More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_0900 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_2871  cold-shock dead-box protein A  52.54 
 
 		 673 aa  656    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.975529  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2023  DEAD/DEAH box helicase domain protein  55.34 
 
 		 651 aa  646    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.995582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0900  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  100 
 
 		 787 aa  1585    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.00172468  normal  0.0499652 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1826  DEAD/DEAH box helicase domain protein  55.52 
 
 		 659 aa  647    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00351087 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0067  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  53.51 
 
 		 626 aa  634  1e-180  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.237297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0120  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  57.97 
 
 		 626 aa  627  1e-178  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.352683  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0124  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  57.79 
 
 		 626 aa  624  1e-177  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.232236  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0138  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  53.62 
 
 		 644 aa  618  1e-175  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.113541  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3798  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  59.16 
 
 		 593 aa  615  9.999999999999999e-175  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.172046 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2184  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  45.4 
 
 		 776 aa  612  1e-173  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.383881 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2893  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  49.27 
 
 		 764 aa  603  1.0000000000000001e-171  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0590  DEAD/DEAH box helicase-like  50.73 
 
 		 710 aa  603  1.0000000000000001e-171  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00331406 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0135  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  48.79 
 
 		 793 aa  600  1e-170  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.776582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0850  DEAD/DEAH box helicase domain protein  48.56 
 
 		 730 aa  592  1e-168  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00336665  normal  0.272992 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4366  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  52.54 
 
 		 687 aa  594  1e-168  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2584  DEAD/DEAH box helicase-like  58.32 
 
 		 590 aa  591  1e-167  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.780763  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1386  DEAD/DEAH box helicase  49.19 
 
 		 677 aa  581  1e-164  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1574  DEAD/DEAH box helicase-like  57.3 
 
 		 706 aa  582  1e-164  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.226882  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1832  DEAD/DEAH box helicase-like protein  51.42 
 
 		 610 aa  579  1e-164  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00214348  normal  0.596692 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1589  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  56.24 
 
 		 609 aa  577  1.0000000000000001e-163  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4667  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  56.05 
 
 		 545 aa  566  1e-160  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.528462  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0876  DEAD/DEAH box helicase-like  50.15 
 
 		 659 aa  565  1.0000000000000001e-159  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4525  DEAD/DEAH box helicase domain protein  49.33 
 
 		 691 aa  561  1e-158  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4919  putative DEAD-box cold-shock protein, ATP-independent RNA helicase  48.46 
 
 		 656 aa  560  1e-158  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.730754  normal  0.525378 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2928  DEAD/DEAH box helicase domain protein  56.12 
 
 		 545 aa  558  1e-157  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1119  DEAD/DEAH box helicase domain protein  55.43 
 
 		 596 aa  556  1e-157  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.538016 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1485  ATP-dependent RNA helicase  62.2 
 
 		 602 aa  553  1e-156  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.16789  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1844  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  57.63 
 
 		 574 aa  554  1e-156  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.360564  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3218  DEAD/DEAH box helicase-like  53.32 
 
 		 691 aa  553  1e-156  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0179  DEAD/DEAH box helicase  50.33 
 
 		 679 aa  546  1e-154  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.970165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3396  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  51.96 
 
 		 583 aa  538  1e-151  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.112042 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4450  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  52.89 
 
 		 568 aa  530  1e-149  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.181916 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2913  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  55.86 
 
 		 585 aa  526  1e-148  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.898805  normal  0.138469 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4914  DEAD/DEAH box helicase domain protein  52.71 
 
 		 568 aa  527  1e-148  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.67964 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0260  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  51.29 
 
 		 577 aa  523  1e-147  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4964  DEAD/DEAH box helicase domain protein  53.35 
 
 		 567 aa  517  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.323707  normal  0.0708927 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3142  DEAD/DEAH box helicase domain protein  54.89 
 
 		 565 aa  491  1e-137  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3243  DEAD/DEAH box helicase domain protein  54.89 
 
 		 565 aa  491  1e-137  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.629149  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3044  DEAD/DEAH box helicase-like  54.89 
 
 		 565 aa  489  1e-136  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0223  DEAD/DEAH box helicase domain protein  61.33 
 
 		 505 aa  482  1e-134  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.295607 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4213  DEAD/DEAH box helicase-like  60.57 
 
 		 340 aa  335  2e-90  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.985867  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0508  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36 
 
 		 558 aa  285  2.0000000000000002e-75  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000225477  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05480  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.33 
 
 		 527 aa  265  2e-69  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000471221  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3818  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.58 
 
 		 527 aa  265  3e-69  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00215503  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0250  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.93 
 
 		 643 aa  263  1e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.173354  decreased coverage  0.00154512 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2225  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.39 
 
 		 559 aa  262  2e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0636  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.7 
 
 		 571 aa  258  3e-67  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0067613  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0371  hypothetical protein  31.3 
 
 		 656 aa  258  4e-67  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2125  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.03 
 
 		 531 aa  257  5e-67  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3724  ATP-dependent RNA helicase DeaD  34.01 
 
 		 664 aa  256  9e-67  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4001  ATP-dependent RNA helicase DeaD  34.01 
 
 		 664 aa  256  1.0000000000000001e-66  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3590  ATP-dependent RNA helicase DeaD  34.01 
 
 		 664 aa  256  1.0000000000000001e-66  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0225  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.66 
 
 		 538 aa  255  2.0000000000000002e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1040  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.4 
 
 		 550 aa  254  6e-66  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0591  ATP-dependent RNA helicase DeaD  34.03 
 
 		 625 aa  254  6e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3459  ATP-dependent RNA helicase DeaD  34.15 
 
 		 624 aa  254  6e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.319039  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1921  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.27 
 
 		 532 aa  253  1e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000118371  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1816  DEAD/DEAH box helicase-like  33.14 
 
 		 531 aa  252  2e-65  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1760  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.33 
 
 		 527 aa  252  2e-65  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0202  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.66 
 
 		 590 aa  251  3e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.940477  normal  0.073291 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0814  ATP-dependent RNA helicase DeaD  33.58 
 
 		 632 aa  251  3e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0212558  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0512  ATP-dependent RNA helicase DeaD  33.05 
 
 		 637 aa  251  3e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.782929 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17560  DNA/RNA helicase, superfamily II  40.05 
 
 		 731 aa  251  4e-65  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0588083  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5063  DEAD/DEAH box helicase  35.56 
 
 		 529 aa  251  5e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0649  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.36 
 
 		 532 aa  250  6e-65  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0234  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.62 
 
 		 511 aa  250  6e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4481  ATP-dependent RNA helicase DeaD  33.9 
 
 		 629 aa  250  7e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0722  DEAD/DEAH box helicase domain protein  40.87 
 
 		 538 aa  250  7e-65  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.240435  decreased coverage  0.00164487 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1225  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.03 
 
 		 646 aa  250  7e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.115574 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03029  ATP-dependent RNA helicase  33.9 
 
 		 629 aa  250  8e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0543  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.9 
 
 		 629 aa  250  8e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14060  DNA/RNA helicase, superfamily II  34.77 
 
 		 669 aa  250  8e-65  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02980  hypothetical protein  33.9 
 
 		 629 aa  250  8e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0536  ATP-dependent RNA helicase DeaD  33.9 
 
 		 629 aa  250  8e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00419869 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3458  ATP-dependent RNA helicase DeaD  33.9 
 
 		 629 aa  250  8e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.438364 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0152  DEAD/DEAH box helicase-like  33.59 
 
 		 572 aa  250  8e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1598  ATP-dependent RNA helicase (cold-shock DEAD-box protein A)  36.57 
 
 		 580 aa  250  8e-65  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.602418 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2564  DEAD/DEAH box helicase-like protein  44.17 
 
 		 634 aa  249  9e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.347829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3599  ATP-dependent RNA helicase DeaD  40.62 
 
 		 655 aa  249  1e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00604869 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0267  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  35.32 
 
 		 525 aa  249  1e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0233  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  35.32 
 
 		 528 aa  249  1e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.714358  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0219  DEAD/DEAH box helicase  35.32 
 
 		 528 aa  249  1e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3644  ATP-dependent RNA helicase DeaD  33.9 
 
 		 651 aa  249  1e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0919  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  44.6 
 
 		 632 aa  249  1e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0247  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  35.32 
 
 		 528 aa  249  1e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3354  ATP-dependent RNA helicase DeaD  33.9 
 
 		 651 aa  249  1e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0281  ATP-dependent RNA helicase, DEAD/DEAH box family  35.32 
 
 		 525 aa  249  1e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0259  ATP-dependent RNA helicase, DEAD/DEAH box family  35.32 
 
 		 528 aa  249  1e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3609  ATP-dependent RNA helicase DeaD  33.9 
 
 		 651 aa  249  1e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0079  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.28 
 
 		 532 aa  249  1e-64  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0221  DEAD/DEAH box helicase  35.32 
 
 		 528 aa  249  2e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.983114  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0262  DEAD/DEAH box helicase  35.32 
 
 		 533 aa  249  2e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3340  ATP-dependent RNA helicase DeaD  33.27 
 
 		 621 aa  248  3e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1365  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.4 
 
 		 529 aa  248  3e-64  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1799  DEAD/DEAH box helicase-like  43.86 
 
 		 472 aa  248  3e-64  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1258  DEAD/DEAH box helicase-like protein  42.18 
 
 		 456 aa  248  3e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.410672 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3753  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.67 
 
 		 908 aa  248  3e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.237591  normal  0.30492 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0603  DEAD/DEAH box helicase-like protein  33.97 
 
 		 591 aa  248  3e-64  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.365924 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1397  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.21 
 
 		 533 aa  248  3e-64  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.796672  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3467  ATP-dependent RNA helicase DeaD  33.9 
 
 		 629 aa  248  4e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>