More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_1206 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009634  Mevan_1416  beta-lactamase domain-containing protein  73.9 
 
 
433 aa  684    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.449675  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1428  beta-lactamase domain-containing protein  93.3 
 
 
433 aa  841    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.1615  normal  0.318951 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1206  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 
433 aa  890    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0480  beta-lactamase domain-containing protein  94.69 
 
 
433 aa  853    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.104405  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0025  beta-lactamase domain-containing protein  55.05 
 
 
432 aa  496  1e-139  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0096  beta-lactamase-like  38.05 
 
 
411 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.619146  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1893  beta-lactamase domain protein  35.98 
 
 
411 aa  267  2e-70  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.411885  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1361  beta-lactamase domain protein  35.81 
 
 
422 aa  257  3e-67  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0378  beta-lactamase domain protein  32.95 
 
 
411 aa  253  4.0000000000000004e-66  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.834555  normal  0.393865 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0446  beta-lactamase domain-containing protein  36 
 
 
428 aa  248  1e-64  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.279355  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3402  beta-lactamase domain protein  32.57 
 
 
429 aa  245  9.999999999999999e-64  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1796  beta-lactamase domain protein  33.56 
 
 
414 aa  240  4e-62  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1313  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  33.26 
 
 
432 aa  239  8e-62  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.920627  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0930  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  36.41 
 
 
410 aa  236  7e-61  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1600  beta-lactamase domain-containing protein  33.64 
 
 
421 aa  231  1e-59  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0760665 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1548  beta-lactamase domain-containing protein  32.55 
 
 
425 aa  226  5.0000000000000005e-58  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.00297769  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2609  mRNA 3-end processing factor  35.78 
 
 
397 aa  224  2e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.299083 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0558  beta-lactamase domain-containing protein  32.57 
 
 
430 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00303127 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1047  beta-lactamase domain-containing protein  35.05 
 
 
426 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0197  beta-lactamase domain-containing protein  34.23 
 
 
422 aa  220  3.9999999999999997e-56  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.904798  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0626  beta-lactamase domain-containing protein  34.23 
 
 
422 aa  219  5e-56  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1292  beta-lactamase domain-containing protein  34.23 
 
 
422 aa  219  5e-56  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.358627  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1728  beta-lactamase domain-containing protein  31.6 
 
 
425 aa  219  8.999999999999998e-56  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.254192  decreased coverage  0.00045837 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1989  beta-lactamase domain-containing protein  31.05 
 
 
422 aa  214  1.9999999999999998e-54  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.881158  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1107  beta-lactamase domain-containing protein  33.26 
 
 
640 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.519523  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1749  beta-lactamase domain-containing protein  31.8 
 
 
428 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00852065 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0060  beta-lactamase domain-containing protein  33.7 
 
 
634 aa  213  7e-54  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.287706  normal  0.0538773 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0193  cleavage and polyadenylation specificity factor  35.58 
 
 
637 aa  212  1e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.209182  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1938  beta-lactamase domain protein  34.44 
 
 
821 aa  211  2e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.199019  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2254  beta-lactamase domain-containing protein  34.5 
 
 
642 aa  210  4e-53  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.311245 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0064  beta-lactamase domain-containing protein  32.97 
 
 
635 aa  209  6e-53  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1539  beta-lactamase domain-containing protein  33.01 
 
 
421 aa  209  9e-53  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000502709 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0082  beta-lactamase domain-containing protein  34.11 
 
 
635 aa  208  1e-52  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0309  beta-lactamase domain-containing protein  31.18 
 
 
639 aa  203  4e-51  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1817  KH-domain/beta-lactamase-domain protein  34.06 
 
 
635 aa  203  5e-51  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5264  beta-lactamase domain-containing protein  30.85 
 
 
830 aa  202  7e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0375  beta-lactamase-like protein  35.98 
 
 
636 aa  202  9.999999999999999e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000359908  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0030  beta-lactamase domain-containing protein  33.77 
 
 
634 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0691  beta-lactamase domain-containing protein  33.49 
 
 
421 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1572  beta-lactamase domain-containing protein  33.18 
 
 
635 aa  196  6e-49  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.342192  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0190  beta-lactamase domain-containing protein  33.41 
 
 
635 aa  196  7e-49  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1721  beta-lactamase domain-containing protein  33.41 
 
 
635 aa  196  8.000000000000001e-49  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.959276 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1727  beta-lactamase domain-containing protein  31.44 
 
 
646 aa  194  3e-48  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0637994 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0122  KH-domain/beta-lactamase-domain protein  31.89 
 
 
647 aa  192  7e-48  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0049  beta-lactamase domain-containing protein  31.64 
 
 
635 aa  192  1e-47  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0882  beta-lactamase domain-containing protein  32.71 
 
 
635 aa  191  2e-47  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.28665  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2052  beta-lactamase domain protein  32.79 
 
 
640 aa  186  7e-46  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2598  KH-domain/beta-lactamase-domain protein  31.97 
 
 
644 aa  185  1.0000000000000001e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0966  beta-lactamase domain protein  32.68 
 
 
641 aa  185  2.0000000000000003e-45  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0455  beta-lactamase domain-containing protein  33.57 
 
 
636 aa  184  3e-45  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.263173 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5141  beta-lactamase domain-containing protein  30.19 
 
 
577 aa  182  7e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.265268  normal  0.427463 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0325  KH-domain/beta-lactamase-domain protein  31.7 
 
 
644 aa  182  9.000000000000001e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.04093  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2698  beta-lactamase domain protein  32.53 
 
 
641 aa  181  2.9999999999999997e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.132267  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1199  beta-lactamase domain-containing protein  32.31 
 
 
630 aa  177  3e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0390608  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4121  beta-lactamase domain-containing protein  32.96 
 
 
457 aa  177  5e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.729695 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0845  beta-lactamase-like  32.23 
 
 
629 aa  176  6e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.554835  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0777  beta-lactamase domain protein  30.97 
 
 
630 aa  174  3.9999999999999995e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.867846  normal  0.0104567 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1014  ADP-ribosylation/crystallin J1  31.78 
 
 
636 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.5583 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2554  beta-lactamase domain protein  28.61 
 
 
667 aa  172  1e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000946841  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1385  beta-lactamase domain-containing protein  31.68 
 
 
639 aa  171  3e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.741277  normal  0.763255 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1566  beta-lactamase domain protein  30.38 
 
 
531 aa  163  4.0000000000000004e-39  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1267  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  30.3 
 
 
465 aa  162  1e-38  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2467  beta-lactamase domain-containing protein  28.77 
 
 
455 aa  161  2e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.941259  normal  0.38784 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3291  metallo-beta-lactamase family protein  28.31 
 
 
455 aa  160  5e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.119615  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0238  beta-lactamase domain protein  27.88 
 
 
468 aa  160  5e-38  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.465693 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_89936  predicted protein  27.23 
 
 
793 aa  159  7e-38  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.731556  normal  0.295472 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_28482  predicted protein  26.56 
 
 
602 aa  159  1e-37  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.962764  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3493  metallo-beta-lactamase family protein  29.52 
 
 
468 aa  158  1e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.828376  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3129  beta-lactamase domain protein  29.91 
 
 
634 aa  158  2e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.43915 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0611  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  29.1 
 
 
541 aa  158  2e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000296821  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0851  beta-lactamase domain protein  29.09 
 
 
464 aa  157  3e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0642  exonuclease  28.63 
 
 
469 aa  156  6e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000258182  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_933  metallo-beta-lactamase  29.29 
 
 
467 aa  155  1e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000465053  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_33504  predicted protein  28.54 
 
 
767 aa  155  1e-36  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.174633 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0816  beta-lactamase domain protein  28.54 
 
 
462 aa  155  2e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0473  beta-lactamase domain protein  27.54 
 
 
515 aa  155  2e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0768  beta-lactamase domain protein  28.73 
 
 
451 aa  154  2.9999999999999998e-36  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000108746  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1772  beta-lactamase domain-containing protein  27.79 
 
 
465 aa  153  5e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1144  Beta-lactamase-like:RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  29.05 
 
 
452 aa  152  1e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2692  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  29.52 
 
 
450 aa  152  1e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0719706  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1883  beta-lactamase domain protein  26.99 
 
 
456 aa  152  1e-35  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2652  beta-lactamase domain-containing protein  29.07 
 
 
453 aa  152  1e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.11992  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1417  beta-lactamase domain protein  27.98 
 
 
467 aa  151  2e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1061  metallo-beta-lactamase family protein  28.76 
 
 
468 aa  151  3e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3028  beta-lactamase domain-containing protein  26.96 
 
 
455 aa  151  3e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.745492  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1910  beta-lactamase domain protein  27.34 
 
 
652 aa  150  6e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000293974  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2360  hypothetical protein  27.62 
 
 
470 aa  149  8e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1210  beta-lactamase-like  28.25 
 
 
453 aa  149  1.0000000000000001e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.856378  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2586  beta-lactamase domain-containing protein  30.75 
 
 
465 aa  148  2.0000000000000003e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.563089  normal  0.494624 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2182  hypothetical protein  28.94 
 
 
452 aa  148  2.0000000000000003e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1456  beta-lactamase domain protein  29.32 
 
 
464 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001774  metallo-beta-lactamase family protein RNA-specific  26.33 
 
 
441 aa  148  2.0000000000000003e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.122303  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2210  hypothetical protein  28.57 
 
 
452 aa  147  3e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01524  Beta-lactamase-like:RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  29.66 
 
 
455 aa  147  5e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1382  beta-lactamase-like protein  29.79 
 
 
455 aa  147  5e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1130  metallo-beta-lactamase family protein  29.93 
 
 
452 aa  146  6e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.332296  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1830  beta-lactamase domain protein  28.22 
 
 
462 aa  146  6e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0944  beta-lactamase domain-containing protein  28.72 
 
 
468 aa  146  6e-34  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.199817  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2623  metallo-beta-lactamase family protein  28.67 
 
 
451 aa  146  7.0000000000000006e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0588  metallo-beta-lactamase superfamily protein  28.22 
 
 
464 aa  146  7.0000000000000006e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>