More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_0037 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_0037  electron transport protein SCO1/SenC  100 
 
 		 214 aa  414  9.999999999999999e-116  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0273218  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1393  electron transport protein SCO1/SenC  69.36 
 
 		 210 aa  236  1e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.210991  normal  0.211501 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2862  electron transport protein SCO1/SenC  44.37 
 
 		 197 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.810748  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0997  electron transport protein SCO1/SenC  41.45 
 
 		 199 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.995366  normal  0.775153 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0144  electron transport protein SCO1/SenC  37 
 
 		 197 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.962644  normal  0.838775 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4131  electron transport protein SCO1/SenC  46.43 
 
 		 197 aa  126  3e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.229515  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0721  electron transport protein SCO1/SenC  40.79 
 
 		 196 aa  125  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.288054 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3419  electron transport protein SCO1/SenC  40.98 
 
 		 196 aa  125  6e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3224  electron transport protein SCO1/SenC  45.45 
 
 		 226 aa  125  6e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.533734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3205  electron transport protein SCO1/SenC  46.38 
 
 		 206 aa  124  1e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1992  electron transport protein SCO1/SenC  37.91 
 
 		 220 aa  123  2e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3662  electron transport protein SCO1/SenC  41.72 
 
 		 209 aa  122  3e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.392982  normal  0.146749 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3548  electron transport protein SCO1/SenC  46.32 
 
 		 200 aa  122  3e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.230336  normal  0.675478 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0210  electron transport protein SCO1/SenC  39.38 
 
 		 197 aa  122  3e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0885  electron transport protein SCO1/SenC  39.22 
 
 		 199 aa  121  8e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2379  electron transport protein SCO1/SenC  40.88 
 
 		 204 aa  121  9.999999999999999e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.778887  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3768  electron transport protein SCO1/SenC  45.07 
 
 		 197 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.197212  normal  0.330218 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5169  electron transport protein SCO1/SenC  39.87 
 
 		 199 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0787  putative electron transport protein  38.82 
 
 		 197 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00305145 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1375  electron transport protein SCO1/SenC  44.53 
 
 		 211 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.101668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2053  electron transport protein SCO1/SenC  36.27 
 
 		 199 aa  118  7.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.160668 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1380  electron transport protein SCO1/SenC  43.07 
 
 		 215 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.019613  hitchhiker  0.0000640851 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2426  electron transport protein SCO1/SenC  43.12 
 
 		 221 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0897177  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1655  electron transport protein SCO1/SenC  43.07 
 
 		 215 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.270396  normal  0.565146 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4631  electron transport protein SCO1/SenC  39.51 
 
 		 193 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.154208 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2858  cytochrome c oxidase assembly factor transmembrane protein  35.35 
 
 		 199 aa  113  2.0000000000000002e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2574  electron transport protein SCO1/SenC  38.61 
 
 		 200 aa  113  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.125643  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1416  SCO1/SenC family protein  35.22 
 
 		 196 aa  110  1.0000000000000001e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.974158  n/a   
 
 
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NC_009505  BOV_1372  SCO1/SenC family protein  35.22 
 
 		 196 aa  110  1.0000000000000001e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2835  electron transport protein SCO1/SenC  37.34 
 
 		 200 aa  109  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.954587  normal  0.0193725 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4443  electron transport protein SCO1/SenC  36.11 
 
 		 210 aa  108  5e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00591291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1760  electron transport protein SCO1/SenC  34.39 
 
 		 196 aa  105  4e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2475  electron transport protein SCO1/SenC  38.64 
 
 		 208 aa  105  6e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4161  electron transport protein SCO1/SenC  38.29 
 
 		 205 aa  102  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.992536 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3956  electron transport protein SCO1/SenC  36.67 
 
 		 208 aa  101  7e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0454728  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3618  electron transport protein SCO1/SenC  36.67 
 
 		 208 aa  101  7e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0565663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3429  electron transport protein SCO1/SenC  36.77 
 
 		 201 aa  101  7e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.042976  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0628  electron transport protein SCO1/SenC  36.57 
 
 		 191 aa  101  9e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000013207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6166  electron transport protein SCO1/SenC  40.43 
 
 		 205 aa  100  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.527334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0934  SCO1/SenC family protein  36.13 
 
 		 192 aa  100  2e-20  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.140398  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7627  electron transport protein  29.82 
 
 		 219 aa  99.8  3e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.160482  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0555  electron transport protein SCO1/SenC  37.71 
 
 		 205 aa  99.8  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0945335  normal  0.591506 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2836  electron transport protein SCO1/SenC  39.72 
 
 		 205 aa  99.4  4e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2223  electron transport protein SCO1/SenC  39.72 
 
 		 205 aa  99.4  4e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2893  electron transport protein SCO1/SenC  39.72 
 
 		 205 aa  99  5e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.945666  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5935  electron transport protein SCO1/SenC  34.67 
 
 		 215 aa  98.2  9e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0514  electron transport protein SCO1/SenC  36.15 
 
 		 219 aa  97.8  1e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0467  electron transport protein SCO1/SenC  39.44 
 
 		 205 aa  97.4  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3187  SCO1/SenC family protein  40.71 
 
 		 181 aa  97.4  1e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1433  SCO1/SenC family protein  40.71 
 
 		 205 aa  97.8  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0518  SCO1/SenC family protein  40.71 
 
 		 205 aa  97.8  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.83409  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0683  SCO1/SenC family protein  40.71 
 
 		 181 aa  97.4  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.744521  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0159  SCO1/SenC family protein  40.71 
 
 		 205 aa  97.8  1e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.477348  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2847  electron transport protein SCO1/SenC  39.72 
 
 		 191 aa  97.8  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.287465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2860  SCO1/SenC family protein  40.71 
 
 		 205 aa  97.8  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0500  SCO1/SenC family protein  40.71 
 
 		 205 aa  97.8  1e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3423  electron transport protein SCO1/SenC  37.21 
 
 		 198 aa  97.8  1e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.118762 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2382  electron transport protein SCO1/SenC  33.13 
 
 		 205 aa  96.7  2e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2753  electron transport protein SCO1/SenC  36.52 
 
 		 205 aa  96.7  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.453026  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0271  electron transport protein SCO1/SenC  36.81 
 
 		 204 aa  96.7  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.777659 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0287  electron transport protein SCO1/SenC  37.42 
 
 		 205 aa  96.3  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0045  GGDEF  30.54 
 
 		 219 aa  95.5  6e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.986314 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1892  electron transport protein SCO1/SenC  41.01 
 
 		 202 aa  95.1  7e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0436  SCO1/SenC family protein  39.72 
 
 		 181 aa  94.7  8e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.465063  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0888  electron transport protein SCO1/SenC  34.5 
 
 		 210 aa  94  1e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.147718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3622  electron transport protein SCO1/SenC  37.78 
 
 		 200 aa  93.6  2e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.847452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0324  electron transport protein SCO1/SenC  36.17 
 
 		 231 aa  94  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3960  electron transport protein SCO1/SenC  37.78 
 
 		 200 aa  93.6  2e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.105512  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2208  electron transport protein SCO1/SenC  38.56 
 
 		 201 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1930  electron transport protein SCO1/SenC  34.15 
 
 		 196 aa  93.6  2e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2688  electron transport protein SCO1/SenC  35.19 
 
 		 211 aa  92.8  3e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3360  electron transport protein SCO1/SenC  32.8 
 
 		 210 aa  92.4  4e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1063  electron transport protein SCO1/SenC  40.6 
 
 		 198 aa  92.8  4e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0524387 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2608  Sco1/SenC family protein  39.57 
 
 		 201 aa  92  6e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00462141  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2285  twin-arginine translocation pathway signal  38.46 
 
 		 201 aa  92  6e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.14309  hitchhiker  0.000889852 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1061  electron transport protein SCO1/SenC  39.23 
 
 		 201 aa  91.7  7e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.099105  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0865  electron transport protein SCO1/SenC  35.88 
 
 		 207 aa  91.7  8e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2683  electron transport protein SCO1/SenC  32.45 
 
 		 219 aa  90.5  2e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0135  electron transport protein SCO1/SenC  30.52 
 
 		 197 aa  90.1  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2379  electron transport protein SCO1/SenC  38.41 
 
 		 223 aa  89.7  3e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.229264  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1986  electron transport protein SCO1/SenC  40.29 
 
 		 202 aa  89.4  3e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.963654 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2499  electron transport protein SCO1/SenC  41.14 
 
 		 246 aa  89.7  3e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.570283  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1255  electron transport protein SCO1/SenC  38.24 
 
 		 209 aa  89.4  3e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3316  electron transport protein SCO1/SenC  38.41 
 
 		 223 aa  89.7  3e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.189227 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0373  lipoprotein  36.88 
 
 		 200 aa  89.4  4e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2400  electron transport protein SCO1/SenC  32.07 
 
 		 211 aa  89.4  4e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0014  Classical-complement-pathway C3/C5 convertase  35.66 
 
 		 203 aa  89.4  4e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.143116  hitchhiker  0.00194121 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1635  electron transport protein SCO1/SenC  32.93 
 
 		 194 aa  89.4  4e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.132888  normal  0.682458 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3172  putative lipoprotein  37.72 
 
 		 198 aa  89  4e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0416881  normal  0.34002 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2851  SCO1/SenC family protein  38.71 
 
 		 188 aa  89  5e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000861503  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04004  uncharacterized secreted protein of SCO1/SenC/PrrC family  32.97 
 
 		 214 aa  89  5e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3492  electron transport protein SCO1/SenC  36.43 
 
 		 211 aa  88.6  6e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.1904 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3279  electron transport protein SCO1/SenC  34.78 
 
 		 211 aa  88.6  6e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.508145  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0248  electron transport protein SCO1/SenC  36.17 
 
 		 203 aa  88.6  7e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0520152 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2912  electron transport protein SCO1/SenC  37.4 
 
 		 197 aa  88.2  8e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0229  electron transport protein SCO1/SenC  36.17 
 
 		 203 aa  88.2  8e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009456  VC0395_0096  SCO1/SenC family protein  36.89 
 
 		 193 aa  88.2  9e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000173101  n/a   
 
 
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NC_002978  WD0109  SCO1/SenC family protein  32.28 
 
 		 202 aa  88.2  9e-17  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.614112  n/a   
 
 
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NC_009484  Acry_0600  electron transport protein SCO1/SenC  36.48 
 
 		 184 aa  87.4  1e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008786  Veis_1389  electron transport protein SCO1/SenC  37.5 
 
 		 206 aa  87.4  1e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.324761  normal  1 
 
 
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