More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_0091 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_0091  response regulator receiver protein  100 
 
 		 124 aa  247  3e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.589534  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0073  response regulator receiver protein  67.48 
 
 		 128 aa  164  5e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7092  response regulator receiver protein  57.39 
 
 		 196 aa  122  1e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.08524  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6212  response regulator receiver protein  54.62 
 
 		 177 aa  122  2e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0392664  normal  0.598992 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5535  response regulator receiver protein  57.26 
 
 		 130 aa  120  9e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.591914  decreased coverage  0.00892468 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1503  response regulator receiver protein  57.72 
 
 		 130 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.156189  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2557  response regulator receiver  50.43 
 
 		 194 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2780  response regulator receiver protein  49.57 
 
 		 173 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2488  response regulator receiver protein  47.93 
 
 		 173 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.365206  normal  0.13004 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7165  response regulator receiver protein  48.25 
 
 		 143 aa  107  5e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.272897  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6328  response regulator receiver protein  46.49 
 
 		 141 aa  104  5e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00633094 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0675  response regulator receiver protein  55.17 
 
 		 129 aa  104  5e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.410105  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5605  response regulator receiver protein  50 
 
 		 198 aa  102  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.469743  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4072  response regulator receiver protein  47.37 
 
 		 129 aa  100  6e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3778  response regulator receiver  47.37 
 
 		 129 aa  100  6e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0998176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2732  response regulator receiver protein  45.61 
 
 		 151 aa  98.6  3e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.169998 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5091  response regulator receiver protein  42.98 
 
 		 134 aa  95.9  1e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.947919  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4573  response regulator receiver  42.98 
 
 		 134 aa  94.7  3e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.546072 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5033  response regulator receiver protein  42.98 
 
 		 134 aa  94.7  3e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.649741  normal  0.0493927 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4034  response regulator receiver protein  44.74 
 
 		 129 aa  94.4  5e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.526175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6418  response regulator receiver protein  37.5 
 
 		 126 aa  80.1  0.000000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4480  response regulator receiver protein  41.07 
 
 		 128 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.361856  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4112  response regulator receiver  41.07 
 
 		 128 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.576276  normal  0.834365 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4593  response regulator receiver protein  38.39 
 
 		 129 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6764  putative two-component response regulator  41.82 
 
 		 134 aa  74.7  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.252754  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4041  response regulator receiver domain-containing protein  34.58 
 
 		 124 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0979956  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0095  response regulator receiver protein  40 
 
 		 123 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.898425  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1668  response regulator receiver protein  35.92 
 
 		 131 aa  73.2  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0850  response regulator receiver protein  39.29 
 
 		 131 aa  72  0.000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.886181 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3796  response regulator receiver  35.92 
 
 		 124 aa  71.2  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.787937 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4814  response regulator receiver protein  38.66 
 
 		 127 aa  71.2  0.000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.24379  normal  0.163877 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4665  response regulator receiver protein  37.82 
 
 		 127 aa  71.2  0.000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.191751 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1475  response regulator receiver protein  35.92 
 
 		 124 aa  70.9  0.000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.292646  normal  0.101486 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5790  response regulator receiver protein  36.89 
 
 		 122 aa  70.5  0.000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0889979  normal  0.112489 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2634  response regulator receiver protein  37.84 
 
 		 135 aa  69.3  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.873964  normal  0.0480327 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3363  response regulator receiver  31.58 
 
 		 126 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4296  response regulator receiver  36.75 
 
 		 115 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1228  response regulator receiver domain-containing protein  34.95 
 
 		 124 aa  68.2  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000969205 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4811  response regulator receiver protein  37.61 
 
 		 140 aa  67.4  0.00000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4398  response regulator receiver protein  33.96 
 
 		 127 aa  67  0.00000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.481257  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1895  response regulator receiver  33.33 
 
 		 126 aa  67  0.00000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.208302  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3741  response regulator receiver protein  32.74 
 
 		 127 aa  66.2  0.0000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4537  response regulator receiver protein  36.75 
 
 		 125 aa  65.5  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3529  response regulator receiver domain-containing protein  33.01 
 
 		 137 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.440569  normal  0.421617 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2945  response regulator receiver domain-containing protein  32.41 
 
 		 124 aa  65.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.161273  normal  0.393497 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0516  response regulator receiver protein  37 
 
 		 124 aa  65.5  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.131947  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4214  response regulator receiver protein  33.91 
 
 		 130 aa  65.5  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.843954  normal  0.213428 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5228  response regulator receiver protein  33.98 
 
 		 135 aa  65.1  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0214459  normal  0.509013 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5645  response regulator receiver protein  29.36 
 
 		 182 aa  64.7  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.633042  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3039  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.31 
 
 		 1067 aa  64.3  0.0000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.635771  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3211  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.23 
 
 		 696 aa  64.3  0.0000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.7085  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6442  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.76 
 
 		 688 aa  63.9  0.0000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.381857  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1290  histidine kinase  37.5 
 
 		 573 aa  62.8  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.163396  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1195  Two component sensor kinase/response regulator hybrid protein  30.97 
 
 		 130 aa  62.8  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0497  response regulator receiver domain-containing protein  32.43 
 
 		 125 aa  62.4  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0614776  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9028  two component sensor kinase/response regulator hybrid  27.83 
 
 		 123 aa  62.4  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1201  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.54 
 
 		 548 aa  61.2  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.642458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2510  response regulator receiver  32.41 
 
 		 124 aa  61.2  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.294916 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1882  response regulator receiver  38.55 
 
 		 108 aa  61.2  0.000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2569  response regulator receiver protein  37.8 
 
 		 132 aa  60.5  0.000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.929319 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6937  response regulator receiver protein  36.9 
 
 		 133 aa  60.1  0.000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0671376  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0226  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.7 
 
 		 1018 aa  59.7  0.00000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2670  response regulator receiver protein  31.37 
 
 		 122 aa  59.3  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.313891  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1658  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.61 
 
 		 1036 aa  58.9  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.705021 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4134  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.45 
 
 		 711 aa  58.9  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.734876  normal  0.920735 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4740  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 126 aa  58.9  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0771  response regulator receiver protein  30.56 
 
 		 130 aa  59.3  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2794  response regulator receiver protein  34.58 
 
 		 125 aa  58.5  0.00000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0691  response regulator receiver protein  34.95 
 
 		 128 aa  58.2  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.852187  normal  0.378672 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1276  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.66 
 
 		 642 aa  58.2  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2499  response regulator receiver protein  37.86 
 
 		 136 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.353166  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2931  response regulator receiver protein  32.35 
 
 		 122 aa  58.5  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.139057  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3014  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.23 
 
 		 1132 aa  58.2  0.00000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.829917  hitchhiker  0.00701741 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4456  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.08 
 
 		 1415 aa  58.2  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3507  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.48 
 
 		 662 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0096  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.77 
 
 		 741 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.770159  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1889  ATPase domain-containing protein  33.64 
 
 		 280 aa  57.4  0.00000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.508337  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1555  sensory box histidine kinase/response regulator  35.58 
 
 		 1112 aa  57  0.00000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3600  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  33.93 
 
 		 766 aa  57  0.00000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.35244  normal  0.024803 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3150  response regulator receiver  35.19 
 
 		 128 aa  57  0.00000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3474  response regulator receiver protein  35.19 
 
 		 128 aa  57  0.00000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.212338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0029  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.06 
 
 		 732 aa  57  0.00000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.598305 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2252  GAF sensor hybrid histidine kinase  34.82 
 
 		 732 aa  57  0.00000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.535804  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0328  response regulator receiver  27.36 
 
 		 147 aa  56.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0634669  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0171  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.73 
 
 		 740 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2373  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.98 
 
 		 769 aa  56.2  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1525  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.51 
 
 		 872 aa  56.6  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.40409  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2165  response regulator  34.86 
 
 		 393 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0249002  normal  0.813701 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3996  PAS  35 
 
 		 796 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.447634  normal  0.187563 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3346  response regulator receiver protein  34.26 
 
 		 128 aa  55.5  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4405  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.04 
 
 		 880 aa  55.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0198095  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2632  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.58 
 
 		 906 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0517  histidine kinase  38.64 
 
 		 726 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.978002  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2554  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.53 
 
 		 551 aa  55.8  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.344016  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1682  response regulator receiver modulated serine phosphatase  34.86 
 
 		 412 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1672  PAS sensor protein  30.7 
 
 		 695 aa  55.5  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.487392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2576  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.58 
 
 		 840 aa  55.8  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0149194 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3021  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.36 
 
 		 812 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.510865  normal  0.160517 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2825  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.58 
 
 		 903 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.198382 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3577  response regulator receiver protein  34.86 
 
 		 393 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00266085  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>