More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_7954 on replicon NC_011887
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011887  Mnod_7954  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  100 
 
 		 288 aa  566  1e-160  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5405  putative carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  58.03 
 
 		 293 aa  309  2.9999999999999997e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00321329  normal  0.260192 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1203  2,3-dimethylmalate lyase  58.03 
 
 		 293 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00337991  normal  0.996052 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2082  2,3-dimethylmalate lyase  56.29 
 
 		 286 aa  301  7.000000000000001e-81  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.218009  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1632  2,3-dimethylmalate lyase  55.94 
 
 		 286 aa  300  2e-80  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.171622 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3579  PEP phosphonomutase  54.74 
 
 		 286 aa  297  1e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00948814  hitchhiker  0.00984431 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2513  2,3-dimethylmalate lyase  55.83 
 
 		 293 aa  296  3e-79  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4474  2,3-dimethylmalate lyase  53.19 
 
 		 294 aa  296  4e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.787404  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4291  2,3-dimethylmalate lyase  55.47 
 
 		 295 aa  294  1e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.268229 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1614  2,3-dimethylmalate lyase  55.96 
 
 		 295 aa  292  5e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.863287  normal  0.36405 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2154  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  45.96 
 
 		 289 aa  272  6e-72  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.908949 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5990  2,3-dimethylmalate lyase  48.25 
 
 		 292 aa  250  2e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0792782 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1933  isocitrate lyase family protein  48 
 
 		 299 aa  246  3e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4841  2,3-dimethylmalate lyase  47.87 
 
 		 284 aa  241  1e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0204  2,3-dimethylmalate lyase  47.39 
 
 		 325 aa  240  2e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5166  putative carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  45.83 
 
 		 292 aa  236  3e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.919323  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0256  putative methylisocitrate lyase  40.93 
 
 		 288 aa  234  2.0000000000000002e-60  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.764901 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0806  isocitrate lyase family protein  46.72 
 
 		 287 aa  233  3e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0864  2,3-dimethylmalate lyase  44.41 
 
 		 289 aa  233  4.0000000000000004e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000979692  hitchhiker  0.000000949403 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4757  2,3-dimethylmalate lyase  42.71 
 
 		 287 aa  232  6e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000491467  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0783  methylisocitrate lyase  46.77 
 
 		 312 aa  231  7.000000000000001e-60  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.649003 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0624  2,3-dimethylmalate lyase  45.16 
 
 		 306 aa  231  1e-59  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4025  isocitrate lyase family protein  38.95 
 
 		 284 aa  231  2e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4144  isocitrate lyase family protein  38.6 
 
 		 284 aa  229  4e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3949  isocitrate lyase family protein  38.6 
 
 		 284 aa  229  4e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0689  methylisocitrate lyase  47.24 
 
 		 292 aa  228  1e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.106645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4051  isocitrate lyase family protein  38.6 
 
 		 287 aa  228  1e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3767  2,3-dimethylmalate lyase  44.73 
 
 		 289 aa  227  2e-58  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1054  isocitrate lyase family protein  44.68 
 
 		 282 aa  226  5.0000000000000005e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.138813  normal  0.876203 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4268  2,3-dimethylmalate lyase  42.31 
 
 		 291 aa  225  6e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.485286  normal  0.877406 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1916  isocitrate lyase family protein  44.01 
 
 		 287 aa  224  1e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0326533 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1072  2-methylisocitrate lyase  45.85 
 
 		 301 aa  224  2e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.765825  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0781  methylisocitrate lyase  43.21 
 
 		 311 aa  223  3e-57  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0279  2,3-dimethylmalate lyase  43.49 
 
 		 274 aa  223  4e-57  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.577564  normal  0.130845 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0396  methylisocitrate lyase  44.19 
 
 		 285 aa  222  6e-57  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0696555  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2479  methylisocitrate lyase  49.21 
 
 		 304 aa  220  1.9999999999999999e-56  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0974909  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1702  methylisocitrate lyase  43.96 
 
 		 304 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0394396 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0101  methylisocitrate lyase  48.62 
 
 		 308 aa  219  5e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.248963  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1857  2-methylisocitrate lyase  43.4 
 
 		 292 aa  218  1e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03370  2-methylisocitrate lyase  41.94 
 
 		 291 aa  217  2e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0925  2-methylisocitrate lyase  43.7 
 
 		 292 aa  216  5e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1820  2-methylisocitrate lyase  43.4 
 
 		 292 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12030  methylisocitrate lyase  46.18 
 
 		 312 aa  211  9e-54  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.55917  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3825  2-methylisocitrate lyase  43.24 
 
 		 292 aa  211  9e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0315  2-methylisocitrate lyase  43.24 
 
 		 292 aa  211  9e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3644  2-methylisocitrate lyase  43.24 
 
 		 292 aa  211  1e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1869  2-methylisocitrate lyase  40.86 
 
 		 292 aa  211  1e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.127999 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4140  2-methylisocitrate lyase  43.24 
 
 		 292 aa  211  1e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0108  methylisocitrate lyase  45.42 
 
 		 302 aa  211  1e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0279515  normal  0.0353052 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0345  2-methylisocitrate lyase  42.86 
 
 		 292 aa  210  2e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0509  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  43.06 
 
 		 289 aa  210  2e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4021  2-methylisocitrate lyase  42.86 
 
 		 292 aa  210  3e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2822  2-methylisocitrate lyase  42.64 
 
 		 296 aa  209  3e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3945  2-methylisocitrate lyase  42.86 
 
 		 292 aa  210  3e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4047  2-methylisocitrate lyase  42.86 
 
 		 292 aa  210  3e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1419  2-methylisocitrate lyase  42.26 
 
 		 292 aa  210  3e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3294  2-methylisocitrate lyase  41.75 
 
 		 294 aa  209  4e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.203078 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2322  2-methylisocitrate lyase  42.64 
 
 		 292 aa  209  4e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.458801  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1130  2,3-dimethylmalate lyase  40.71 
 
 		 287 aa  209  5e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2111  2-methylisocitrate lyase  42.64 
 
 		 292 aa  209  5e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.12913  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3629  2-methylisocitrate lyase  42.86 
 
 		 292 aa  209  5e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2499  2-methylisocitrate lyase  41.51 
 
 		 292 aa  207  2e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.741837  normal  0.047618 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2000  2-methylisocitrate lyase  41.82 
 
 		 303 aa  205  8e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.440629  normal  0.42713 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2334  2-methylisocitrate lyase  42.76 
 
 		 296 aa  204  1e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.474392  hitchhiker  0.0000364152 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14150  methylisocitrate lyase  43.51 
 
 		 312 aa  204  1e-51  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4356  2-methylisocitrate lyase  46.25 
 
 		 303 aa  204  1e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1831  2-methylisocitrate lyase  40.73 
 
 		 298 aa  204  1e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.464615 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2287  methylisocitrate lyase  45.19 
 
 		 297 aa  203  2e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.298126  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0071  2-methylisocitrate lyase  44.79 
 
 		 296 aa  204  2e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0052  2-methylisocitrate lyase  41.29 
 
 		 297 aa  203  3e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3436  2-methylisocitrate lyase  42.4 
 
 		 296 aa  203  3e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00574123  normal  0.104863 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0461  2,3-dimethylmalate lyase  41.07 
 
 		 301 aa  203  3e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1664  2-methylisocitrate lyase  42.26 
 
 		 292 aa  203  3e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1764  2-methylisocitrate lyase  44.66 
 
 		 296 aa  202  5e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.662627  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1657  2,3-dimethylmalate lyase  45.24 
 
 		 306 aa  202  7e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.106264  normal  0.68628 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2085  2-methylisocitrate lyase  44.81 
 
 		 297 aa  202  7e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.36601  hitchhiker  0.00432704 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1935  2-methylisocitrate lyase  41.87 
 
 		 294 aa  201  8e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.146073  hitchhiker  0.00000021306 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0054  2-methylisocitrate lyase  41.29 
 
 		 297 aa  201  9e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2155  2-methylisocitrate lyase  40.36 
 
 		 298 aa  201  9e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0722195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2080  2-methylisocitrate lyase  44.14 
 
 		 295 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.734153  normal  0.114818 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2400  2-methylisocitrate lyase  43.35 
 
 		 311 aa  201  9.999999999999999e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.951557  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4755  2-methylisocitrate lyase  41.39 
 
 		 297 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.730915  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0141  2-methylisocitrate lyase  41.39 
 
 		 297 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.758126  normal  0.590891 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5517  2-methylisocitrate lyase  41.39 
 
 		 297 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.36505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5344  2-methylisocitrate lyase  41.39 
 
 		 297 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0562563  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3975  2-methylisocitrate lyase  40.93 
 
 		 298 aa  199  3e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.583072 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3861  2-methylisocitrate lyase  40.93 
 
 		 298 aa  199  3e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.376669 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1775  2-methylisocitrate lyase  42.4 
 
 		 296 aa  200  3e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.367112  hitchhiker  0.000175442 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2934  putative methylisocitrate lyase  37.54 
 
 		 288 aa  199  3.9999999999999996e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23210  2-methylisocitrate lyase  41.96 
 
 		 295 aa  199  5e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3030  2-methylisocitrate lyase  44.11 
 
 		 297 aa  199  6e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.424816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1092  carboxyvinyl-carboxyphosphonatephosphorylmutase  38.97 
 
 		 293 aa  199  6e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.301564  normal  0.346372 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1666  2-methylisocitrate lyase  41.7 
 
 		 295 aa  199  6e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3287  2-methylisocitrate lyase  40.29 
 
 		 297 aa  198  9e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.179718  normal  0.0341449 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0356  2-methylisocitrate lyase  38.27 
 
 		 296 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02397  2-methylisocitrate lyase  39.27 
 
 		 298 aa  197  2.0000000000000003e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1311  2-methylisocitrate lyase  41.5 
 
 		 296 aa  197  2.0000000000000003e-49  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0110415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3496  methylisocitrate lyase  45.93 
 
 		 314 aa  196  3e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.146967  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1509  2-methylisocitrate lyase  41.98 
 
 		 299 aa  196  3e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.265222  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1808  2-methylisocitrate lyase  41.61 
 
 		 302 aa  196  3e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.988873  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>