More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_0061 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_0061  diaminopimelate epimerase  100 
 
 
279 aa  563  1e-159  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0045  Diaminopimelate epimerase  62.14 
 
 
278 aa  339  3e-92  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1200  diaminopimelate epimerase  63.04 
 
 
287 aa  331  7e-90  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0570214  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0316  diaminopimelate epimerase  60.79 
 
 
276 aa  326  3e-88  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0237  diaminopimelate epimerase  57.35 
 
 
277 aa  322  4e-87  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.142779  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3582  diaminopimelate epimerase  55.43 
 
 
275 aa  316  3e-85  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.653633  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4308  diaminopimelate epimerase  55.07 
 
 
275 aa  314  1e-84  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0392  diaminopimelate epimerase  55.07 
 
 
275 aa  313  2e-84  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3633  diaminopimelate epimerase  55.07 
 
 
275 aa  313  2e-84  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.476258 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0495  diaminopimelate epimerase  55.43 
 
 
308 aa  311  5e-84  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0391  diaminopimelate epimerase  54.71 
 
 
275 aa  311  5e-84  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.749695 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3995  diaminopimelate epimerase  55.07 
 
 
275 aa  311  6e-84  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3973  diaminopimelate epimerase  55.07 
 
 
275 aa  311  6e-84  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3896  diaminopimelate epimerase  55.07 
 
 
275 aa  311  6e-84  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0191841 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4089  diaminopimelate epimerase  55.07 
 
 
275 aa  311  6e-84  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0401553 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0323  diaminopimelate epimerase  55.56 
 
 
279 aa  310  2e-83  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0378  diaminopimelate epimerase  55.47 
 
 
278 aa  308  6e-83  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3837  diaminopimelate epimerase  58.63 
 
 
277 aa  306  3e-82  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0489107  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0039  diaminopimelate epimerase  54.55 
 
 
292 aa  303  2e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.258665 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0196  diaminopimelate epimerase  53.76 
 
 
290 aa  302  3e-81  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.465069  hitchhiker  0.000651224 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0033  diaminopimelate epimerase  53.85 
 
 
292 aa  299  4e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2526  diaminopimelate epimerase  59.57 
 
 
288 aa  296  2e-79  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.126589 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3249  diaminopimelate epimerase  55.43 
 
 
275 aa  295  4e-79  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0192  diaminopimelate epimerase  55.76 
 
 
276 aa  295  5e-79  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3113  diaminopimelate epimerase  56.12 
 
 
277 aa  295  7e-79  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.534786  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4175  diaminopimelate epimerase  54.35 
 
 
274 aa  295  8e-79  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0210737 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5248  diaminopimelate epimerase  54.35 
 
 
274 aa  295  8e-79  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03685  diaminopimelate epimerase  54.35 
 
 
274 aa  295  8e-79  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.163573  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4170  Diaminopimelate epimerase  54.35 
 
 
274 aa  295  8e-79  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.837067  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4198  diaminopimelate epimerase  54.35 
 
 
274 aa  295  8e-79  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.180433  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4034  diaminopimelate epimerase  54.35 
 
 
274 aa  295  8e-79  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4328  diaminopimelate epimerase  54.35 
 
 
274 aa  295  8e-79  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03634  hypothetical protein  54.35 
 
 
274 aa  295  8e-79  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.191697  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2542  diaminopimelate epimerase  57.55 
 
 
277 aa  294  1e-78  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0836815  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0405  diaminopimelate epimerase  53.45 
 
 
283 aa  293  2e-78  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.759979  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3245  diaminopimelate epimerase  54.27 
 
 
296 aa  293  2e-78  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.139278  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3983  diaminopimelate epimerase  54.35 
 
 
274 aa  293  2e-78  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.983346  normal  0.2689 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4269  diaminopimelate epimerase  53.99 
 
 
274 aa  293  3e-78  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0380  diaminopimelate epimerase  53.6 
 
 
281 aa  292  4e-78  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0266  diaminopimelate epimerase  55.76 
 
 
276 aa  291  6e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4227  diaminopimelate epimerase  52.9 
 
 
274 aa  291  9e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.642483  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4275  diaminopimelate epimerase  52.9 
 
 
274 aa  291  9e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4175  diaminopimelate epimerase  52.9 
 
 
274 aa  291  9e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.132697  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4334  diaminopimelate epimerase  52.9 
 
 
274 aa  291  9e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4157  diaminopimelate epimerase  52.9 
 
 
274 aa  291  9e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0445  diaminopimelate epimerase  53.62 
 
 
275 aa  290  2e-77  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69690  diaminopimelate epimerase  55.76 
 
 
276 aa  289  4e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0119345  normal  0.292475 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6021  diaminopimelate epimerase  55.76 
 
 
276 aa  289  4e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.449975  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0153  diaminopimelate epimerase  52.28 
 
 
288 aa  288  5e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2393  diaminopimelate epimerase  52.54 
 
 
276 aa  288  5e-77  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.976013  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0232  diaminopimelate epimerase  52.54 
 
 
274 aa  288  7e-77  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.596238  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1610  diaminopimelate epimerase  51.09 
 
 
274 aa  288  8e-77  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0198  diaminopimelate epimerase  53.68 
 
 
288 aa  287  1e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00205  diaminopimelate epimerase  52.03 
 
 
269 aa  288  1e-76  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0119  diaminopimelate epimerase  54.29 
 
 
278 aa  286  3e-76  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4074  diaminopimelate epimerase  51.08 
 
 
276 aa  285  6e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0183  diaminopimelate epimerase  53.26 
 
 
274 aa  285  6e-76  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.190067  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4129  diaminopimelate epimerase  53.93 
 
 
280 aa  285  7e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.583012 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4166  diaminopimelate epimerase  52.17 
 
 
274 aa  284  1e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.078673  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3587  diaminopimelate epimerase  51.8 
 
 
276 aa  281  8e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.335636  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0182  diaminopimelate epimerase  51.45 
 
 
274 aa  281  9e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.998768  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3975  diaminopimelate epimerase  52.17 
 
 
274 aa  281  9e-75  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.525187  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1453  diaminopimelate epimerase  54.2 
 
 
286 aa  280  1e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0391  diaminopimelate epimerase  53.26 
 
 
275 aa  280  1e-74  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00309  diaminopimelate epimerase  53.62 
 
 
276 aa  280  2e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0113  diaminopimelate epimerase  51.27 
 
 
276 aa  278  5e-74  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  6.7838e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2069  diaminopimelate epimerase  51.27 
 
 
276 aa  278  5e-74  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  5.31715e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0224  diaminopimelate epimerase  53.96 
 
 
276 aa  278  5e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0487  diaminopimelate epimerase  53.24 
 
 
279 aa  278  8e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.111776  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2363  Diaminopimelate epimerase  53.68 
 
 
297 aa  277  1e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  1.54753e-05  hitchhiker  1.63815e-09 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3688  diaminopimelate epimerase  51.38 
 
 
315 aa  277  1e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.24568  normal  0.690927 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0077  diaminopimelate epimerase  49.64 
 
 
276 aa  276  2e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0137  diaminopimelate epimerase  54.2 
 
 
292 aa  277  2e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0349  diaminopimelate epimerase  53.05 
 
 
293 aa  276  2e-73  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  5.70655e-07  hitchhiker  1.27535e-05 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47710  diaminopimelate epimerase  55.76 
 
 
276 aa  276  2e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2743  diaminopimelate epimerase  53.68 
 
 
288 aa  277  2e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0353205  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2998  diaminopimelate epimerase  51.38 
 
 
292 aa  275  6e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1058  diaminopimelate epimerase  52.41 
 
 
299 aa  274  1e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.553091  normal  0.543638 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3131  diaminopimelate epimerase  50.87 
 
 
289 aa  273  2e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0076  diaminopimelate epimerase  50.35 
 
 
286 aa  273  3e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002111  diaminopimelate epimerase  52.9 
 
 
276 aa  272  4e-72  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0129  diaminopimelate epimerase  51.88 
 
 
297 aa  272  4e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0648318 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3435  diaminopimelate epimerase  52.07 
 
 
295 aa  271  7e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5228  diaminopimelate epimerase  54.32 
 
 
287 aa  271  7e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5289  diaminopimelate epimerase  53.96 
 
 
276 aa  271  1e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5499  diaminopimelate epimerase  52.88 
 
 
276 aa  270  2e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0349  diaminopimelate epimerase  49.83 
 
 
299 aa  270  3e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0200  diaminopimelate epimerase  52.33 
 
 
295 aa  269  4e-71  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000663087 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0799  diaminopimelate epimerase  50.69 
 
 
292 aa  268  7e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0220  diaminopimelate epimerase  51.97 
 
 
295 aa  268  7e-71  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0184363  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5137  diaminopimelate epimerase  53.24 
 
 
276 aa  268  9e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.91439  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3444  diaminopimelate epimerase  50.87 
 
 
291 aa  267  1e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0183  diaminopimelate epimerase  52.52 
 
 
276 aa  267  1e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3102  diaminopimelate epimerase  49.66 
 
 
309 aa  267  1e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.671935 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4373  diaminopimelate epimerase  50.17 
 
 
287 aa  268  1e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0899  diaminopimelate epimerase  49.66 
 
 
294 aa  268  1e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0244  diaminopimelate epimerase  53.24 
 
 
276 aa  268  1e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0867905  normal  0.652879 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0126  diaminopimelate epimerase  49.28 
 
 
276 aa  266  2e-70  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0205  diaminopimelate epimerase  52.17 
 
 
274 aa  266  3e-70  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.834964  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0541  diaminopimelate epimerase  52.17 
 
 
274 aa  266  3e-70  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>