More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_3063 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_3063  aminotransferase, class V  100 
 
 		 383 aa  770    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0588987  unclonable  0.000000817205 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1649  aminotransferase, class V  53.44 
 
 		 385 aa  393  1e-108  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.251188  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1493  aminotransferase, class V  47.87 
 
 		 379 aa  357  9.999999999999999e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0268467  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0050  cysteine desulfurase  46.3 
 
 		 407 aa  355  8.999999999999999e-97  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0809  aminotransferase, class V  48.95 
 
 		 382 aa  351  1e-95  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000196007  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0872  aminotransferase, class V  44.47 
 
 		 382 aa  340  2e-92  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0302  cysteine desulfurase NifS  43.31 
 
 		 392 aa  337  2.9999999999999997e-91  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0467605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0772  cysteine desulfurase  43.27 
 
 		 384 aa  336  2.9999999999999997e-91  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2659  cysteine desulfurase NifS  46.49 
 
 		 404 aa  336  3.9999999999999995e-91  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.614192 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1860  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  45.77 
 
 		 396 aa  335  7e-91  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000140569  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1164  cysteine desulfurase  43.65 
 
 		 384 aa  335  9e-91  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0720  aminotransferase, class V  43.12 
 
 		 394 aa  334  2e-90  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00090765  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3581  cysteine desulfurase NifS  43.95 
 
 		 400 aa  333  2e-90  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.345313  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2213  aminotransferase, class V  43.8 
 
 		 398 aa  332  9e-90  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.506383 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0108  aminotransferase class V  46.97 
 
 		 400 aa  332  1e-89  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.702313 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1833  aminotransferase, class V  44.3 
 
 		 389 aa  329  4e-89  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0175075  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1714  cysteine desulfurase NifS  42.06 
 
 		 394 aa  328  8e-89  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000384465  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1652  aminotransferase, class V  43.01 
 
 		 392 aa  327  2.0000000000000001e-88  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.143138  hitchhiker  0.00767612 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3079  cysteine desulfurase  43.57 
 
 		 396 aa  327  3e-88  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3884  aminotransferase class V  44.39 
 
 		 398 aa  326  4.0000000000000003e-88  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00981578  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0207  cysteine desulfurase NifS  43.27 
 
 		 388 aa  326  4.0000000000000003e-88  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000531678  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3914  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  43.42 
 
 		 400 aa  323  2e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2275  aminotransferase, class V  44.97 
 
 		 386 aa  323  3e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2570  cysteine desulfurase  47.2 
 
 		 394 aa  323  4e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2647  cysteine desulfurase NifS  44.83 
 
 		 389 aa  322  7e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00311085 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0266  hypothetical protein  42.33 
 
 		 393 aa  321  9.999999999999999e-87  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.423514  normal  0.267621 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1343  aminotransferase class V  41.16 
 
 		 389 aa  321  9.999999999999999e-87  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1569  cysteine desulfurase NifS  44.56 
 
 		 389 aa  320  1.9999999999999998e-86  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00349258  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0437  cysteine desulfurase NifS  41.53 
 
 		 386 aa  319  3.9999999999999996e-86  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.361233 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2125  aminotransferase, class V  42.06 
 
 		 398 aa  318  1e-85  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.573036  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1075  cysteine desulfurase NifS  43.04 
 
 		 384 aa  318  1e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2362  cysteine desulfurase NifS  44.97 
 
 		 399 aa  316  3e-85  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2498  aminotransferase class V  42.97 
 
 		 381 aa  316  4e-85  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0764  aminotransferase, class V  40.63 
 
 		 414 aa  316  5e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000561511  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1837  cysteine desulfurase NifS  43.39 
 
 		 396 aa  315  7e-85  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0935929 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2884  cysteine desulfurase  49.73 
 
 		 373 aa  315  8e-85  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1949  aminotransferase, class V  45.83 
 
 		 385 aa  315  9e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000781244  normal  0.177382 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0100  cysteine desulfurase NifS  44.09 
 
 		 400 aa  315  9.999999999999999e-85  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.873822 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1515  aminotransferase, class V:aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  43.12 
 
 		 404 aa  314  1.9999999999999998e-84  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.894831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2683  aminotransferase, class V  44.18 
 
 		 393 aa  313  1.9999999999999998e-84  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0397114 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2296  aminotransferase, class V  44.36 
 
 		 394 aa  313  2.9999999999999996e-84  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0992  cysteine desulfurase  42.48 
 
 		 391 aa  313  2.9999999999999996e-84  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00026474  normal  0.256714 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0484  aminotransferase, class V  42.97 
 
 		 417 aa  313  2.9999999999999996e-84  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0750137  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2011  cysteine desulfurase  42.74 
 
 		 391 aa  313  3.9999999999999997e-84  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.079673  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1939  aminotransferase class V  45 
 
 		 388 aa  313  4.999999999999999e-84  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00024706 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2274  cysteine desulfurase NifS  41.95 
 
 		 402 aa  312  6.999999999999999e-84  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.363972  hitchhiker  0.00000604426 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1356  cysteine desulfurase NifS  41.73 
 
 		 402 aa  311  7.999999999999999e-84  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2907  cysteine desulfurase NifS  40.48 
 
 		 398 aa  311  9e-84  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000201074  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0423  cysteine desulfurase NifS  41.05 
 
 		 403 aa  311  1e-83  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0763464  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0168  aminotransferase, class V  43.56 
 
 		 409 aa  311  2e-83  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.925051 
 
 
-
 
NC_002936  DET0248  cysteine desulfurase  45.6 
 
 		 383 aa  310  2.9999999999999997e-83  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0166722  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0872  cysteine desulfurase  46.68 
 
 		 380 aa  310  4e-83  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0149083 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0504  cysteine desulfurase NifS  43.8 
 
 		 402 aa  309  4e-83  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2424  cysteine desulphurase  40.9 
 
 		 404 aa  309  5e-83  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0940549 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1811  cysteine desulfurase NifS  43.92 
 
 		 401 aa  309  5e-83  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2122  cysteine desulfurase NifS  43.65 
 
 		 401 aa  309  5e-83  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.31758 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1783  cysteine desulfurase NifS  43.92 
 
 		 401 aa  309  5e-83  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4451  aminotransferase, class V  46.97 
 
 		 397 aa  309  5e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2630  aminotransferase class V  48.08 
 
 		 1143 aa  309  5e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1914  aminotransferase, class V  43.01 
 
 		 399 aa  309  5.9999999999999995e-83  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4245  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  43.77 
 
 		 398 aa  308  6.999999999999999e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0341  cysteine desulfurase  39.74 
 
 		 388 aa  308  6.999999999999999e-83  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_70  aminotransferase, class V  45.07 
 
 		 383 aa  308  1.0000000000000001e-82  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1563  cysteine desulfurase IscS  44.01 
 
 		 403 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.353864 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0719  cysteine desulfurase NifS  40.68 
 
 		 394 aa  307  2.0000000000000002e-82  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2015  aminotransferase, class V  42.18 
 
 		 391 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0118596  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1507  cysteine desulfurase  43.42 
 
 		 402 aa  304  2.0000000000000002e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2039  cysteine desulfurase  40.53 
 
 		 398 aa  303  5.000000000000001e-81  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1755  cysteine desulfurase  40.53 
 
 		 398 aa  303  5.000000000000001e-81  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00778501  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2431  aminotransferase, class V  43.46 
 
 		 390 aa  302  8.000000000000001e-81  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0688  cysteine desulfurase NifS  40.68 
 
 		 388 aa  302  8.000000000000001e-81  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0297222  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2232  aminotransferase class V  40.1 
 
 		 401 aa  302  8.000000000000001e-81  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4244  aminotransferase class V  42.67 
 
 		 381 aa  301  1e-80  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00204023  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1558  cysteine desulfurase NifS  42.89 
 
 		 400 aa  301  1e-80  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0572612  normal  0.890663 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4134  aminotransferase, class V  41.73 
 
 		 400 aa  301  1e-80  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0486971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2004  aminotransferase, class V  44.13 
 
 		 399 aa  301  1e-80  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0411095  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2115  aminotransferase class V  44.13 
 
 		 399 aa  301  1e-80  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.903448  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5089  cysteine desulfurase NifS  46.28 
 
 		 410 aa  301  1e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2363  aminotransferase, class V  40.16 
 
 		 398 aa  301  1e-80  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.197402  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2368  aminotransferase, class V  44.13 
 
 		 399 aa  301  2e-80  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0313381  normal  0.503368 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1085  aminotransferase, class V  46.13 
 
 		 407 aa  300  2e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1225  cysteine desulfurase NifS  43.24 
 
 		 397 aa  300  3e-80  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000944956 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3201  cysteine desulphurase  40.53 
 
 		 396 aa  300  3e-80  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.11568  normal  0.0184494 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2175  aminotransferase class V  41.28 
 
 		 398 aa  300  4e-80  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.670004  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0953  Cysteine desulfurase  42.18 
 
 		 380 aa  300  4e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1257  aminotransferase, class V  46.7 
 
 		 387 aa  299  5e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1932  cysteine desulfurase NifS  39.84 
 
 		 393 aa  298  7e-80  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000108248  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2295  aminotransferase class V  43.64 
 
 		 394 aa  298  8e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0121543 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1581  aminotransferase, class V  48.22 
 
 		 1135 aa  298  9e-80  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.863454  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3620  cysteine desulfurase NifS  43.31 
 
 		 400 aa  298  1e-79  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.190149 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0229  Cysteine desulfurase  43.23 
 
 		 405 aa  298  1e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4480  aminotransferase, class V  42.13 
 
 		 381 aa  297  2e-79  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.921351  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08880  aminotransferase class V  41.88 
 
 		 392 aa  297  2e-79  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.80371e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4262  aminotransferase class V  43.85 
 
 		 395 aa  297  2e-79  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.907816 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1001  aminotransferase, class V  41.27 
 
 		 508 aa  296  3e-79  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2871  Cysteine desulfurase  41.19 
 
 		 509 aa  296  4e-79  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1872  aminotransferase, class V  42.75 
 
 		 400 aa  296  5e-79  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.175027  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01630  Nitrogen fixation cysteine desulfurase, nifS  40.9 
 
 		 402 aa  296  6e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0981  aminotransferase, class V  45.48 
 
 		 407 aa  295  6e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.318228 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4530  aminotransferase, class V  41.87 
 
 		 381 aa  295  7e-79  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000702151  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>