More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_2845 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_2845  rare lipoprotein A  100 
 
 
311 aa  641    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000926657  hitchhiker  0.0000043303 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2411  rare lipoprotein A  50.57 
 
 
295 aa  248  6e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.670481  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1548  rare lipoprotein A  47.76 
 
 
290 aa  235  7e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3152  rare lipoprotein A  46.04 
 
 
260 aa  225  8e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000593074  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3488  rare lipoprotein A  45.28 
 
 
265 aa  219  7e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000216134 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3711  rare lipoprotein A  44.53 
 
 
264 aa  218  1e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000309694  hitchhiker  0.000358046 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2938  rare lipoprotein A  44.53 
 
 
265 aa  216  5e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000804744  normal  0.0225241 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3338  sugar fermentation stimulation protein  42.75 
 
 
297 aa  215  9.999999999999999e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000024991  normal  0.0181355 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1713  putative rare lipoprotein A  45.02 
 
 
293 aa  203  3e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4822  lipoprotein, rlpA family  36.95 
 
 
342 aa  202  6e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0175  rare lipoprotein A  41.2 
 
 
324 aa  201  9e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.365013  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0983  rare lipoprotein A  42.32 
 
 
269 aa  201  1.9999999999999998e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.327643  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4362  rare lipoprotein A  36.95 
 
 
342 aa  200  3e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0440112  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3278  rare lipoprotein A  36.91 
 
 
277 aa  200  3e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000396769  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3456  rare lipoprotein A  36.91 
 
 
277 aa  199  5e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000968437  normal  0.0261535 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0988  rare lipoprotein A  40.23 
 
 
280 aa  199  5e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000365675  normal  0.010381 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1053  rare lipoprotein A  40.23 
 
 
280 aa  199  6e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000568388  hitchhiker  0.00641376 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12090  RlpA family lipoprotein  37.28 
 
 
341 aa  198  9e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.751179  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1089  rare lipoprotein A  36.58 
 
 
277 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000493551  hitchhiker  0.00000747193 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2872  rare lipoprotein A  50.27 
 
 
281 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000232155  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3320  rare lipoprotein A  36.58 
 
 
277 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000103615  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0992  rare lipoprotein A  39.85 
 
 
280 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000257721  normal  0.149582 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0617  rare lipoprotein A  37.69 
 
 
332 aa  196  3e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0426495  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4967  rare lipoprotein A  39.12 
 
 
335 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1109  putative lipoprotein  36.87 
 
 
342 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4679  rare lipoprotein A  40.14 
 
 
333 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.362563  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004224  rare lipoprotein A precursor  41.4 
 
 
267 aa  195  8.000000000000001e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000335471  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2708  rare lipoprotein A  43.8 
 
 
285 aa  194  1e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2591  rare lipoprotein A  40.07 
 
 
278 aa  194  1e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00126384  normal  0.496007 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01654  rare lipoprotein A  40.07 
 
 
322 aa  194  1e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000527551  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08420  Rare lipoprotein, RlpA family  41.2 
 
 
325 aa  194  2e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.108645  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01215  hypothetical protein  39.73 
 
 
267 aa  194  2e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3795  rare lipoprotein A  40.13 
 
 
337 aa  194  2e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.443521  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1971  rare lipoprotein A  40.39 
 
 
323 aa  194  2e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1165  rare lipoprotein A  39.46 
 
 
283 aa  193  3e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4804  rare lipoprotein A family  40.57 
 
 
333 aa  192  4e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.641404 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4857  rare lipoprotein A  38.08 
 
 
333 aa  192  5e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.292191  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2633  rare lipoprotein A  39.7 
 
 
257 aa  189  5e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0471  putative rare lipoprotein A  43.67 
 
 
263 aa  187  2e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000420345  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0852  rare lipoprotein A  45.15 
 
 
297 aa  186  3e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000569682  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0696  rare lipoprotein A  51.06 
 
 
270 aa  181  1e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1518  hypothetical protein  42.31 
 
 
273 aa  179  4.999999999999999e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0111  rare lipoprotein A  38.27 
 
 
333 aa  178  1e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1557  rare lipoprotein A  39.79 
 
 
321 aa  177  2e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000368198  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1465  hypothetical protein  46.36 
 
 
273 aa  177  3e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1386  rare lipoprotein A  55.17 
 
 
415 aa  175  9e-43  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.166682  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1316  rare lipoprotein A  55.17 
 
 
417 aa  175  9.999999999999999e-43  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.250086  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04283  rare lipoprotein A  46.79 
 
 
471 aa  174  1.9999999999999998e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1133  rare lipoprotein A  47.85 
 
 
260 aa  170  2e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0478677  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1011  rare lipoprotein A  36.73 
 
 
352 aa  169  4e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2496  rare lipoprotein A  34.77 
 
 
310 aa  168  1e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1060  rare lipoprotein A  36.5 
 
 
265 aa  167  2e-40  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0952  rare lipoprotein A family protein  36.5 
 
 
261 aa  167  2e-40  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3447  rare lipoprotein A  54.11 
 
 
423 aa  166  5e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.340294 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3300  rare lipoprotein A  40.43 
 
 
259 aa  162  8.000000000000001e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.650023 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0265  rare lipoprotein A  39.3 
 
 
286 aa  161  1e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0973741  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2537  rare lipoprotein A  40.17 
 
 
243 aa  159  5e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.875468  normal  0.18015 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1470  rare lipoprotein A  39.83 
 
 
282 aa  159  5e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00612022  normal  0.287685 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0315  rare lipoprotein A  35.15 
 
 
394 aa  155  1e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3390  rare lipoprotein A  54.26 
 
 
474 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.728179 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3699  rare lipoprotein A  54.26 
 
 
455 aa  153  4e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1268  rare lipoprotein A  40.41 
 
 
284 aa  152  5e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.149494  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3581  rare lipoprotein A  54.26 
 
 
468 aa  151  2e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0743436  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4323  rare lipoprotein A  54.07 
 
 
314 aa  149  6e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1456  rare lipoprotein A  40.89 
 
 
322 aa  148  1.0000000000000001e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.12367  normal  0.0142155 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0519  rare lipoprotein A  37.45 
 
 
246 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.986094  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1988  drug/metabolite exporter (DME) family protein  40.17 
 
 
286 aa  147  2.0000000000000003e-34  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0241  rare lipoprotein A  46.95 
 
 
381 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.812141  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0458  30S ribosomal protein S16 (BS17)  39.74 
 
 
270 aa  145  6e-34  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2968  rare lipoprotein A  42.49 
 
 
258 aa  146  6e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.616079  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1224  lipoproteins  38.27 
 
 
254 aa  144  2e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6276  rare lipoprotein A  39.49 
 
 
394 aa  144  2e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.314639 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2676  rare lipoprotein A  52.55 
 
 
314 aa  143  3e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.36166  normal  0.127788 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3528  putative lipoprotein  33.7 
 
 
331 aa  143  3e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.257959 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2712  rare lipoprotein A  52.55 
 
 
314 aa  143  4e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.824805 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1506  rare lipoprotein A  41.08 
 
 
442 aa  142  6e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0428333  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0749  rare lipoprotein A  34.62 
 
 
275 aa  142  6e-33  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0714634  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1353  rare lipoprotein A  34.62 
 
 
275 aa  142  6e-33  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.582482  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1548  rare lipoprotein A  38.46 
 
 
259 aa  142  8e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.64973 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0674  rare lipoprotein A  34.41 
 
 
266 aa  142  8e-33  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.391975  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2012  rare lipoprotein A  53.28 
 
 
312 aa  142  9e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.127741  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6925  rare lipoprotein A  40.74 
 
 
398 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0552998  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0655  rare lipoprotein A  37.22 
 
 
279 aa  140  3e-32  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0270867  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2298  rare lipoprotein A  38.81 
 
 
238 aa  140  3.9999999999999997e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3111  rare lipoprotein A  50.36 
 
 
315 aa  138  1e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.829805  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5161  rare lipoprotein A  48.05 
 
 
391 aa  138  1e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0662  rare lipoprotein A  34.49 
 
 
264 aa  137  2e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1466  rare lipoprotein A  53.12 
 
 
279 aa  137  2e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.515787 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4106  hypothetical protein  51.09 
 
 
283 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.322542  normal  0.202617 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2700  rare lipoprotein A  34.25 
 
 
318 aa  135  6.0000000000000005e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1579  rare lipoprotein A  45.6 
 
 
408 aa  135  9e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00357969  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2701  rare lipoprotein A  50 
 
 
312 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2474  rare lipoprotein A  38.42 
 
 
195 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.379574  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0990  rare lipoprotein A family protein  51.56 
 
 
421 aa  133  3.9999999999999996e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1705  rare lipoprotein A  54.46 
 
 
367 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0958  rare lipoprotein A family protein  51.56 
 
 
419 aa  132  5e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.138105  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2153  rare lipoprotein A  53.12 
 
 
382 aa  132  1.0000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1244  rare lipoprotein A  45.8 
 
 
409 aa  130  2.0000000000000002e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.069168 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2235  rare lipoprotein A  51.24 
 
 
249 aa  130  3e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2075  rare lipoprotein A  51.56 
 
 
424 aa  129  4.0000000000000003e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>