264 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_0327 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_0327  3'-5' exonuclease  100 
 
 		 213 aa  442  1e-123  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0109  3'-5' exonuclease  57.98 
 
 		 204 aa  226  2e-58  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.378562  normal  0.35649 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0196  3'-5' exonuclease  60.33 
 
 		 203 aa  224  7e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.950897 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0816  3'-5' exonuclease  57.61 
 
 		 216 aa  220  9.999999999999999e-57  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.00362431  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0419  3'-5' exonuclease  56.57 
 
 		 204 aa  220  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1011  3'-5' exonuclease family protein  53.69 
 
 		 204 aa  220  1.9999999999999999e-56  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0881939  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0179  3'-5' exonuclease  53.85 
 
 		 206 aa  218  6e-56  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.00803697  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1669  3'-5' exonuclease  53.49 
 
 		 218 aa  217  1e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.335885  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4954  3'-5' exonuclease  55.26 
 
 		 205 aa  213  9.999999999999999e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.332898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5922  3'-5' exonuclease  56.02 
 
 		 204 aa  213  9.999999999999999e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0155  3'-5' exonuclease  52.66 
 
 		 204 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.299764 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2425  3'-5' exonuclease  58.7 
 
 		 209 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0125  putative 3'-5' exonuclease family protein  55.56 
 
 		 204 aa  212  2.9999999999999995e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00602859  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2509  3'-5' exonuclease  54.5 
 
 		 209 aa  212  2.9999999999999995e-54  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0015  3'-5' exonuclease  57.92 
 
 		 206 aa  212  3.9999999999999995e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5275  3'-5' exonuclease  55.73 
 
 		 204 aa  211  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.28449  normal  0.0567423 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0047  3'-5' exonuclease  55.05 
 
 		 204 aa  211  9e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0659  3'-5' exonuclease  55.05 
 
 		 204 aa  210  1e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.265112 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3799  3'-5' exonuclease  51.74 
 
 		 209 aa  209  2e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.954695 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0228  3'-5' exonuclease  55.61 
 
 		 203 aa  209  3e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0174  3'-5' exonuclease  55.56 
 
 		 204 aa  209  3e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3464  3'-5' exonuclease  51.69 
 
 		 208 aa  208  5e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2720  3'-5' exonuclease  58.92 
 
 		 209 aa  207  9e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.149721  normal  0.0609935 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0171  3'-5' exonuclease  51.92 
 
 		 206 aa  206  2e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0678  3'-5' exonuclease  50 
 
 		 211 aa  206  2e-52  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0572  3'-5' exonuclease  52.63 
 
 		 204 aa  206  3e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5125  3'-5' exonuclease  58.38 
 
 		 207 aa  206  3e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0268839  normal  0.933758 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1914  3'-5' exonuclease  53.5 
 
 		 209 aa  205  5e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.194823 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1621  3'-5' exonuclease  52.5 
 
 		 207 aa  205  5e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.169628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0068  3'-5' exonuclease  51.81 
 
 		 206 aa  204  6e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2497  3'-5' exonuclease  53.52 
 
 		 209 aa  204  6e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.325432  normal  0.308179 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1152  ribonuclease D  51.44 
 
 		 204 aa  203  1e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3251  3'-5' exonuclease  57.3 
 
 		 205 aa  203  1e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0407  3'-5' exonuclease  52.13 
 
 		 214 aa  203  2e-51  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.23143  normal  0.475558 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4028  3'-5' exonuclease  50.72 
 
 		 208 aa  203  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0027  3'-5' exonuclease  53.72 
 
 		 204 aa  203  2e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.189554  normal  0.37885 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2813  3'-5' exonuclease  51.44 
 
 		 204 aa  203  2e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0878  3'-5' exonuclease  49.51 
 
 		 206 aa  202  3e-51  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2609  3'-5' exonuclease  54.26 
 
 		 204 aa  202  4e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0120  ribonuclease D  50.24 
 
 		 208 aa  201  5e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.818192  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2343  3'-5' exonuclease  55.91 
 
 		 205 aa  201  6e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.151538 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17051  putative ribonuclease D  48.34 
 
 		 214 aa  201  9e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1147  3'-5' exonuclease  51 
 
 		 210 aa  200  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.546163 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3984  3'-5' exonuclease  54.05 
 
 		 205 aa  200  9.999999999999999e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1118  3'-5' exonuclease  51 
 
 		 210 aa  200  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0529  3'-5' exonuclease family protein  52.11 
 
 		 206 aa  199  1.9999999999999998e-50  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3589  3'-5' exonuclease  53.48 
 
 		 203 aa  199  3.9999999999999996e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0333  3'-5' exonuclease  50.72 
 
 		 210 aa  198  6e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.273167  normal  0.287022 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2775  3'-5' exonuclease  51.2 
 
 		 204 aa  197  9e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4358  3'-5' exonuclease  49.76 
 
 		 208 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00583903 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0117  3'-5' exonuclease family protein  52.97 
 
 		 205 aa  196  2.0000000000000003e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0135  3'-5' exonuclease  52.97 
 
 		 205 aa  196  2.0000000000000003e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0120  3'-5' exonuclease family protein  52.97 
 
 		 205 aa  195  3e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.328382  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1922  3'-5' exonuclease  49.76 
 
 		 214 aa  192  3e-48  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0431536  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2246  3'-5' exonuclease  52 
 
 		 217 aa  192  3e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.520239  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17921  putative ribonuclease D  49 
 
 		 211 aa  191  6e-48  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2903  3'-5' exonuclease  52.43 
 
 		 205 aa  191  1e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.865613  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1676  putative ribonuclease D  49 
 
 		 211 aa  189  2e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.137272  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17761  putative ribonuclease D  48.97 
 
 		 211 aa  188  5e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22631  putative ribonuclease D  53.59 
 
 		 212 aa  185  5e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.528712 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17711  putative ribonuclease D  44.83 
 
 		 213 aa  180  2e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.606229  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1219  3'-5' exonuclease domain-containing protein  51.35 
 
 		 206 aa  176  2e-43  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000485799  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20321  putative ribonuclease D  47.37 
 
 		 214 aa  176  2e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1157  putative ribonuclease D  46.89 
 
 		 214 aa  176  3e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1164  3'-5' exonuclease  38.1 
 
 		 550 aa  82.4  0.000000000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0638405  normal  0.521406 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5400  Ribonuclease D  33.92 
 
 		 396 aa  81.3  0.000000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2378  ribonuclease D  30.85 
 
 		 388 aa  80.9  0.00000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0306951  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1310  ribonuclease D  34.34 
 
 		 393 aa  79  0.00000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0761558  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1102  ribonuclease D  31.15 
 
 		 381 aa  77  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.447104 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3389  3'-5' exonuclease  30.54 
 
 		 382 aa  76.6  0.0000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1588  ribonuclease D  31.89 
 
 		 384 aa  76.6  0.0000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3636  3'-5' exonuclease  29.82 
 
 		 381 aa  75.9  0.0000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.172491  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0237  3'-5' exonuclease  28.49 
 
 		 377 aa  75.1  0.0000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000118749  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0750  ribonuclease D  32.81 
 
 		 385 aa  74.7  0.0000000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0221  3'-5' exonuclease  28.49 
 
 		 377 aa  74.7  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2365  ribonuclease D  33.95 
 
 		 392 aa  74.3  0.000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0208  ribonuclease D  34.71 
 
 		 405 aa  74.3  0.000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.790947 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2073  ribonuclease D  33.33 
 
 		 386 aa  72.8  0.000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2334  ribonuclease D  32.79 
 
 		 384 aa  73.2  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.323596 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0744  ribonuclease D  32.77 
 
 		 385 aa  72.8  0.000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0414  3'-5' exonuclease  32.14 
 
 		 295 aa  72.4  0.000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0506  ribonuclease D  34.46 
 
 		 395 aa  71.6  0.000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.967739 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0042  ribonuclease D  29.48 
 
 		 395 aa  71.2  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00728921  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1388  ribonuclease D  31.03 
 
 		 377 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0799  ribonuclease D  30.85 
 
 		 383 aa  71.2  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.42118  normal  0.945444 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06230  ribonuclease D  29.59 
 
 		 399 aa  71.2  0.00000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.000000184069  hitchhiker  0.0058155 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1337  ribonuclease D  29.34 
 
 		 405 aa  70.9  0.00000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.118451  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3900  ribonuclease D  31.82 
 
 		 377 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.946881 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2542  ribonuclease D  31.64 
 
 		 385 aa  70.5  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4591  ribonuclease D  31.52 
 
 		 377 aa  69.7  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3455  ribonuclease D  32.04 
 
 		 392 aa  69.7  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0111852  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2494  ribonuclease D  32.24 
 
 		 382 aa  69.7  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.121397  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1461  ribonuclease D  32.5 
 
 		 375 aa  69.7  0.00000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1249  ribonuclease D  29.51 
 
 		 381 aa  69.3  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.606694  normal  0.0871939 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32970  ribonuclease D protein  30.68 
 
 		 375 aa  69.3  0.00000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.789666  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3191  3'-5' exonuclease  31.33 
 
 		 382 aa  69.3  0.00000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1297  ribonuclease D  31.52 
 
 		 377 aa  69.3  0.00000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2546  ribonuclease D  30.11 
 
 		 389 aa  69.3  0.00000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4287  3'-5' exonuclease  26.88 
 
 		 409 aa  68.9  0.00000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.276505  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2580  ribonuclease D  29.57 
 
 		 367 aa  68.9  0.00000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>