More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_1358 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_1358  DNA helicase II  100 
 
 		 387 aa  810    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.248341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1482  UvrD/REP helicase  52.22 
 
 		 911 aa  435  1e-121  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0495505  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1666  UvrD/REP helicase  29.08 
 
 		 921 aa  169  9e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.921097  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2313  UvrD/REP helicase  28.99 
 
 		 984 aa  151  2e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.976943 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1443  superfamily I DNA/RNA helicase  27.69 
 
 		 920 aa  144  2e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  unclonable  0.000000114812  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0207  UvrD/REP helicase  28.29 
 
 		 970 aa  143  4e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  unclonable  0.00182272  decreased coverage  0.0000000525372 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_256  UvrD/REP helicase  29.02 
 
 		 972 aa  142  7e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.0000753871  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0930  UvrD/REP helicase  29.12 
 
 		 932 aa  133  5e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0490168  normal  0.240502 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1841  UvrD/REP helicase  24.81 
 
 		 946 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.716843  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0061  UvrD/REP helicase  24.81 
 
 		 946 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.147591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0060  UvrD/REP helicase  25.75 
 
 		 1177 aa  76.6  0.0000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.508286 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4188  UvrD/REP helicase  29.95 
 
 		 1180 aa  73.6  0.000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000134392 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0035  DNA-dependent helicase II  36.5 
 
 		 723 aa  70.9  0.00000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.193678  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1433  UvrD/REP helicase  40.94 
 
 		 788 aa  69.7  0.00000000009  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.189419 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0006  UvrD/REP helicase  26.2 
 
 		 945 aa  69.7  0.00000000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.416534  hitchhiker  0.0000067994 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0625  UvrD/REP helicase  34.27 
 
 		 1019 aa  69.3  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.243128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1715  UvrD/REP helicase  40.94 
 
 		 787 aa  69.3  0.0000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0254  UvrD/REP helicase  40 
 
 		 742 aa  67.8  0.0000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.016007  decreased coverage  0.00234339 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0982  UvrD/REP helicase  39.25 
 
 		 731 aa  67.4  0.0000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.158215  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0864  ATP-dependent DNA helicase UvrD  41.32 
 
 		 786 aa  67.4  0.0000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2813  UvrD/REP helicase  40.18 
 
 		 754 aa  67.4  0.0000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC06510  ATP-dependent DNA helicase pcra, putative  37.86 
 
 		 982 aa  66.6  0.0000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2632  DNA helicase II  41.12 
 
 		 787 aa  66.6  0.0000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0047  ATP-dependent DNA helicase Rep  42.45 
 
 		 849 aa  67  0.0000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.760315  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1461  DNA helicase II  41.12 
 
 		 787 aa  66.6  0.0000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.564541  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1474  UvrD/REP helicase  36.17 
 
 		 781 aa  66.6  0.0000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.517963 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0928  DNA helicase II  41.12 
 
 		 787 aa  66.6  0.0000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1847  DNA helicase II  41.12 
 
 		 787 aa  66.6  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.478149  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0742  DNA helicase II  41.12 
 
 		 787 aa  66.6  0.0000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1692  DNA helicase II  41.12 
 
 		 787 aa  66.6  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1670  DNA helicase II  41.12 
 
 		 787 aa  66.6  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0960  UvrD/REP helicase  42.06 
 
 		 846 aa  66.6  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0421  DNA helicase II  41.12 
 
 		 787 aa  66.6  0.0000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1696  UvrD/REP helicase  37.59 
 
 		 793 aa  66.2  0.0000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.99054 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1442  UvrD/REP helicase  42.06 
 
 		 787 aa  66.6  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0080  DNA-dependent helicase II  37.78 
 
 		 724 aa  66.2  0.0000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1337  ATP-dependent DNA helicase UvrD  41.12 
 
 		 783 aa  66.2  0.0000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3947  DNA-dependent helicase II  44.44 
 
 		 730 aa  66.2  0.0000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2797  UvrD/REP helicase  41.12 
 
 		 783 aa  66.2  0.0000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.265943  normal  0.311866 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11400  DNA/RNA helicase, superfamily I  32.43 
 
 		 710 aa  65.5  0.000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2919  UvrD/REP helicase  34.55 
 
 		 621 aa  65.9  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1017  UvrD/REP helicase  39.39 
 
 		 733 aa  65.9  0.000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1590  UvrD/REP helicase  41.12 
 
 		 790 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0547  UvrD/REP helicase  47.25 
 
 		 741 aa  66.2  0.000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1363  UvrD/REP helicase  41.12 
 
 		 787 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.485952 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0903  ATP-dependent DNA helicase PcrA  41.76 
 
 		 662 aa  65.1  0.000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000149159  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2235  DNA helicase II protein  44.44 
 
 		 829 aa  65.1  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3651  UvrD/REP helicase  36.46 
 
 		 641 aa  65.1  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00677749  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1873  UvrD/REP helicase  41.12 
 
 		 786 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.340872  normal  0.0203553 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4586  ATP-dependent DNA helicase UvrD  41.12 
 
 		 787 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.721141 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0222  DNA-dependent helicase II  38.74 
 
 		 734 aa  64.7  0.000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.211627  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1723  ATP-dependent DNA helicase UvrD  36.97 
 
 		 825 aa  65.1  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.410033 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1204  UvrD/REP helicase  40.5 
 
 		 744 aa  65.5  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.948208  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1420  UvrD/REP helicase  41.12 
 
 		 787 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0732039  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1322  UvrD/REP helicase  41.12 
 
 		 840 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00351  DNA-dependent helicase II  36.03 
 
 		 724 aa  64.3  0.000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5331  UvrD/REP helicase  37.12 
 
 		 822 aa  64.3  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2047  UvrD/REP helicase  42.42 
 
 		 786 aa  64.7  0.000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2440  UvrD/REP helicase  42.42 
 
 		 786 aa  64.7  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.605331  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00200  DNA helicase II  35.07 
 
 		 723 aa  64.3  0.000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.105669  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0782  ATP-dependent DNA helicase  40.96 
 
 		 675 aa  64.7  0.000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0209  UvrD/REP helicase  43.48 
 
 		 786 aa  64.3  0.000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000644419  normal  0.953058 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3026  ATP-dependent DNA helicase PcrA  34.15 
 
 		 829 aa  64.3  0.000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.499575  hitchhiker  0.000248027 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1066  UvrD/REP helicase  27.6 
 
 		 1048 aa  63.9  0.000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0043  DNA-dependent helicase II  44.44 
 
 		 723 aa  63.9  0.000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.779926  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0674  ATP-dependent DNA helicase PcrA  45.74 
 
 		 734 aa  64.3  0.000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002086  ATP-dependent DNA helicase UvrD/PcrA  36.03 
 
 		 724 aa  63.9  0.000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1916  ATP-dependent DNA helicase UvrD  37.82 
 
 		 818 aa  63.5  0.000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.28639  hitchhiker  0.00561083 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3035  UvrD/REP helicase  34.15 
 
 		 814 aa  63.9  0.000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0285  ATP-dependent DNA helicase PcrA  37.3 
 
 		 741 aa  63.9  0.000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2571  DNA-dependent helicase II  36.03 
 
 		 723 aa  63.9  0.000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2767  UvrD/REP helicase  38.71 
 
 		 848 aa  63.5  0.000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.053662 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03230  DNA-dependent helicase II  41.98 
 
 		 728 aa  63.2  0.000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0334  ATP-dependent DNA helicase PcrA  37.3 
 
 		 747 aa  63.2  0.000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0291  ATP-dependent DNA helicase PcrA  37.3 
 
 		 751 aa  63.2  0.000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0275  ATP-dependent DNA helicase  37.3 
 
 		 753 aa  63.5  0.000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0377  ATP-dependent DNA helicase PcrA  37.3 
 
 		 751 aa  63.2  0.000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0278  ATP-dependent DNA helicase  37.3 
 
 		 751 aa  63.2  0.000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2677  UvrD/REP helicase  37.82 
 
 		 826 aa  63.2  0.000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0740  UvrD/REP helicase  43.37 
 
 		 692 aa  63.2  0.000000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.336615  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1536  UvrD/REP helicase  35.46 
 
 		 809 aa  63.5  0.000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3324  ATP-dependent DNA helicase UvrD  37.82 
 
 		 816 aa  63.2  0.000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0235629 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0336  ATP-dependent DNA helicase PcrA  37.3 
 
 		 751 aa  63.5  0.000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0305  ATP-dependent DNA helicase PcrA  37.3 
 
 		 747 aa  63.2  0.000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0351  ATP-dependent DNA helicase PcrA  37.3 
 
 		 753 aa  63.2  0.000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4969  ATP-dependent DNA helicase PcrA  37.3 
 
 		 753 aa  63.2  0.000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0286  ATP-dependent DNA helicase PcrA  37.3 
 
 		 747 aa  63.2  0.000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2424  UvrD/REP helicase  36.45 
 
 		 725 aa  62.8  0.000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2302  UvrD/REP helicase  40.21 
 
 		 829 aa  63.2  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.556709  normal  0.916479 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2629  ATP-dependent DNA helicase UvrD  38.71 
 
 		 787 aa  62.8  0.000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0417333  normal  0.559326 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0398  UvrD/REP helicase  38.83 
 
 		 768 aa  62.8  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1496  UvrD/REP helicase  26.18 
 
 		 851 aa  62.4  0.00000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0825  ATP-dependent DNA helicase PcrA  39.45 
 
 		 694 aa  62.8  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1410  UvrD/REP helicase  35.78 
 
 		 676 aa  62.8  0.00000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0868  putative ATP-dependent DNA helicase  42.86 
 
 		 676 aa  62  0.00000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4498  DNA-dependent helicase II  38.52 
 
 		 721 aa  61.6  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0025295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0467  DNA-dependent helicase II  38.52 
 
 		 721 aa  62  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2014  ATP-dependent DNA helicase PcrA  42.7 
 
 		 729 aa  61.6  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0798  putative ATP-dependent DNA helicase  42.86 
 
 		 676 aa  62  0.00000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0426  ATP-dependent DNA helicase PcrA  46.15 
 
 		 748 aa  61.6  0.00000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>