More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_4336 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_2003  choline/carnitine/betaine transport family protein  63.97 
 
 
535 aa  682  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0049  choline/carnitine/betaine transporter  62.82 
 
 
523 aa  638  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.335489  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2045  choline/carnitine/betaine transporter  62.67 
 
 
554 aa  652  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0189191  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0023  choline/carnitine/betaine transporter  59.66 
 
 
539 aa  635  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.16107 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4336  choline/carnitine/betaine transporter  100 
 
 
529 aa  1047  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0898  BCCT family transporter  60.86 
 
 
540 aa  634  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1809  choline/carnitine/betaine transporter  60.42 
 
 
526 aa  630  1e-179  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01883  choline/carnitine/betaine transporter  62.18 
 
 
529 aa  626  1e-178  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0098  transporter, BCCT family  60.82 
 
 
526 aa  627  1e-178  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003545  choline-glycine betaine transporter  59.32 
 
 
526 aa  624  1e-177  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0969  choline/carnitine/betaine transporter  61.6 
 
 
525 aa  617  1e-175  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.375142  normal  0.0777887 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2648  choline/carnitine/betaine transporter  56.56 
 
 
534 aa  613  1e-174  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06429  hypothetical protein  57.77 
 
 
535 aa  611  1e-173  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0237  choline/carnitine/betaine transporter  57.3 
 
 
550 aa  610  1e-173  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000527978  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2323  glycine betaine transporter  60.43 
 
 
525 aa  600  1e-170  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.100678  hitchhiker  0.00817837 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0433  transporter, BCCT family  58.67 
 
 
531 aa  585  1e-166  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003138  High-affinity choline uptake protein BetT  64.67 
 
 
450 aa  581  1e-164  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  4.29409e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02455  choline/carnitine/betaine transporter  49.91 
 
 
582 aa  540  1e-152  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3080  BCCT family choline/carnitine/betaine transporter  52.6 
 
 
551 aa  535  1e-151  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0835  choline/carnitine/betaine transporter  52.33 
 
 
574 aa  535  1e-151  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.475223  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3807  choline/carnitine/betaine transporter  52.6 
 
 
551 aa  535  1e-151  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00825508  normal  0.301611 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2125  choline/carnitine/betaine transport  51.95 
 
 
549 aa  532  1e-150  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3038  choline/carnitine/betaine transporter  52.88 
 
 
554 aa  530  1e-149  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1282  transporter, BCCT family  51.45 
 
 
534 aa  525  1e-148  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003606  High-affinity choline uptake protein BetT  50.28 
 
 
553 aa  525  1e-148  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2505  choline/carnitine/betaine transporter  51.49 
 
 
541 aa  519  1e-146  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4552  choline/carnitine/betaine transporter  52.35 
 
 
555 aa  520  1e-146  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0980  choline/carnitine/betaine transport  52.82 
 
 
548 aa  508  1e-143  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3929  hypothetical protein  51.68 
 
 
551 aa  511  1e-143  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.720842  normal  0.613133 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3129  choline/carnitine/betaine transporter  52.9 
 
 
554 aa  502  1e-141  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.32452  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1888  choline/carnitine/betaine transporter  49.72 
 
 
606 aa  498  1e-140  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.541906  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4548  choline/carnitine/betaine transporter  51.31 
 
 
551 aa  493  1e-138  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0066  choline/carnitine/betaine transporter  45.9 
 
 
583 aa  454  1e-126  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.432279  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3305  choline/carnitine/betaine transport  45.32 
 
 
545 aa  439  1e-122  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4819  choline/carnitine/betaine transporter  46.12 
 
 
538 aa  434  1e-120  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0648582  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2472  choline/carnitine/betaine transporter  46.15 
 
 
667 aa  432  1e-120  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4866  choline/carnitine/betaine transporter  46.28 
 
 
659 aa  422  1e-117  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0140106 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4403  choline/carnitine/betaine transporter  46.08 
 
 
659 aa  420  1e-116  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1003  choline/carnitine/betaine transporter  42.91 
 
 
553 aa  412  1e-114  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.399191 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1505  choline/carnitine/betaine transporter  45.86 
 
 
668 aa  407  1e-112  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0845  choline/carnitine/betaine transport  41.65 
 
 
551 aa  402  1e-111  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.626779  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1362  choline/carnitine/betaine transport  46.09 
 
 
673 aa  403  1e-111  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000623924  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3164  choline/carnitine/betaine transporter  45.45 
 
 
660 aa  404  1e-111  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3957  choline/carnitine/betaine transporter family protein  42.97 
 
 
657 aa  402  1e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0148602  normal  0.612846 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69850  putative choline transporter  43.43 
 
 
661 aa  404  1e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.545233 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6064  putative choline transporter  44.42 
 
 
661 aa  399  1e-110  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0600  choline/carnitine/betaine transporter  43.31 
 
 
584 aa  399  1e-110  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  8.57259e-11  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1384  choline/carnitine/betaine transporter  44.55 
 
 
524 aa  396  1e-109  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.095402  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1909  choline/carnitine/betaine transport  43.75 
 
 
660 aa  395  1e-109  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.30039  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4027  BCCT family transporter  41.89 
 
 
530 aa  397  1e-109  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1542  choline/carnitine/betaine transporter  45.16 
 
 
658 aa  398  1e-109  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.869304  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2804  choline/carnitine/betaine transporter  45.16 
 
 
658 aa  398  1e-109  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1576  choline/carnitine/betaine transporter  45.16 
 
 
658 aa  397  1e-109  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.823699 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2552  choline/carnitine/betaine transporter  45.56 
 
 
658 aa  397  1e-109  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000125111  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1301  BCCT family betaine/choline/carnitine/glycine transporter  43.39 
 
 
682 aa  397  1e-109  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2619  choline/carnitine/betaine transporter  45.16 
 
 
658 aa  392  1e-108  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  9.08403e-05  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2719  choline/carnitine/betaine transporter  45.16 
 
 
658 aa  393  1e-108  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3532  choline/carnitine/betaine transporter  41.11 
 
 
556 aa  394  1e-108  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.825969 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1546  choline/carnitine/betaine transporter  44.96 
 
 
658 aa  393  1e-108  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2741  choline/carnitine/betaine transporter  44.74 
 
 
661 aa  395  1e-108  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1441  choline/carnitine/betaine transporter  44.76 
 
 
658 aa  395  1e-108  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0826  BCCT family choline/carnitine/betaine transporter  43.9 
 
 
550 aa  392  1e-108  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0130314 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1055  choline/carnitine/betaine transporter  46.19 
 
 
520 aa  389  1e-107  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.144567  normal  0.0392371 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0174  choline/carnitine/betaine transporter  42.83 
 
 
541 aa  390  1e-107  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.525828  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3360  choline/carnitine/betaine transporter  42.31 
 
 
676 aa  385  1e-106  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0225578  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04148  secondary glycine betaine transporter BetU  44.33 
 
 
667 aa  386  1e-106  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2364  choline/carnitine/betaine transporter  42.75 
 
 
685 aa  387  1e-106  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04111  hypothetical protein  44.33 
 
 
667 aa  386  1e-106  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1610  hypothetical protein  41.57 
 
 
646 aa  389  1e-106  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.00096761  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01813  Choline-glycine betaine transporter  42.74 
 
 
656 aa  388  1e-106  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000594064  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1175  choline/carnitine/betaine transport  43.44 
 
 
658 aa  388  1e-106  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0833615  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0764  transporter, BCCT family  44.14 
 
 
667 aa  385  1e-106  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.846408  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4850  BCCT family transporter  43.94 
 
 
667 aa  384  1e-105  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1805  choline/carnitine/betaine transporter  42.97 
 
 
664 aa  385  1e-105  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.376035  hitchhiker  0.00814736 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1109  choline/carnitine/betaine transporter  42.57 
 
 
676 aa  382  1e-105  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.507446  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01010  choline/carnitine/betaine transport  42.72 
 
 
573 aa  384  1e-105  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.883034  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0293  choline/carnitine/betaine transporter  42.51 
 
 
637 aa  385  1e-105  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0308209  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1874  BCCT transporter  42.51 
 
 
676 aa  384  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0838618  normal  0.235512 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4045  choline/carnitine/betaine transporter  42.31 
 
 
673 aa  385  1e-105  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.158094  normal  0.57128 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5310  choline/carnitine/betaine transporter  41.89 
 
 
698 aa  383  1e-105  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.910175  normal  0.618905 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1736  choline/carnitine/betaine transporter  42.36 
 
 
506 aa  379  1e-104  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00814809  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1077  choline/carnitine/betaine transport  44.18 
 
 
682 aa  379  1e-104  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.892042  normal  0.109945 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0154  choline/carnitine/betaine transporter  42.23 
 
 
682 aa  381  1e-104  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4430  choline/carnitine/betaine transporter  41.82 
 
 
691 aa  379  1e-104  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0877  choline/carnitine/betaine transporter  42.43 
 
 
542 aa  380  1e-104  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.359976  hitchhiker  1.08541e-06 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1364  BCCT family transporter  42.03 
 
 
676 aa  375  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0407  BCCT family transporter  42.03 
 
 
716 aa  375  1e-103  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1859  BCCT family transporter  42.03 
 
 
676 aa  375  1e-103  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13950  choline/carnitine/betaine transport  39.14 
 
 
568 aa  377  1e-103  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.626795  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0234  BCCT family transporter  42.03 
 
 
716 aa  375  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0971  choline/carnitine/betaine transporter  42.03 
 
 
676 aa  375  1e-103  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.745252  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0421  choline/carnitine/betaine transporter  43.5 
 
 
661 aa  378  1e-103  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.45567  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4156  choline/carnitine/betaine transporter  42.11 
 
 
676 aa  375  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.87836  normal  0.0109397 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4042  choline/carnitine/betaine transporter  39.88 
 
 
526 aa  374  1e-102  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4210  choline/carnitine/betaine transport  42.11 
 
 
676 aa  375  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.157306  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0328  choline/carnitine/betaine transporter  42.03 
 
 
676 aa  375  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.140196  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1774  BCCT family transporter  42.03 
 
 
676 aa  375  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0841224  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3576  choline/carnitine/betaine transporter  40.26 
 
 
567 aa  372  1e-101  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.440158  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2376  choline/carnitine/betaine transporter  41.62 
 
 
508 aa  370  1e-101  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0157817  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5374  choline/carnitine/betaine transporter family protein  40.42 
 
 
567 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.985383  normal  0.22306 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>