156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1198 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_1198  proteasome endopeptidase complex  100 
 
 		 214 aa  436  1e-121  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.156853  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1384  proteasome endopeptidase complex  73.21 
 
 		 213 aa  315  5e-85  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.711715 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0778  Proteasome, beta-type subunit, conserved site  71.08 
 
 		 211 aa  306  2.0000000000000002e-82  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.24869  hitchhiker  0.00720502 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1015  hypothetical protein  68.02 
 
 		 212 aa  281  5.000000000000001e-75  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.743194 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0846  proteasome endopeptidase complex  67.19 
 
 		 209 aa  266  2e-70  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.982484  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0194  proteasome subunit beta  60.64 
 
 		 211 aa  239  2e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0374  proteasome endopeptidase complex  62.43 
 
 		 210 aa  238  5e-62  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000269819  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0083  proteasome endopeptidase complex  59.38 
 
 		 207 aa  236  3e-61  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0050  proteasome endopeptidase complex  47.67 
 
 		 217 aa  192  3e-48  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.101333  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1722  proteasome endopeptidase complex  47.87 
 
 		 219 aa  191  5e-48  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.780704 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0189  proteasome endopeptidase complex  47.87 
 
 		 219 aa  191  5e-48  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0881  proteasome subunit beta  51.05 
 
 		 219 aa  189  2e-47  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.296506  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1573  proteasome endopeptidase complex  50.79 
 
 		 219 aa  188  4e-47  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.210251  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0123  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  51.72 
 
 		 210 aa  182  3e-45  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0608  20S proteasome A and B subunits  48.96 
 
 		 243 aa  171  7.999999999999999e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.109869  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1825  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  43.65 
 
 		 225 aa  160  1e-38  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1728  proteasome endopeptidase complex  40.72 
 
 		 210 aa  159  2e-38  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0560482 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2052  proteasome endopeptidase complex  45.64 
 
 		 217 aa  159  3e-38  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0307  proteasome endopeptidase complex  46.63 
 
 		 200 aa  153  2e-36  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0694  proteasome endopeptidase complex  41.45 
 
 		 198 aa  149  3e-35  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0392  proteasome endopeptidase complex  41.18 
 
 		 204 aa  144  9e-34  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0021  proteasome endopeptidase complex  43.72 
 
 		 201 aa  138  4.999999999999999e-32  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1097  proteasome endopeptidase complex  43.55 
 
 		 200 aa  138  7e-32  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.186534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1307  proteasome endopeptidase complex  39.58 
 
 		 200 aa  137  7.999999999999999e-32  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.644154  normal  0.454168 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0052  proteasome endopeptidase complex  44.81 
 
 		 201 aa  137  1e-31  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0529482 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_20007  predicted protein  38.58 
 
 		 283 aa  135  4e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0055  proteasome endopeptidase complex  42.62 
 
 		 202 aa  135  5e-31  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.671684  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2272  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  40.68 
 
 		 237 aa  134  9e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3351  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  40 
 
 		 243 aa  133  1.9999999999999998e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.496594  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1568  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  40 
 
 		 243 aa  131  9e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1254  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  40.33 
 
 		 196 aa  130  1.0000000000000001e-29  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.264606  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2008  proteasome endopeptidase complex  35.5 
 
 		 203 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.177612 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2664  Proteasome endopeptidase complex  38.76 
 
 		 234 aa  126  2.0000000000000002e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0458  proteasome endopeptidase complex  41.57 
 
 		 206 aa  124  1e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.180759 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_36375  predicted protein  34.85 
 
 		 282 aa  122  3e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF02080  proteasome component pts1, putative  35.08 
 
 		 301 aa  121  7e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0916  proteasome endopeptidase complex  35.48 
 
 		 203 aa  121  9e-27  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.840423  normal  0.0288115 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03932  proteasome component Pre2, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G08310)  33.65 
 
 		 296 aa  119  3e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27330  predicted protein  36.9 
 
 		 297 aa  119  3.9999999999999996e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00217957  normal  0.014135 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0018  Proteasome endopeptidase complex  41.95 
 
 		 237 aa  118  7.999999999999999e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.815812  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0754  proteasome endopeptidase complex  34.02 
 
 		 203 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.662481 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2211  proteasome endopeptidase complex  33.51 
 
 		 203 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.208664  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0514  20S proteasome A and B subunits  38.97 
 
 		 250 aa  113  2.0000000000000002e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_5128  predicted protein  38.46 
 
 		 197 aa  113  2.0000000000000002e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.199024  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2268  proteasome endopeptidase complex  34.43 
 
 		 196 aa  112  6e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02085  proteasome component Pup1, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G04910)  34.41 
 
 		 272 aa  102  5e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.217986  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC03530  proteasome subunit, beta type, 7, putative  34.36 
 
 		 303 aa  99.4  4e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1790  proteasome subunit beta  34.25 
 
 		 282 aa  98.2  8e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.568871  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2426  20S proteasome A and B subunits  34.67 
 
 		 288 aa  97.4  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0167637  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2627  proteasome subunit beta  31.92 
 
 		 304 aa  97.1  2e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.167661 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1188  proteasome subunit beta  33.51 
 
 		 290 aa  93.6  2e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.846216  normal  1 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_5311  predicted protein  34.59 
 
 		 201 aa  93.6  2e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00710268  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4879  20S proteasome A and B subunits  34.64 
 
 		 274 aa  92  5e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.199317 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0910  20S proteasome A and B subunits  34.24 
 
 		 273 aa  92  6e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.135813  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2311  20S proteasome A and B subunits  32.97 
 
 		 284 aa  90.9  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000180719  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2001  20S proteasome A and B subunits  35.59 
 
 		 276 aa  91.3  1e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.407816  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB03070  hypothetical protein  29.47 
 
 		 213 aa  90.5  2e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0444499  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20870  proteasome endopeptidase complex, beta component  35.2 
 
 		 285 aa  90.1  2e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1873  20S proteasome A and B subunits  36.72 
 
 		 302 aa  90.1  2e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.801256 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1495  20S proteasome A and B subunits  32.49 
 
 		 280 aa  89  5e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0147086 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1919  20S proteasome A and B subunits  32.61 
 
 		 273 aa  86.7  2e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000109069 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_65073  20S proteasome, regulatory subunit beta type PSMB7/PSMB10/PUP1  31.28 
 
 		 267 aa  85.1  8e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.197238 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03756  putative proteasome core beta subunit (Eurofung)  26.9 
 
 		 233 aa  84.7  9e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.866002 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2244  20S proteasome, A and B subunits  34.25 
 
 		 324 aa  84.7  9e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.375012  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2645  proteasome subunit beta  33.89 
 
 		 283 aa  84.7  0.000000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2159  20S proteasome A and B subunits  29.36 
 
 		 273 aa  84.3  0.000000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4461  20S proteasome A and B subunits  31.69 
 
 		 279 aa  84  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.298053  normal  0.126997 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3130  proteasome subunit beta  33.18 
 
 		 304 aa  83.2  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3191  proteasome subunit beta  33.18 
 
 		 304 aa  83.2  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.166463  normal  0.0826974 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3141  proteasome subunit beta  33.18 
 
 		 304 aa  83.2  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.738007  normal  0.734291 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1488  20S proteasome A and B subunits  35.71 
 
 		 270 aa  84  0.000000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2442  20S proteasome A and B subunits  33.14 
 
 		 280 aa  82.8  0.000000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000142562  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_51691  proteasome beta subunit  27.72 
 
 		 225 aa  81.3  0.00000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2361  20S proteasome A and B subunits  33.72 
 
 		 279 aa  81.3  0.00000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0162357 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2176  proteasome subunit beta  34.41 
 
 		 275 aa  80.1  0.00000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00215811  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2682  20S proteasome A and B subunits  34.43 
 
 		 280 aa  79.7  0.00000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.479175  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2463  20S proteasome A and B subunits  33.16 
 
 		 292 aa  79  0.00000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0388178  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0181  proteasome subunit alpha  28.87 
 
 		 271 aa  79  0.00000000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62487  predicted protein  22.68 
 
 		 206 aa  78.6  0.00000000000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.838538  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2969  20S proteasome A and B subunits  31.91 
 
 		 288 aa  77.4  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000842797  normal  0.0126547 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33268  predicted protein  25.13 
 
 		 227 aa  77.4  0.0000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.994073 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2238  20S proteasome A and B subunits  31.48 
 
 		 272 aa  77  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0784467  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39963  predicted protein  25.27 
 
 		 206 aa  76.3  0.0000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05784  putative proteasome core component, beta 6 subunit (Eurofung)  29.03 
 
 		 261 aa  75.5  0.0000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.109693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41720  predicted protein  28.14 
 
 		 217 aa  75.5  0.0000000000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.484147  normal  0.352684 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_30003  predicted protein  30.07 
 
 		 204 aa  75.5  0.0000000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.537126  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3077  20S proteasome, A and B subunits  33.65 
 
 		 303 aa  75.1  0.0000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.137735 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1822  proteasome subunit alpha  29.89 
 
 		 240 aa  74.3  0.000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04449  proteasome component Pup3, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G07420)  23.78 
 
 		 192 aa  73.6  0.000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1264  proteasome subunit alpha  30.41 
 
 		 259 aa  72.8  0.000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_6151  predicted protein  27.96 
 
 		 187 aa  73.2  0.000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.276783  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1204  20S proteasome A and B subunits  27.81 
 
 		 302 aa  72.4  0.000000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.101422  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1832  proteasome endopeptidase complex  29.24 
 
 		 278 aa  72  0.000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2503  proteasome subunit alpha  29.52 
 
 		 249 aa  72  0.000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0386986  normal  0.970556 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2241  20S proteasome A and B subunits  33.67 
 
 		 282 aa  71.2  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0213525  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0019  proteasome subunit alpha  26.8 
 
 		 247 aa  71.2  0.00000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1422  proteasome subunit alpha  30.41 
 
 		 259 aa  71.2  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.186141  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1253  proteasome subunit alpha  30.41 
 
 		 259 aa  71.2  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0702  proteasome subunit alpha  30.41 
 
 		 259 aa  70.9  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.959653  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5871  20S proteasome alpha and beta subunits-like protein  27.52 
 
 		 282 aa  70.5  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.609648 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>