		 251 aa  193  4e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3143  ABC transporter related protein  40 
 
 		 274 aa  191  2e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4207  ABC transporter related  43.81 
 
 		 236 aa  189  2.9999999999999997e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1501  sodium ABC transporter ATP-binding protein  41.67 
 
 		 248 aa  182  4.0000000000000006e-45  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1446  ABC transporter related  41.23 
 
 		 248 aa  182  5.0000000000000004e-45  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1530  ABC transporter related  35.52 
 
 		 304 aa  182  7e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.653437  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1790  ABC transporter related  38.14 
 
 		 316 aa  180  2e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.154782 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3873  ABC transporter related  40.35 
 
 		 248 aa  179  4e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02799  sodium ABC transporter ATP-binding protein  42.93 
 
 		 248 aa  178  8e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2810  ABC transporter related protein  43.4 
 
 		 315 aa  178  1e-43  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000850582  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0363  ABC transporter related  36.91 
 
 		 243 aa  178  1e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0340  ABC transporter related  36.91 
 
 		 243 aa  177  2e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1219  ABC transporter related  38.65 
 
 		 299 aa  177  2e-43  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.538125  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1128  ABC transporter related protein  38.74 
 
 		 253 aa  177  2e-43  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0998662  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3576  ATP-binding transport protein NatA  40.09 
 
 		 244 aa  176  4e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19730  ABC transporter related  40.91 
 
 		 252 aa  176  5e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0113  ABC transporter related  36.05 
 
 		 241 aa  175  7e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2043  ABC transporter related  40.95 
 
 		 311 aa  174  9.999999999999999e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.289791  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1770  ABC transporter related protein  41.07 
 
 		 308 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.471072  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2467  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  32.9 
 
 		 305 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0376  ABC transporter related  37.27 
 
 		 339 aa  174  1.9999999999999998e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6081  ABC transporter related protein  36.54 
 
 		 317 aa  173  2.9999999999999996e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1545  ABC-type multidrug transporter, ATP-binding protein; gliding motility-associated protein  40.27 
 
 		 305 aa  173  3.9999999999999995e-42  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00000116898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2644  ABC transporter, ATPase subunit  37.29 
 
 		 317 aa  172  6.999999999999999e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0758  ABC transporter related  36.36 
 
 		 305 aa  172  6.999999999999999e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.334038 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0648  ABC transporter related  38.56 
 
 		 308 aa  172  7.999999999999999e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1451  ABC transporter related protein  37 
 
 		 266 aa  171  1e-41  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0850349  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0242  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  38.67 
 
 		 312 aa  171  1e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00751289  normal  0.894903 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2070  ABC transporter-related protein  39.32 
 
 		 316 aa  171  1e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.894734  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1163  ABC transporter related  40.91 
 
 		 303 aa  171  1e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1741  ABC transporter related protein  39.27 
 
 		 321 aa  171  1e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3749  ABC transporter related protein  41.38 
 
 		 310 aa  171  2e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3978  ABC transporter related  38.39 
 
 		 244 aa  170  2e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.73602  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0214  ABC transporter related  38.2 
 
 		 303 aa  169  3e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000423562  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3116  ABC transporter related  36.73 
 
 		 326 aa  170  3e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.389623  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4279  ABC transporter related  39.29 
 
 		 244 aa  170  3e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3471  gliding motility-associated ABC transporter ATP- binding subunit GldA  40 
 
 		 305 aa  169  4e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000514218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0726  ABC transporter related  31.79 
 
 		 316 aa  169  4e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0070  ABC transporter related  39.29 
 
 		 244 aa  169  4e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0075  ABC transporter related  39.29 
 
 		 244 aa  169  4e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1891  ABC transporter related  31.94 
 
 		 320 aa  169  4e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.572686  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0072  ABC transporter related  39.29 
 
 		 244 aa  169  5e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2142  ABC transporter, ATPase subunit  38.91 
 
 		 311 aa  169  5e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.560639  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0036  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  33 
 
 		 325 aa  169  5e-41  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0600  gliding motility protein  37.67 
 
 		 290 aa  169  6e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.884739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2441  ABC transporter related protein  40.45 
 
 		 250 aa  169  7e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4865  ABC transporter related  37.5 
 
 		 244 aa  168  9e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1723  ABC transporter ATP-binding protein  39.19 
 
 		 308 aa  168  9e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3781  ABC transporter-related protein  37.5 
 
 		 244 aa  168  9e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0393  ABC transporter related  40.18 
 
 		 244 aa  168  1e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0075  ABC transporter related  37.5 
 
 		 244 aa  167  1e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000273343 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0056  ABC transporter related  39.29 
 
 		 244 aa  168  1e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0070  ATP-binding transport protein NatA  37.5 
 
 		 244 aa  167  2e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3195  ABC transporter related protein  39.81 
 
 		 285 aa  167  2e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.103158 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0067  ABC transporter related  36.61 
 
 		 244 aa  167  2e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4512  ABC transporter, ATPase subunit  33.22 
 
 		 305 aa  167  2e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16714  normal  0.549745 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0073  ABC transporter related  38.39 
 
 		 244 aa  167  2e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.334195 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0071  ABC transporter related  38.39 
 
 		 244 aa  167  2e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1669  ABC transporter related  36.44 
 
 		 338 aa  167  2.9999999999999998e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.700006  hitchhiker  0.00242494 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0874  ABC transporter related  40.54 
 
 		 312 aa  166  2.9999999999999998e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.468306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1117  ABC transporter related  37.84 
 
 		 317 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0878  ABC transporter, ATP-binding protein  39.37 
 
 		 266 aa  167  2.9999999999999998e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1766  ABC transporter-like protein  36.11 
 
 		 311 aa  166  4e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0222  hypothetical protein  31.51 
 
 		 308 aa  166  4e-40  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.238657 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2132  ABC transporter-related protein  37.39 
 
 		 245 aa  166  4e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.76673  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07170  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  39.63 
 
 		 256 aa  166  4e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.143642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0376  ABC transporter related  39.73 
 
 		 244 aa  166  4e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2672  ABC transporter related  32.24 
 
 		 300 aa  166  4e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.425869  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1207  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.05 
 
 		 279 aa  166  4e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1117  ABC transporter related  38.67 
 
 		 326 aa  166  4e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.222979  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0989  ABC transporter related  37.22 
 
 		 331 aa  166  4e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00029019  normal  0.847424 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2557  ABC transporter related  37.95 
 
 		 259 aa  166  5e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000637535  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1913  ABC multidrug efflux pump, ATPase subunit  34.24 
 
 		 314 aa  166  5e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.173813  normal  0.389183 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1284  ABC transporter related  36.77 
 
 		 334 aa  166  5e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.485103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3146  ABC transporter related  36.2 
 
 		 319 aa  166  5.9999999999999996e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0254  ABC transporter related  35.62 
 
 		 246 aa  166  5.9999999999999996e-40  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0374649  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1477  ABC transporter related  38.86 
 
 		 262 aa  166  5.9999999999999996e-40  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.226927  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2937  ABC transporter related  37.97 
 
 		 279 aa  165  1.0000000000000001e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04710  ATP-binding ABC transporter family nodulation protein NodI  36.89 
 
 		 328 aa  164  1.0000000000000001e-39  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.427122  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2918  ABC transporter related  35.04 
 
 		 247 aa  164  1.0000000000000001e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.79893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0215  ABC transporter-related protein  36.07 
 
 		 310 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.314538  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2419  ABC transporter related  37.39 
 
 		 328 aa  164  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513097 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1372  ABC transporter, ATP-binding protein  41.15 
 
 		 246 aa  164  2.0000000000000002e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00133001  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0869  ABC transporter related  43.19 
 
 		 305 aa  164  2.0000000000000002e-39  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.348691 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0003  ABC transporter related  34.29 
 
 		 311 aa  164  2.0000000000000002e-39  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.445352  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4638  ABC transporter, ATP-binding protein  33.33 
 
 		 294 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.672601  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0222  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  31.44 
 
 		 330 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.834743  normal  0.816705 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1781  ABC transporter related  36.53 
 
 		 306 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00159996  normal  0.877081 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1123  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.18 
 
 		 331 aa  164  2.0000000000000002e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.716234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3248  ABC transporter related  38.26 
 
 		 235 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.013922 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2220  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  32.11 
 
 		 321 aa  162  4.0000000000000004e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00218593  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06461  putative multidrug efflux ABC transporter  38.84 
 
 		 337 aa  163  4.0000000000000004e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.645354 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>