More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_1898 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_1898  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 245 aa  502  1e-141  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00458999  normal  0.479409 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1540  two component transcriptional regulator  31.25 
 
 		 260 aa  132  6.999999999999999e-30  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1025  two component transcriptional regulator  31.67 
 
 		 239 aa  125  6e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.417875  normal  0.0147454 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00933  two-component response regulator  31.49 
 
 		 238 aa  124  1e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1511  two component transcriptional regulator  31.95 
 
 		 250 aa  122  4e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.030435  normal  0.317044 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004461  aerobic respiration control protein ArcA  30.64 
 
 		 238 aa  122  7e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000105121  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3772  two component transcriptional regulator  31.33 
 
 		 232 aa  121  8e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3045  two component transcriptional regulator  31.33 
 
 		 232 aa  121  8e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2558  two-component response regulator  30.64 
 
 		 239 aa  121  9.999999999999999e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4089  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.8 
 
 		 240 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.404092  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1631  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.48 
 
 		 275 aa  119  3.9999999999999996e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3646  two component transcriptional regulator  30.45 
 
 		 243 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0562  two-component response regulator  29.36 
 
 		 238 aa  116  3e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1099  two component transcriptional regulator  28.75 
 
 		 241 aa  116  3.9999999999999997e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000014675  normal  0.683329 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0815  two-component response regulator  29.79 
 
 		 239 aa  115  3.9999999999999997e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000717024  decreased coverage  0.00000744043 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3762  two-component response regulator  29.79 
 
 		 239 aa  115  5e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0487627  decreased coverage  0.0000265862 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3478  two-component response regulator  29.36 
 
 		 238 aa  115  6e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0733  two-component response regulator  30.38 
 
 		 238 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.318798  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3606  two-component response regulator  31.09 
 
 		 238 aa  114  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.40472  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0811  two-component response regulator  31.09 
 
 		 238 aa  114  1.0000000000000001e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3865  two-component response regulator  28.94 
 
 		 238 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000288449  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3671  two-component response regulator  28.94 
 
 		 238 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4654  two component transcriptional regulator  29.83 
 
 		 249 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.651298 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2984  two-component response regulator  29.11 
 
 		 238 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3477  two component transcriptional regulator  29.36 
 
 		 261 aa  113  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0601  two-component response regulator  30.21 
 
 		 238 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000457476  normal  0.0622951 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0777  two-component response regulator  29.79 
 
 		 239 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000399592  decreased coverage  0.000157294 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1947  two-component response regulator  28.51 
 
 		 238 aa  113  3e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000743409  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2272  two component transcriptional regulator, winged helix family  28.51 
 
 		 240 aa  113  3e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.543841  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4949  two-component response regulator  28.94 
 
 		 238 aa  113  3e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04277  DNA-binding response regulator in two-component regulatory system with ArcB or CpxA  28.94 
 
 		 238 aa  112  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.896117  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3596  two component transcriptional regulator, winged helix family  28.94 
 
 		 238 aa  112  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.895542  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4922  two-component response regulator  28.94 
 
 		 238 aa  112  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000490343  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4637  two-component response regulator  28.94 
 
 		 238 aa  112  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0297029  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C5008  two-component response regulator  28.94 
 
 		 238 aa  112  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.80206 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4956  two-component response regulator  28.94 
 
 		 238 aa  112  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.211871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5000  two-component response regulator  28.94 
 
 		 238 aa  112  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4952  two-component response regulator  28.94 
 
 		 238 aa  112  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.198521  normal  0.89803 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5916  two-component response regulator  28.94 
 
 		 238 aa  112  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.284367  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3655  two-component response regulator  28.94 
 
 		 238 aa  112  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.115907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0681  two-component response regulator  30.67 
 
 		 238 aa  112  4.0000000000000004e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000276194  normal  0.238426 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A5012  two-component response regulator  28.94 
 
 		 238 aa  112  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0537303  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4849  two-component response regulator  28.94 
 
 		 238 aa  112  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0271183  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04242  hypothetical protein  28.94 
 
 		 238 aa  112  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.889846  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0786  two-component response regulator  29.36 
 
 		 238 aa  112  5e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00613295  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3842  two-component response regulator  29.36 
 
 		 238 aa  112  6e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000808868  hitchhiker  0.0000962447 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3719  two-component response regulator  29.36 
 
 		 238 aa  112  6e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000224737  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0570  two-component response regulator  30 
 
 		 238 aa  112  6e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.275144  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3660  two-component response regulator  29.36 
 
 		 238 aa  112  6e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0335884  decreased coverage  0.0000000000814721 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0531  two-component response regulator  30.25 
 
 		 238 aa  112  7.000000000000001e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3988  two-component response regulator  28.94 
 
 		 238 aa  112  7.000000000000001e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0678  two-component response regulator  28.94 
 
 		 238 aa  112  7.000000000000001e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000157437  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0651  two-component response regulator  28.94 
 
 		 238 aa  112  7.000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000404261  normal  0.0778781 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3371  two-component response regulator  28.94 
 
 		 238 aa  112  7.000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000464227  hitchhiker  0.00803379 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0650  two-component response regulator  28.94 
 
 		 238 aa  112  7.000000000000001e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000223196  hitchhiker  0.00939579 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2799  two component transcriptional regulator  32.76 
 
 		 232 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2703  two component transcriptional regulator  29.79 
 
 		 241 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.790666  normal  0.110517 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1138  two component transcriptional regulator  32.76 
 
 		 232 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.564511  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6216  two component transcriptional regulator  30.45 
 
 		 246 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2788  two component transcriptional regulator  33.19 
 
 		 232 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.471427  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0943  two component transcriptional regulator  28.1 
 
 		 257 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0399291  normal  0.264545 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2179  two component transcriptional regulator  30.38 
 
 		 262 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.134486  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5210  two component response regulator  31.65 
 
 		 241 aa  110  2.0000000000000002e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0533  two-component response regulator  28.51 
 
 		 238 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2033  two component transcriptional regulator  30.54 
 
 		 238 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.649752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6199  OmpR family two component response transcriptional regulator  30.17 
 
 		 255 aa  110  3e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.59766  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1282  two component transcriptional regulator  30.17 
 
 		 249 aa  110  3e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0224  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  31.49 
 
 		 243 aa  108  5e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3286  two component transcriptional regulator  29.06 
 
 		 239 aa  109  5e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0994211  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6165  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.09 
 
 		 245 aa  108  6e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.362427  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0082  two-component response regulator  29.05 
 
 		 235 aa  108  6e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3730  winged helix family two component transcriptional regulator  30.13 
 
 		 238 aa  108  8.000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1985  DNA-binding transcriptional regulator TorR  29.61 
 
 		 232 aa  108  8.000000000000001e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.156357  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2176  two component transcriptional regulator  30.13 
 
 		 238 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.120128  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1961  two component transcriptional regulator  29.34 
 
 		 240 aa  107  1e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.326957  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0772  DNA-binding response regulator  30.51 
 
 		 243 aa  107  2e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0655  two component transcriptional regulator  27.97 
 
 		 242 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.379452 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1245  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.61 
 
 		 256 aa  106  3e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0649443  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2092  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.89 
 
 		 263 aa  106  3e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.187111  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1082  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.09 
 
 		 239 aa  106  3e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00181983  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6320  two component transcriptional regulator  29.17 
 
 		 239 aa  106  3e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.506454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3818  two component transcriptional regulator  30.93 
 
 		 230 aa  106  4e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.386967  normal  0.165932 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1828  DNA-binding transcriptional regulator TorR  27.2 
 
 		 240 aa  106  4e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01583  DNA-binding transcriptional regulator TorR  29.18 
 
 		 237 aa  106  4e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5813  two component transcriptional regulator  30.38 
 
 		 253 aa  105  5e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00548874 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0713  two-component response regulator  29.88 
 
 		 238 aa  105  5e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1971  two component transcriptional regulator  29.24 
 
 		 232 aa  105  6e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.999465  normal  0.0504331 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3025  two component transcriptional regulator  30.13 
 
 		 270 aa  105  6e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2107  two-component response regulator  30.08 
 
 		 245 aa  105  6e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0079  transcriptional regulatory protein  30.08 
 
 		 245 aa  105  7e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.747625  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2142  two component transcriptional regulator  32.05 
 
 		 240 aa  105  7e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.46457  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3731  two component transcriptional regulator, winged helix family  29.36 
 
 		 246 aa  105  7e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1100  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.22 
 
 		 236 aa  105  8e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000182155 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1375  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  29.41 
 
 		 236 aa  105  9e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1201  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  32.2 
 
 		 243 aa  104  1e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.106709  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4076  two component transcriptional regulator, winged helix family  28.94 
 
 		 253 aa  104  1e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.31516 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2394  two component transcriptional regulator  29.61 
 
 		 255 aa  104  1e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0518821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2739  two component transcriptional regulator  28.09 
 
 		 241 aa  104  1e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.107521 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0516  response regulator receiver  30.2 
 
 		 247 aa  104  1e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.62167  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04421  two-component system regulatory protein  31.44 
 
 		 230 aa  104  1e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>